RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595343.5

PDE4C-208, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4C, Length 420 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-208ENST00000595343 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.74■■□□□ 1.87
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PDE4C-208ENST00000595343 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
PDE4C-208ENST00000595343 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.72■■□□□ 1.87
PDE4C-208ENST00000595343 KCNQ2O43526 872 aa26.72■■□□□ 1.87
PDE4C-208ENST00000595343 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.72■■□□□ 1.87
PDE4C-208ENST00000595343 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.72■■□□□ 1.87
PDE4C-208ENST00000595343 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
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PDE4C-208ENST00000595343 ZNF827Q17R98 1081 aa26.34■■□□□ 1.81
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PDE4C-208ENST00000595343 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
PDE4C-208ENST00000595343 QSER1Q2KHR3 1735 aa26.2■■□□□ 1.79
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