RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592582.5

SEH1L-210, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 4,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-210ENST00000592582 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SEH1L-210ENST00000592582 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa7.49□□□□□ -1.21
SEH1L-210ENST00000592582 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa7.49□□□□□ -1.21
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF521Q96K83 1311 aa7.49□□□□□ -1.21
SEH1L-210ENST00000592582 APBB1O00213 710 aa7.49□□□□□ -1.21
SEH1L-210ENST00000592582 POGKQ9P215 609 aa7.49□□□□□ -1.21
SEH1L-210ENST00000592582 C3P01024 1663 aa7.49□□□□□ -1.21
SEH1L-210ENST00000592582 TULP4Q9NRJ4 1543 aa7.49□□□□□ -1.21
SEH1L-210ENST00000592582 AAMPQ13685 434 aa7.48□□□□□ -1.21
SEH1L-210ENST00000592582 TERF2IPQ9NYB0 399 aa7.48□□□□□ -1.21
SEH1L-210ENST00000592582 HDGFP51858 240 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
SEH1L-210ENST00000592582 CDCA7LQ96GN5 454 aa7.48□□□□□ -1.21
SEH1L-210ENST00000592582 NLRP1Q9C000 1473 aa7.48□□□□□ -1.21
SEH1L-210ENST00000592582 SMYD5Q6GMV2 418 aa7.48□□□□□ -1.21
SEH1L-210ENST00000592582 FGD1P98174 961 aa7.47□□□□□ -1.21
SEH1L-210ENST00000592582 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
SEH1L-210ENST00000592582 CRBNQ96SW2 442 aa7.47□□□□□ -1.21
SEH1L-210ENST00000592582 FAM13BQ9NYF5 915 aa7.47□□□□□ -1.21
SEH1L-210ENST00000592582 NINLQ9Y2I6 1382 aa7.47□□□□□ -1.21
SEH1L-210ENST00000592582 APAF1O14727 1248 aa7.47□□□□□ -1.21
SEH1L-210ENST00000592582 RUNDC1Q96C34 613 aa7.47□□□□□ -1.21
SEH1L-210ENST00000592582 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
SEH1L-210ENST00000592582 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
SEH1L-210ENST00000592582 GBP4Q96PP9 640 aa7.47□□□□□ -1.21
SEH1L-210ENST00000592582 NSD2O96028 1365 aa7.47□□□□□ -1.21
SEH1L-210ENST00000592582 SLFN5Q08AF3 891 aa7.46□□□□□ -1.21
SEH1L-210ENST00000592582 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa7.46□□□□□ -1.21
SEH1L-210ENST00000592582 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa7.46□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC146Q8IYE0 955 aa7.46□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa7.45□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 NUTM2FA1L443 756 aa7.45□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 CHMP5Q9NZZ3 219 aa7.45□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 LRRC37A3O60309 1634 aa7.45□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 PSEN1P49768 467 aa7.45□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 FMN2Q9NZ56 1722 aa7.44□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP7.44□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 GRPEL1Q9HAV7 217 aa7.44□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 CPS1P31327 1500 aa7.44□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 PLIN1O60240 522 aa7.44□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 GPIHBP1Q8IV16 184 aa7.44□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 HSCBQ8IWL3 235 aa7.44□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.44□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 NSD3Q9BZ95 1437 aa7.44□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 TRAK2O60296 914 aa7.44□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 PDE3AQ14432 1141 aa7.44□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 DUSP27Q5VZP5 1158 aa7.44□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 WDR63Q8IWG1 891 aa7.44□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 RAPGEF3O95398 923 aa7.43□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP7.43□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 PHF8Q9UPP1 1060 aa7.43□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 ZMYM3Q14202 1370 aa7.43□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 TMEM132EQ6IEE7 984 aa7.43□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 STK26Q9P289 416 aa7.43□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 UBR1Q8IWV7 1749 aa7.43□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 PTPRMP28827 1452 aa7.43□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 CD163L1Q9NR16 1453 aa7.43□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC173Q0VFZ6 552 aa7.43□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 EFCAB3Q8N7B9 438 aa7.43□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa7.43□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa7.43□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 DLG5Q8TDM6 1919 aa7.43□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 NPATQ14207 1427 aa7.43□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 ITSN1Q15811 1721 aa7.43□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 PPP1R37O75864 691 aa7.42□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 MCM4P33991 863 aa7.42□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 TERF1P54274 439 aa7.42□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 TAF3Q5VWG9 929 aa7.42□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP7.42□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 DIP2AQ14689 1571 aa7.42□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 MTHFSP49914 203 aa7.41□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 ZSCAN30Q86W11 494 aa7.41□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 GRXCR2A6NFK2 248 aa7.41□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.41□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa7.41□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 PTMAP06454 111 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 FAM69CQ0P6D2 419 aa7.41□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 IDI1Q13907 227 aa7.41□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 CYB5RLQ6IPT4 315 aa7.41□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 CARD14Q9BXL6 1004 aa7.41□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 TCP11L2Q8N4U5 519 aa7.4□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SEH1L-210ENST00000592582 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms