RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589627.1

VASP-208, Transcript of vasodilator stimulated phosphoprotein, human

TSL 3

Gene VASP, Length 696 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VASP-208	ENST00000589627	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		33.54	■■■□□ 2.96
VASP-208	ENST00000589627	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	33.53	■■■□□ 2.96
VASP-208	ENST00000589627	SBF2	Q86WG5	1849 aa		33.52	■■■□□ 2.96
VASP-208	ENST00000589627	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		33.52	■■■□□ 2.96
VASP-208	ENST00000589627	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		33.51	■■■□□ 2.95
VASP-208	ENST00000589627	RREB1	Q92766	1687 aa		33.51	■■■□□ 2.95
VASP-208	ENST00000589627		A0A1W2PP64	1363 aa		33.5	■■■□□ 2.95
VASP-208	ENST00000589627	PDE3B	Q13370	1112 aa		33.5	■■■□□ 2.95
VASP-208	ENST00000589627	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		33.49	■■■□□ 2.95
VASP-208	ENST00000589627	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	33.49	■■■□□ 2.95
VASP-208	ENST00000589627	TMC1	Q8TDI8	760 aa		33.49	■■■□□ 2.95
VASP-208	ENST00000589627	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	33.48	■■■□□ 2.95
VASP-208	ENST00000589627	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		33.47	■■■□□ 2.95
VASP-208	ENST00000589627	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	33.47	■■■□□ 2.95
VASP-208	ENST00000589627	LRP5	O75197	1615 aa		33.46	■■■□□ 2.95
VASP-208	ENST00000589627	TRIM37	O94972	964 aa		33.46	■■■□□ 2.95
VASP-208	ENST00000589627	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		33.46	■■■□□ 2.95
VASP-208	ENST00000589627	NME9	Q86XW9	330 aa		33.46	■■■□□ 2.95
VASP-208	ENST00000589627	SOX12	O15370	315 aa		33.45	■■■□□ 2.95
VASP-208	ENST00000589627	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		33.45	■■■□□ 2.94
VASP-208	ENST00000589627	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		33.45	■■■□□ 2.94
VASP-208	ENST00000589627	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		33.44	■■■□□ 2.94
VASP-208	ENST00000589627	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		33.43	■■■□□ 2.94
VASP-208	ENST00000589627	SLC24A1	O60721	1099 aa		33.42	■■■□□ 2.94
VASP-208	ENST00000589627	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		33.42	■■■□□ 2.94
VASP-208	ENST00000589627	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	33.42	■■■□□ 2.94
VASP-208	ENST00000589627	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		33.42	■■■□□ 2.94
VASP-208	ENST00000589627	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		33.41	■■■□□ 2.94
VASP-208	ENST00000589627	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		33.41	■■■□□ 2.94
VASP-208	ENST00000589627	USP47	Q96K76	1375 aa		33.4	■■■□□ 2.94
VASP-208	ENST00000589627	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	33.39	■■■□□ 2.94
VASP-208	ENST00000589627	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		33.39	■■■□□ 2.94
VASP-208	ENST00000589627	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
VASP-208	ENST00000589627	DDB1	Q16531	1140 aa		33.36	■■■□□ 2.93
VASP-208	ENST00000589627	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
VASP-208	ENST00000589627	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		33.35	■■■□□ 2.93
VASP-208	ENST00000589627	APBA3	O96018	575 aa		33.35	■■■□□ 2.93
VASP-208	ENST00000589627	CCDC7	Q96M83	1385 aa		33.34	■■■□□ 2.93
VASP-208	ENST00000589627	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
VASP-208	ENST00000589627	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		33.33	■■■□□ 2.93
VASP-208	ENST00000589627	BCL9	O00512	1426 aa		33.33	■■■□□ 2.93
VASP-208	ENST00000589627	ERBB3	P21860	1342 aa		33.32	■■■□□ 2.93
VASP-208	ENST00000589627	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	33.32	■■■□□ 2.92
VASP-208	ENST00000589627	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		33.32	■■■□□ 2.92
VASP-208	ENST00000589627	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		33.32	■■■□□ 2.92
VASP-208	ENST00000589627	MYOM1	P52179	1685 aa		33.29	■■■□□ 2.92
VASP-208	ENST00000589627	TMF1	P82094	1093 aa		33.28	■■■□□ 2.92
VASP-208	ENST00000589627	TNS2	Q63HR2	1409 aa		33.28	■■■□□ 2.92
VASP-208	ENST00000589627	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	33.27	■■■□□ 2.92
VASP-208	ENST00000589627	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		33.27	■■■□□ 2.92
VASP-208	ENST00000589627	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	33.24	■■■□□ 2.91
VASP-208	ENST00000589627	NHS	Q6T4R5	1651 aa		33.21	■■■□□ 2.91
VASP-208	ENST00000589627	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		33.2	■■■□□ 2.91
VASP-208	ENST00000589627	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		33.19	■■■□□ 2.9
VASP-208	ENST00000589627	COG3	Q96JB2	828 aa		33.19	■■■□□ 2.9
VASP-208	ENST00000589627	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		33.19	■■■□□ 2.9
VASP-208	ENST00000589627	EXOC5	O00471	708 aa		33.18	■■■□□ 2.9
VASP-208	ENST00000589627	IP6K1	Q92551	441 aa		33.18	■■■□□ 2.9
VASP-208	ENST00000589627	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
VASP-208	ENST00000589627	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		33.18	■■■□□ 2.9
VASP-208	ENST00000589627	PLSCR1	O15162	318 aa		33.17	■■■□□ 2.9
VASP-208	ENST00000589627	CDCA8	Q53HL2	280 aa		33.16	■■■□□ 2.9
VASP-208	ENST00000589627	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		33.15	■■■□□ 2.9
VASP-208	ENST00000589627	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		33.14	■■■□□ 2.9
VASP-208	ENST00000589627	IL2RB	P14784	551 aa		33.13	■■■□□ 2.89
VASP-208	ENST00000589627	RTL1	A6NKG5	1358 aa		33.11	■■■□□ 2.89
VASP-208	ENST00000589627	FYB1	O15117	783 aa		33.11	■■■□□ 2.89
VASP-208	ENST00000589627	NBPF14	Q5TI25	921 aa		33.1	■■■□□ 2.89
VASP-208	ENST00000589627	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		33.1	■■■□□ 2.89
VASP-208	ENST00000589627	HOXC9	P31274	260 aa		33.09	■■■□□ 2.89
VASP-208	ENST00000589627	BTAF1	O14981	1849 aa		33.08	■■■□□ 2.89
VASP-208	ENST00000589627	FBLN1	P23142	703 aa		33.07	■■■□□ 2.88
VASP-208	ENST00000589627	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		33.06	■■■□□ 2.88
VASP-208	ENST00000589627	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		33.06	■■■□□ 2.88
VASP-208	ENST00000589627	CASZ1	Q86V15	1759 aa		33.06	■■■□□ 2.88
VASP-208	ENST00000589627	AMPH	P49418	695 aa		33.04	■■■□□ 2.88
VASP-208	ENST00000589627	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		33.03	■■■□□ 2.88
VASP-208	ENST00000589627	PROM2	Q8N271	834 aa		33.03	■■■□□ 2.88
VASP-208	ENST00000589627	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
VASP-208	ENST00000589627	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		33.02	■■■□□ 2.88
VASP-208	ENST00000589627	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		33.01	■■■□□ 2.87
VASP-208	ENST00000589627	KCNQ2	O43526	872 aa		33	■■■□□ 2.87
VASP-208	ENST00000589627	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
VASP-208	ENST00000589627	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
VASP-208	ENST00000589627	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		32.97	■■■□□ 2.87
VASP-208	ENST00000589627	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		32.97	■■■□□ 2.87
VASP-208	ENST00000589627	PAPPA	Q13219	1627 aa		32.97	■■■□□ 2.87
VASP-208	ENST00000589627	MEGF6	O75095	1541 aa		32.97	■■■□□ 2.87
VASP-208	ENST00000589627	TXNRD1	Q16881	649 aa		32.95	■■■□□ 2.87
VASP-208	ENST00000589627	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		32.95	■■■□□ 2.87
VASP-208	ENST00000589627	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.86
VASP-208	ENST00000589627	INSR	P06213	1382 aa		32.93	■■■□□ 2.86
VASP-208	ENST00000589627	FLT4	P35916	1363 aa		32.93	■■■□□ 2.86
VASP-208	ENST00000589627	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
VASP-208	ENST00000589627	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	32.91	■■■□□ 2.86
VASP-208	ENST00000589627	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		32.89	■■■□□ 2.86
VASP-208	ENST00000589627	NBPF4	Q96M43	638 aa		32.89	■■■□□ 2.86
VASP-208	ENST00000589627	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	32.87	■■■□□ 2.85
VASP-208	ENST00000589627	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		32.87	■■■□□ 2.85
VASP-208	ENST00000589627	LY75	O60449	1722 aa		32.87	■■■□□ 2.85

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