RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587167.1

SPHK1-204, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SPHK1, Length 456 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-204ENST00000587167 USP54Q70EL1 1684 aa26.99■■□□□ 1.91
SPHK1-204ENST00000587167 BARGINQ6ZT62 677 aa26.99■■□□□ 1.91
SPHK1-204ENST00000587167 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.99■■□□□ 1.91
SPHK1-204ENST00000587167 DISP2A7MBM2 1401 aa26.98■■□□□ 1.91
SPHK1-204ENST00000587167 SLIT3O75094 1523 aa26.97■■□□□ 1.91
SPHK1-204ENST00000587167 EVA1CP58658 441 aa26.97■■□□□ 1.91
SPHK1-204ENST00000587167 PANK3Q9H999 370 aa26.97■■□□□ 1.91
SPHK1-204ENST00000587167 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
SPHK1-204ENST00000587167 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.96■■□□□ 1.91
SPHK1-204ENST00000587167 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.96■■□□□ 1.91
SPHK1-204ENST00000587167 NLRP6P59044 892 aa26.95■■□□□ 1.9
SPHK1-204ENST00000587167 NME9Q86XW9 330 aa26.95■■□□□ 1.9
SPHK1-204ENST00000587167 USP35Q9P2H5 1018 aa26.94■■□□□ 1.9
SPHK1-204ENST00000587167 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SPHK1-204ENST00000587167 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SPHK1-204ENST00000587167 COL18A1P39060 1754 aa26.92■■□□□ 1.9
SPHK1-204ENST00000587167 FAM196AQ6ZSG2 479 aa26.92■■□□□ 1.9
SPHK1-204ENST00000587167 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.92■■□□□ 1.9
SPHK1-204ENST00000587167 LRP5O75197 1615 aa26.91■■□□□ 1.9
SPHK1-204ENST00000587167 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26.91■■□□□ 1.9
SPHK1-204ENST00000587167 USP31Q70CQ4 1352 aa26.9■■□□□ 1.9
SPHK1-204ENST00000587167 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
SPHK1-204ENST00000587167 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
SPHK1-204ENST00000587167 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.89■■□□□ 1.9
SPHK1-204ENST00000587167 TRIM37O94972 964 aa26.87■■□□□ 1.89
SPHK1-204ENST00000587167 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.86■■□□□ 1.89
SPHK1-204ENST00000587167 FYB1O15117 783 aa26.86■■□□□ 1.89
SPHK1-204ENST00000587167 CRB1P82279 1406 aa26.86■■□□□ 1.89
SPHK1-204ENST00000587167 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.86■■□□□ 1.89
SPHK1-204ENST00000587167 LTN1O94822 1766 aa26.86■■□□□ 1.89
SPHK1-204ENST00000587167 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
SPHK1-204ENST00000587167 PDE3BQ13370 1112 aa26.85■■□□□ 1.89
SPHK1-204ENST00000587167 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.85■■□□□ 1.89
SPHK1-204ENST00000587167 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.85■■□□□ 1.89
SPHK1-204ENST00000587167 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.85■■□□□ 1.89
SPHK1-204ENST00000587167 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
SPHK1-204ENST00000587167 COG3Q96JB2 828 aa26.84■■□□□ 1.89
SPHK1-204ENST00000587167 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.83■■□□□ 1.89
SPHK1-204ENST00000587167 RGPD5Q99666 1765 aa26.81■■□□□ 1.88
SPHK1-204ENST00000587167 NFAT5O94916 1531 aa26.81■■□□□ 1.88
SPHK1-204ENST00000587167 SOX12O15370 315 aa26.81■■□□□ 1.88
SPHK1-204ENST00000587167 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.81■■□□□ 1.88
SPHK1-204ENST00000587167 RREB1Q92766 1687 aa26.81■■□□□ 1.88
SPHK1-204ENST00000587167 PEAK1Q9H792 1746 aa26.81■■□□□ 1.88
SPHK1-204ENST00000587167 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
SPHK1-204ENST00000587167 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.8■■□□□ 1.88
SPHK1-204ENST00000587167 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.8■■□□□ 1.88
SPHK1-204ENST00000587167 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.8■■□□□ 1.88
SPHK1-204ENST00000587167 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
SPHK1-204ENST00000587167 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.79■■□□□ 1.88
SPHK1-204ENST00000587167 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
SPHK1-204ENST00000587167 APBA3O96018 575 aa26.79■■□□□ 1.88
SPHK1-204ENST00000587167 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.79■■□□□ 1.88
SPHK1-204ENST00000587167 LRRC37A3O60309 1634 aa26.79■■□□□ 1.88
SPHK1-204ENST00000587167 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.76■■□□□ 1.87
SPHK1-204ENST00000587167 SBF2Q86WG5 1849 aa26.76■■□□□ 1.87
SPHK1-204ENST00000587167 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.76■■□□□ 1.87
SPHK1-204ENST00000587167 NSD2O96028 1365 aa26.75■■□□□ 1.87
SPHK1-204ENST00000587167 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
SPHK1-204ENST00000587167 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
SPHK1-204ENST00000587167 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.74■■□□□ 1.87
SPHK1-204ENST00000587167 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SPHK1-204ENST00000587167 ABCC6O95255 1503 aa26.72■■□□□ 1.87
SPHK1-204ENST00000587167 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.71■■□□□ 1.87
SPHK1-204ENST00000587167 FBLN1P23142 703 aa26.7■■□□□ 1.86
SPHK1-204ENST00000587167 DDB1Q16531 1140 aa26.69■■□□□ 1.86
SPHK1-204ENST00000587167 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
SPHK1-204ENST00000587167 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.69■■□□□ 1.86
SPHK1-204ENST00000587167 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
SPHK1-204ENST00000587167 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.68■■□□□ 1.86
SPHK1-204ENST00000587167 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
SPHK1-204ENST00000587167 MORC1Q86VD1 984 aa26.67■■□□□ 1.86
SPHK1-204ENST00000587167 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
SPHK1-204ENST00000587167 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa26.66■■□□□ 1.86
SPHK1-204ENST00000587167 BCL9O00512 1426 aa26.65■■□□□ 1.86
SPHK1-204ENST00000587167 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
SPHK1-204ENST00000587167 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
SPHK1-204ENST00000587167 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
SPHK1-204ENST00000587167 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.64■■□□□ 1.85
SPHK1-204ENST00000587167 PLSCR1O15162 318 aa26.61■■□□□ 1.85
SPHK1-204ENST00000587167 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.61■■□□□ 1.85
SPHK1-204ENST00000587167 AMPHP49418 695 aa26.6■■□□□ 1.85
SPHK1-204ENST00000587167 NBPF14Q5TI25 921 aa26.6■■□□□ 1.85
SPHK1-204ENST00000587167 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.6■■□□□ 1.85
SPHK1-204ENST00000587167 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
SPHK1-204ENST00000587167 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.58■■□□□ 1.85
SPHK1-204ENST00000587167 IP6K1Q92551 441 aa26.58■■□□□ 1.85
SPHK1-204ENST00000587167 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.58■■□□□ 1.85
SPHK1-204ENST00000587167 RTL1A6NKG5 1358 aa26.58■■□□□ 1.84
SPHK1-204ENST00000587167 HOXC9P31274 260 aa26.57■■□□□ 1.84
SPHK1-204ENST00000587167 ERBB3P21860 1342 aa26.57■■□□□ 1.84
SPHK1-204ENST00000587167 POLKQ9UBT6 870 aa26.56■■□□□ 1.84
SPHK1-204ENST00000587167 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
SPHK1-204ENST00000587167 EXOC5O00471 708 aa26.55■■□□□ 1.84
SPHK1-204ENST00000587167 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
SPHK1-204ENST00000587167 TNS2Q63HR2 1409 aa26.55■■□□□ 1.84
SPHK1-204ENST00000587167 FLT4P35916 1363 aa26.54■■□□□ 1.84
SPHK1-204ENST00000587167 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.54■■□□□ 1.84
SPHK1-204ENST00000587167 PROM2Q8N271 834 aa26.52■■□□□ 1.84
SPHK1-204ENST00000587167 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.8 ms