RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585934.1

TRAPPC6A-202, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-202ENST00000585934 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ABCC6O95255 1503 aa22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC6A-202ENST00000585934 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CDCA8Q53HL2 280 aa22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC6A-202ENST00000585934 BARGINQ6ZT62 677 aa22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC6A-202ENST00000585934 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC6A-202ENST00000585934 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC6A-202ENST00000585934 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC6A-202ENST00000585934 MYOM1P52179 1685 aa22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC6A-202ENST00000585934 FAM182BQ5T319 152 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC6A-202ENST00000585934 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC6A-202ENST00000585934 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC6A-202ENST00000585934 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC6A-202ENST00000585934 LRRC37A3O60309 1634 aa22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PDE3BQ13370 1112 aa22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC6A-202ENST00000585934 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC6A-202ENST00000585934 COG3Q96JB2 828 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC6A-202ENST00000585934 BAG6P46379 1132 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC6A-202ENST00000585934 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC6A-202ENST00000585934 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC6A-202ENST00000585934 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CCDC7Q96M83 1385 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC6A-202ENST00000585934 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ERBB3P21860 1342 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC6A-202ENST00000585934 DDB1Q16531 1140 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC6A-202ENST00000585934 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC6A-202ENST00000585934 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PEAK1Q9H792 1746 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TRIM37O94972 964 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-202ENST00000585934 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-202ENST00000585934 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-202ENST00000585934 DISP2A7MBM2 1401 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-202ENST00000585934 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-202ENST00000585934 SBF2Q86WG5 1849 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-202ENST00000585934 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-202ENST00000585934 FYB1O15117 783 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-202ENST00000585934 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-202ENST00000585934 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-202ENST00000585934 AMPHP49418 695 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-202ENST00000585934 IP6K1Q92551 441 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TNS2Q63HR2 1409 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-202ENST00000585934 RTL1A6NKG5 1358 aa22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-202ENST00000585934 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-202ENST00000585934 APBA3O96018 575 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-202ENST00000585934 FBLN1P23142 703 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-202ENST00000585934 HOXC9P31274 260 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-202ENST00000585934 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-202ENST00000585934 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-202ENST00000585934 RREB1Q92766 1687 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-202ENST00000585934 EXOC5O00471 708 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-202ENST00000585934 IL2RBP14784 551 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-202ENST00000585934 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-202ENST00000585934 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-202ENST00000585934 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-202ENST00000585934 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
TRAPPC6A-202ENST00000585934 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.58■■□□□ 1.2
TRAPPC6A-202ENST00000585934 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC6A-202ENST00000585934 BCL9O00512 1426 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC6A-202ENST00000585934 FLT4P35916 1363 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC6A-202ENST00000585934 NHSQ6T4R5 1651 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC6A-202ENST00000585934 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC6A-202ENST00000585934 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC6A-202ENST00000585934 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC6A-202ENST00000585934 INSRP06213 1382 aa22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC6A-202ENST00000585934 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PANK3Q9H999 370 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC6A-202ENST00000585934 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC6A-202ENST00000585934 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC6A-202ENST00000585934 MEGF6O75095 1541 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC6A-202ENST00000585934 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC6A-202ENST00000585934 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC6A-202ENST00000585934 LRP5O75197 1615 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC6A-202ENST00000585934 BTAF1O14981 1849 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC6A-202ENST00000585934 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC6A-202ENST00000585934 NSD2O96028 1365 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC6A-202ENST00000585934 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC6A-202ENST00000585934 NBPF4Q96M43 638 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC6A-202ENST00000585934 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PLSCR1O15162 318 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
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