RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583826.5

TSPOAP1-AS1-209, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 1,004 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP40■■■■□ 3.99
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 LRRC37A3O60309 1634 aa39.97■■■■□ 3.99
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 OVOS2Q6IE36 1432 aa39.94■■■■□ 3.98
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 WNK3Q9BYP7 1800 aa39.94■■■■□ 3.98
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 USP54Q70EL1 1684 aa39.88■■■■□ 3.97
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 CCDC7Q96M83 1385 aa39.8■■■■□ 3.96
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP39.79■■■■□ 3.96
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 NINLQ9Y2I6 1382 aa39.73■■■■□ 3.95
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP39.73■■■■□ 3.95
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 SLC24A1O60721 1099 aa39.72■■■■□ 3.95
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 NLRP2Q9NX02 1062 aa39.72■■■■□ 3.95
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 BCL9O00512 1426 aa39.7■■■■□ 3.95
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 TNS2Q63HR2 1409 aa39.68■■■■□ 3.94
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 ANKRD24Q8TF21 1146 aa39.67■■■■□ 3.94
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 TMF1P82094 1093 aa39.59■■■■□ 3.93
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa39.58■■■■□ 3.93
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP39.54■■■■□ 3.92
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 KCNQ2O43526 872 aa39.52■■■■□ 3.92
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 FBLN1P23142 703 aa39.48■■■■□ 3.91
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 AMPHP49418 695 aa39.48■■■■□ 3.91
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 CDCA8Q53HL2 280 aa39.44■■■■□ 3.9
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP39.44■■■■□ 3.9
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 CASZ1Q86V15 1759 aa39.4■■■■□ 3.9
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 PCGF6Q9BYE7 350 aa39.39■■■■□ 3.9
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 RTL1A6NKG5 1358 aa39.37■■■■□ 3.89
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 RGPD2P0DJD1 1756 aa39.36■■■■□ 3.89
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 MEGF6O75095 1541 aa39.26■■■■□ 3.88
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 NBPF6Q5VWK0 638 aa39.24■■■■□ 3.87
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 NBPF4Q96M43 638 aa39.24■■■■□ 3.87
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 CARD14Q9BXL6 1004 aa39.24■■■■□ 3.87
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 NSD3Q9BZ95 1437 aa39.23■■■■□ 3.87
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 PAPPAQ13219 1627 aa39.23■■■■□ 3.87
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 USHBP1Q8N6Y0 703 aa39.23■■■■□ 3.87
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP39.23■■■■□ 3.87
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP39.23■■■■□ 3.87
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