RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576591.1

AKAP1-218, Transcript of A-kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene AKAP1, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP1-218ENST00000576591 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
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AKAP1-218ENST00000576591 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
AKAP1-218ENST00000576591 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
AKAP1-218ENST00000576591 MORC1Q86VD1 984 aa20.11■□□□□ 0.81
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AKAP1-218ENST00000576591 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.1■□□□□ 0.81
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AKAP1-218ENST00000576591 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.03■□□□□ 0.8
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AKAP1-218ENST00000576591 PKD1L3Q7Z443 1732 aa19.79■□□□□ 0.76
AKAP1-218ENST00000576591 EP400Q96L91 3159 aa19.79■□□□□ 0.76
AKAP1-218ENST00000576591 ANP32CO43423 234 aa19.78■□□□□ 0.76
AKAP1-218ENST00000576591 DDB1Q16531 1140 aa19.78■□□□□ 0.76
AKAP1-218ENST00000576591 SULT6B1Q6IMI4 303 aa19.78■□□□□ 0.76
AKAP1-218ENST00000576591 KRT27Q7Z3Y8 459 aa19.78■□□□□ 0.76
AKAP1-218ENST00000576591 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa19.77■□□□□ 0.76
AKAP1-218ENST00000576591 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa19.77■□□□□ 0.76
AKAP1-218ENST00000576591 TATP17735 454 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
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