RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569224.1

DDX19B-215, Transcript of DEAD-box helicase 19B, human

TSL 2

Gene DDX19B, Length 707 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX19B-215	ENST00000569224	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
DDX19B-215	ENST00000569224	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
DDX19B-215	ENST00000569224	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
DDX19B-215	ENST00000569224	VPS72	Q15906	364 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX19B-215	ENST00000569224	RTL1	A6NKG5	1358 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX19B-215	ENST00000569224	ILDR2	Q71H61	639 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX19B-215	ENST00000569224	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX19B-215	ENST00000569224	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX19B-215	ENST00000569224	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX19B-215	ENST00000569224	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
DDX19B-215	ENST00000569224	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX19B-215	ENST00000569224	RGS12	O14924	1447 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX19B-215	ENST00000569224	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
DDX19B-215	ENST00000569224	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
DDX19B-215	ENST00000569224	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX19B-215	ENST00000569224	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX19B-215	ENST00000569224	FBLN1	P23142	703 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX19B-215	ENST00000569224	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
DDX19B-215	ENST00000569224	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
DDX19B-215	ENST00000569224	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
DDX19B-215	ENST00000569224	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	RXRB	P28702	533 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	CRB1	P82279	1406 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	STRN4	Q9NRL3	753 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	ERBB3	P21860	1342 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	HOXC9	P31274	260 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	FLT4	P35916	1363 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	IP6K1	Q92551	441 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	INSR	P06213	1382 aa		12.73	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	EVA1C	P58658	441 aa		12.73	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	MORC1	Q86VD1	984 aa		12.73	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		12.73	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	AMPH	P49418	695 aa		12.72	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		12.72	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	POLK	Q9UBT6	870 aa		12.72	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	LRRC37A3	O60309	1634 aa		12.72	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	DISP2	A7MBM2	1401 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
DDX19B-215	ENST00000569224	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
DDX19B-215	ENST00000569224	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DDX19B-215	ENST00000569224	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DDX19B-215	ENST00000569224	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DDX19B-215	ENST00000569224	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DDX19B-215	ENST00000569224	NCAPD2	Q15021	1401 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DDX19B-215	ENST00000569224	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
DDX19B-215	ENST00000569224	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		12.69	□□□□□ -0.38
DDX19B-215	ENST00000569224	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
DDX19B-215	ENST00000569224	USP35	Q9P2H5	1018 aa		12.69	□□□□□ -0.38
DDX19B-215	ENST00000569224	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		12.68	□□□□□ -0.38
DDX19B-215	ENST00000569224	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		12.68	□□□□□ -0.38
DDX19B-215	ENST00000569224	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		12.68	□□□□□ -0.38
DDX19B-215	ENST00000569224	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
DDX19B-215	ENST00000569224	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		12.66	□□□□□ -0.38
DDX19B-215	ENST00000569224	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
DDX19B-215	ENST00000569224	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		12.66	□□□□□ -0.38
DDX19B-215	ENST00000569224	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
DDX19B-215	ENST00000569224	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		12.66	□□□□□ -0.38
DDX19B-215	ENST00000569224	EP400	Q96L91	3159 aa		12.66	□□□□□ -0.38
DDX19B-215	ENST00000569224	TNS2	Q63HR2	1409 aa		12.65	□□□□□ -0.38
DDX19B-215	ENST00000569224	MEGF6	O75095	1541 aa		12.64	□□□□□ -0.39
DDX19B-215	ENST00000569224	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	12.64	□□□□□ -0.39
DDX19B-215	ENST00000569224	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
DDX19B-215	ENST00000569224	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		12.64	□□□□□ -0.39
DDX19B-215	ENST00000569224	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	12.64	□□□□□ -0.39
DDX19B-215	ENST00000569224	NBPF4	Q96M43	638 aa		12.64	□□□□□ -0.39
DDX19B-215	ENST00000569224	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	12.64	□□□□□ -0.39
DDX19B-215	ENST00000569224	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		12.63	□□□□□ -0.39
DDX19B-215	ENST00000569224		A0A0G2JS52	829 aa		12.63	□□□□□ -0.39
DDX19B-215	ENST00000569224	MTHFS	P49914	203 aa		12.63	□□□□□ -0.39
DDX19B-215	ENST00000569224	MYT1	Q01538	1121 aa		12.63	□□□□□ -0.39
DDX19B-215	ENST00000569224	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		12.63	□□□□□ -0.39
DDX19B-215	ENST00000569224	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DDX19B-215	ENST00000569224	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DDX19B-215	ENST00000569224	IL2RB	P14784	551 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DDX19B-215	ENST00000569224	PPP2R1A	P30153	589 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DDX19B-215	ENST00000569224	SOCS7	O14512	581 aa		12.61	□□□□□ -0.39
DDX19B-215	ENST00000569224	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		12.61	□□□□□ -0.39
DDX19B-215	ENST00000569224	EYA1	Q99502	592 aa		12.61	□□□□□ -0.39
DDX19B-215	ENST00000569224	IL13	P35225	146 aa		12.6	□□□□□ -0.39
DDX19B-215	ENST00000569224	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	12.59	□□□□□ -0.39
DDX19B-215	ENST00000569224	KDR	P35968	1356 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDX19B-215	ENST00000569224	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDX19B-215	ENST00000569224	RALBP1	Q15311	655 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDX19B-215	ENST00000569224	DDB1	Q16531	1140 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDX19B-215	ENST00000569224	SBF2	Q86WG5	1849 aa		12.59	□□□□□ -0.39

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