RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568839.5

E2F4-212, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene E2F4, Length 944 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-212ENST00000568839 RGPD5Q99666 1765 aa16.07■□□□□ 0.16
E2F4-212ENST00000568839 COL18A1P39060 1754 aa16.06■□□□□ 0.16
E2F4-212ENST00000568839 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa16.06■□□□□ 0.16
E2F4-212ENST00000568839 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa16.06■□□□□ 0.16
E2F4-212ENST00000568839 OVOS2Q6IE36 1432 aa16.06■□□□□ 0.16
E2F4-212ENST00000568839 WDR17Q8IZU2 1322 aa16.06■□□□□ 0.16
E2F4-212ENST00000568839 MON2Q7Z3U7 1717 aa16.05■□□□□ 0.16
E2F4-212ENST00000568839 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
E2F4-212ENST00000568839 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
E2F4-212ENST00000568839 ARHGEF25Q86VW2 580 aa16.05■□□□□ 0.16
E2F4-212ENST00000568839 TMC1Q8TDI8 760 aa16.05■□□□□ 0.16
E2F4-212ENST00000568839 RREB1Q92766 1687 aa16.04■□□□□ 0.16
E2F4-212ENST00000568839 WNK3Q9BYP7 1800 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F4-212ENST00000568839 SLC24A1O60721 1099 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F4-212ENST00000568839 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
E2F4-212ENST00000568839 TERF2IPQ9NYB0 399 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F4-212ENST00000568839 AXIN2Q9Y2T1 843 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F4-212ENST00000568839 LRRC37A3O60309 1634 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F4-212ENST00000568839 SBF2Q86WG5 1849 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F4-212ENST00000568839 CARD10Q9BWT7 1032 aa16.02■□□□□ 0.16
E2F4-212ENST00000568839 NUP188Q5SRE5 1749 aa16.02■□□□□ 0.15
E2F4-212ENST00000568839 ABCC6O95255 1503 aa16.01■□□□□ 0.15
E2F4-212ENST00000568839 EXOC5O00471 708 aa16.01■□□□□ 0.15
E2F4-212ENST00000568839 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
E2F4-212ENST00000568839 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa16■□□□□ 0.15
E2F4-212ENST00000568839 LTN1O94822 1766 aa16■□□□□ 0.15
E2F4-212ENST00000568839 CCDC7Q96M83 1385 aa16■□□□□ 0.15
E2F4-212ENST00000568839 PEAK1Q9H792 1746 aa15.99■□□□□ 0.15
E2F4-212ENST00000568839 PLSCR1O15162 318 aa15.99■□□□□ 0.15
E2F4-212ENST00000568839 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
E2F4-212ENST00000568839 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
E2F4-212ENST00000568839 NFAT5O94916 1531 aa15.99■□□□□ 0.15
E2F4-212ENST00000568839 USP54Q70EL1 1684 aa15.98■□□□□ 0.15
E2F4-212ENST00000568839 USP31Q70CQ4 1352 aa15.98■□□□□ 0.15
E2F4-212ENST00000568839 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa15.97■□□□□ 0.15
E2F4-212ENST00000568839 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
E2F4-212ENST00000568839 NME9Q86XW9 330 aa15.96■□□□□ 0.15
E2F4-212ENST00000568839 NINLQ9Y2I6 1382 aa15.96■□□□□ 0.15
E2F4-212ENST00000568839 KAT6BQ8WYB5 2073 aa15.96■□□□□ 0.15
E2F4-212ENST00000568839 BCL9O00512 1426 aa15.95■□□□□ 0.14
E2F4-212ENST00000568839 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
E2F4-212ENST00000568839 NLRP2Q9NX02 1062 aa15.95■□□□□ 0.14
E2F4-212ENST00000568839 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
E2F4-212ENST00000568839 SPON1Q9HCB6 807 aa15.94■□□□□ 0.14
E2F4-212ENST00000568839 CD163L1Q9NR16 1453 aa15.94■□□□□ 0.14
E2F4-212ENST00000568839 ERBB3P21860 1342 aa15.94■□□□□ 0.14
E2F4-212ENST00000568839 DCAF8L1A6NGE4 600 aa15.93■□□□□ 0.14
E2F4-212ENST00000568839 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
E2F4-212ENST00000568839 A0A1W2PP64 1363 aa15.92■□□□□ 0.14
E2F4-212ENST00000568839 IL2RBP14784 551 aa15.92■□□□□ 0.14
E2F4-212ENST00000568839 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa15.91■□□□□ 0.14
E2F4-212ENST00000568839 KCNQ2O43526 872 aa15.91■□□□□ 0.14
E2F4-212ENST00000568839 ANKRD24Q8TF21 1146 aa15.91■□□□□ 0.14
E2F4-212ENST00000568839 TNS2Q63HR2 1409 aa15.91■□□□□ 0.14
E2F4-212ENST00000568839 COG3Q96JB2 828 aa15.9■□□□□ 0.14
E2F4-212ENST00000568839 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
E2F4-212ENST00000568839 TMF1P82094 1093 aa15.88■□□□□ 0.13
E2F4-212ENST00000568839 TXNRD1Q16881 649 aa15.88■□□□□ 0.13
E2F4-212ENST00000568839 TESK2Q96S53 571 aa15.88■□□□□ 0.13
E2F4-212ENST00000568839 STK32BQ9NY57 414 aa15.88■□□□□ 0.13
E2F4-212ENST00000568839 NHSQ6T4R5 1651 aa15.87■□□□□ 0.13
E2F4-212ENST00000568839 AMPHP49418 695 aa15.87■□□□□ 0.13
E2F4-212ENST00000568839 CDCA8Q53HL2 280 aa15.87■□□□□ 0.13
E2F4-212ENST00000568839 PTF1AQ7RTS3 328 aa15.87■□□□□ 0.13
E2F4-212ENST00000568839 IP6K1Q92551 441 aa15.87■□□□□ 0.13
E2F4-212ENST00000568839 PROM2Q8N271 834 aa15.85■□□□□ 0.13
E2F4-212ENST00000568839 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
E2F4-212ENST00000568839 ACSBG1Q96GR2 724 aa15.85■□□□□ 0.13
E2F4-212ENST00000568839 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa15.84■□□□□ 0.13
E2F4-212ENST00000568839 CASZ1Q86V15 1759 aa15.83■□□□□ 0.12
E2F4-212ENST00000568839 SLC15A2Q16348 729 aa15.83■□□□□ 0.12
E2F4-212ENST00000568839 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
E2F4-212ENST00000568839 BTAF1O14981 1849 aa15.82■□□□□ 0.12
E2F4-212ENST00000568839 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
E2F4-212ENST00000568839 USP47Q96K76 1375 aa15.82■□□□□ 0.12
E2F4-212ENST00000568839 HOXC9P31274 260 aa15.81■□□□□ 0.12
E2F4-212ENST00000568839 MAP3K19Q56UN5 1328 aa15.81■□□□□ 0.12
E2F4-212ENST00000568839 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
E2F4-212ENST00000568839 ZBTB7AO95365 584 aa15.8■□□□□ 0.12
E2F4-212ENST00000568839 RTL1A6NKG5 1358 aa15.79■□□□□ 0.12
E2F4-212ENST00000568839 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.79■□□□□ 0.12
E2F4-212ENST00000568839 KIF20BQ96Q89 1820 aa15.78■□□□□ 0.12
E2F4-212ENST00000568839 RGPD2P0DJD1 1756 aa15.78■□□□□ 0.12
E2F4-212ENST00000568839 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
E2F4-212ENST00000568839 MTFR1LQ9H019 292 aa15.78■□□□□ 0.12
E2F4-212ENST00000568839 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
E2F4-212ENST00000568839 FYB1O15117 783 aa15.77■□□□□ 0.12
E2F4-212ENST00000568839 YY1P25490 414 aa15.77■□□□□ 0.12
E2F4-212ENST00000568839 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.77■□□□□ 0.12
E2F4-212ENST00000568839 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
E2F4-212ENST00000568839 GGNBP2Q9H3C7 697 aa15.77■□□□□ 0.12
E2F4-212ENST00000568839 CGNL1Q0VF96 1302 aa15.76■□□□□ 0.11
E2F4-212ENST00000568839 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa15.76■□□□□ 0.11
E2F4-212ENST00000568839 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
E2F4-212ENST00000568839 FBLN1P23142 703 aa15.75■□□□□ 0.11
E2F4-212ENST00000568839 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
E2F4-212ENST00000568839 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
E2F4-212ENST00000568839 DOT1LQ8TEK3 1739 aa15.74■□□□□ 0.11
E2F4-212ENST00000568839 KIF24Q5T7B8 1368 aa15.74■□□□□ 0.11
E2F4-212ENST00000568839 MYOM1P52179 1685 aa15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms