RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568331.5

SNAP23-216, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 4

Gene SNAP23, Length 557 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-216ENST00000568331 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.27■■■□□ 2.28
SNAP23-216ENST00000568331 LTN1O94822 1766 aa29.26■■■□□ 2.28
SNAP23-216ENST00000568331 COG3Q96JB2 828 aa29.25■■■□□ 2.27
SNAP23-216ENST00000568331 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa29.25■■■□□ 2.27
SNAP23-216ENST00000568331 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa29.24■■■□□ 2.27
SNAP23-216ENST00000568331 OVOS2Q6IE36 1432 aa29.24■■■□□ 2.27
SNAP23-216ENST00000568331 CRB1P82279 1406 aa29.23■■■□□ 2.27
SNAP23-216ENST00000568331 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.23■■■□□ 2.27
SNAP23-216ENST00000568331 ABCC6O95255 1503 aa29.22■■■□□ 2.27
SNAP23-216ENST00000568331 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.22■■■□□ 2.27
SNAP23-216ENST00000568331 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
SNAP23-216ENST00000568331 BARGINQ6ZT62 677 aa29.21■■■□□ 2.27
SNAP23-216ENST00000568331 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa29.21■■■□□ 2.27
SNAP23-216ENST00000568331 KIF20BQ96Q89 1820 aa29.21■■■□□ 2.27
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SNAP23-216ENST00000568331 WDR17Q8IZU2 1322 aa29.19■■■□□ 2.26
SNAP23-216ENST00000568331 EP400Q96L91 3159 aa29.17■■■□□ 2.26
SNAP23-216ENST00000568331 FYB1O15117 783 aa29.15■■■□□ 2.26
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SNAP23-216ENST00000568331 CARD10Q9BWT7 1032 aa29.1■■■□□ 2.25
SNAP23-216ENST00000568331 FAM182BQ5T319 152 aa29.09■■■□□ 2.25
SNAP23-216ENST00000568331 AMPHP49418 695 aa29.08■■■□□ 2.25
SNAP23-216ENST00000568331 ERBB3P21860 1342 aa29.07■■■□□ 2.24
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SNAP23-216ENST00000568331 IP6K1Q92551 441 aa29.07■■■□□ 2.24
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SNAP23-216ENST00000568331 CGNL1Q0VF96 1302 aa29.06■■■□□ 2.24
SNAP23-216ENST00000568331 MAP3K19Q56UN5 1328 aa29.06■■■□□ 2.24
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SNAP23-216ENST00000568331 NLRP2Q9NX02 1062 aa29.05■■■□□ 2.24
SNAP23-216ENST00000568331 RGPD1P0DJD0 1748 aa29.05■■■□□ 2.24
SNAP23-216ENST00000568331 FBLN1P23142 703 aa29.04■■■□□ 2.24
SNAP23-216ENST00000568331 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
SNAP23-216ENST00000568331 DDB1Q16531 1140 aa29.03■■■□□ 2.24
SNAP23-216ENST00000568331 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
SNAP23-216ENST00000568331 LRRC37A3O60309 1634 aa29.02■■■□□ 2.24
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SNAP23-216ENST00000568331 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
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SNAP23-216ENST00000568331 RTL1A6NKG5 1358 aa29■■■□□ 2.23
SNAP23-216ENST00000568331 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.98■■■□□ 2.23
SNAP23-216ENST00000568331 BAG6P46379 1132 aa28.97■■■□□ 2.23
SNAP23-216ENST00000568331 DEFB132Q7Z7B7 95 aa28.96■■■□□ 2.23
SNAP23-216ENST00000568331 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.95■■■□□ 2.23
SNAP23-216ENST00000568331 DISP2A7MBM2 1401 aa28.95■■■□□ 2.23
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SNAP23-216ENST00000568331 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa28.94■■■□□ 2.22
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SNAP23-216ENST00000568331 RGPD2P0DJD1 1756 aa28.92■■■□□ 2.22
SNAP23-216ENST00000568331 FLT4P35916 1363 aa28.91■■■□□ 2.22
SNAP23-216ENST00000568331 PEAK1Q9H792 1746 aa28.9■■■□□ 2.22
SNAP23-216ENST00000568331 KNSTRNQ9Y448 316 aa28.9■■■□□ 2.22
SNAP23-216ENST00000568331 NSD2O96028 1365 aa28.88■■■□□ 2.21
SNAP23-216ENST00000568331 INSRP06213 1382 aa28.88■■■□□ 2.21
SNAP23-216ENST00000568331 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
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SNAP23-216ENST00000568331 TNS2Q63HR2 1409 aa28.87■■■□□ 2.21
SNAP23-216ENST00000568331 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa28.87■■■□□ 2.21
SNAP23-216ENST00000568331 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
SNAP23-216ENST00000568331 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.87■■■□□ 2.21
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SNAP23-216ENST00000568331 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
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SNAP23-216ENST00000568331 NBPF4Q96M43 638 aa28.8■■■□□ 2.2
SNAP23-216ENST00000568331 POLKQ9UBT6 870 aa28.8■■■□□ 2.2
SNAP23-216ENST00000568331 BCL9O00512 1426 aa28.79■■■□□ 2.2
SNAP23-216ENST00000568331 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.78■■■□□ 2.2
SNAP23-216ENST00000568331 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
SNAP23-216ENST00000568331 USHBP1Q8N6Y0 703 aa28.77■■■□□ 2.2
SNAP23-216ENST00000568331 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.76■■■□□ 2.2
SNAP23-216ENST00000568331 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.76■■■□□ 2.19
SNAP23-216ENST00000568331 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
SNAP23-216ENST00000568331 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
SNAP23-216ENST00000568331 CAMKK2Q96RR4 588 aa28.75■■■□□ 2.19
SNAP23-216ENST00000568331 KAT6BQ8WYB5 2073 aa28.73■■■□□ 2.19
SNAP23-216ENST00000568331 TATP17735 454 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
SNAP23-216ENST00000568331 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
SNAP23-216ENST00000568331 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
SNAP23-216ENST00000568331 MEGF6O75095 1541 aa28.72■■■□□ 2.19
SNAP23-216ENST00000568331 NHSQ6T4R5 1651 aa28.7■■■□□ 2.19
SNAP23-216ENST00000568331 RREB1Q92766 1687 aa28.7■■■□□ 2.18
SNAP23-216ENST00000568331 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
SNAP23-216ENST00000568331 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.7■■■□□ 2.18
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