RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564566.1

USP10-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 4

Gene USP10, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-211ENST00000564566 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
USP10-211ENST00000564566 EVC2Q86UK5 1308 aa24.43■■□□□ 1.5
USP10-211ENST00000564566 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.41■■□□□ 1.5
USP10-211ENST00000564566 KCNQ2O43526 872 aa24.41■■□□□ 1.5
USP10-211ENST00000564566 YY1P25490 414 aa24.4■■□□□ 1.5
USP10-211ENST00000564566 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.4■■□□□ 1.5
USP10-211ENST00000564566 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.39■■□□□ 1.49
USP10-211ENST00000564566 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.39■■□□□ 1.49
USP10-211ENST00000564566 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.39■■□□□ 1.49
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USP10-211ENST00000564566 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
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USP10-211ENST00000564566 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
USP10-211ENST00000564566 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.36■■□□□ 1.49
USP10-211ENST00000564566 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.35■■□□□ 1.49
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USP10-211ENST00000564566 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
USP10-211ENST00000564566 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.32■■□□□ 1.48
USP10-211ENST00000564566 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.31■■□□□ 1.48
USP10-211ENST00000564566 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.31■■□□□ 1.48
USP10-211ENST00000564566 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.31■■□□□ 1.48
USP10-211ENST00000564566 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
USP10-211ENST00000564566 MYOM1P52179 1685 aa24.3■■□□□ 1.48
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USP10-211ENST00000564566 PROM2Q8N271 834 aa24.28■■□□□ 1.48
USP10-211ENST00000564566 TNS2Q63HR2 1409 aa24.27■■□□□ 1.48
USP10-211ENST00000564566 CCDC7Q96M83 1385 aa24.27■■□□□ 1.48
USP10-211ENST00000564566 ABCC6O95255 1503 aa24.26■■□□□ 1.47
USP10-211ENST00000564566 TXNRD1Q16881 649 aa24.26■■□□□ 1.47
USP10-211ENST00000564566 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.26■■□□□ 1.47
USP10-211ENST00000564566 STK32BQ9NY57 414 aa24.26■■□□□ 1.47
USP10-211ENST00000564566 NHSQ6T4R5 1651 aa24.26■■□□□ 1.47
USP10-211ENST00000564566 LTN1O94822 1766 aa24.26■■□□□ 1.47
USP10-211ENST00000564566 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
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USP10-211ENST00000564566 USP54Q70EL1 1684 aa24.21■■□□□ 1.47
USP10-211ENST00000564566 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.21■■□□□ 1.47
USP10-211ENST00000564566 SLC15A2Q16348 729 aa24.2■■□□□ 1.46
USP10-211ENST00000564566 NME9Q86XW9 330 aa24.2■■□□□ 1.46
USP10-211ENST00000564566 ERBB3P21860 1342 aa24.19■■□□□ 1.46
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USP10-211ENST00000564566 BTAF1O14981 1849 aa24.18■■□□□ 1.46
USP10-211ENST00000564566 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.17■■□□□ 1.46
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USP10-211ENST00000564566 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
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USP10-211ENST00000564566 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
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USP10-211ENST00000564566 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.14■■□□□ 1.45
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USP10-211ENST00000564566 SYT17Q9BSW7 474 aa24.1■■□□□ 1.45
USP10-211ENST00000564566 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.1■■□□□ 1.45
USP10-211ENST00000564566 A0A1W2PP64 1363 aa24.08■■□□□ 1.45
USP10-211ENST00000564566 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
USP10-211ENST00000564566 ZNF827Q17R98 1081 aa24.07■■□□□ 1.44
USP10-211ENST00000564566 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
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USP10-211ENST00000564566 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.06■■□□□ 1.44
USP10-211ENST00000564566 ARXQ96QS3 562 aa24.05■■□□□ 1.44
USP10-211ENST00000564566 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
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USP10-211ENST00000564566 CHD4Q14839 1912 aa24.04■■□□□ 1.44
USP10-211ENST00000564566 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.03■■□□□ 1.44
USP10-211ENST00000564566 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.03■■□□□ 1.44
USP10-211ENST00000564566 KLHL34Q8N239 644 aa24.02■■□□□ 1.44
USP10-211ENST00000564566 UTRNP46939 3433 aa24.02■■□□□ 1.44
USP10-211ENST00000564566 TONSLQ96HA7 1378 aa24.01■■□□□ 1.43
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USP10-211ENST00000564566 QSER1Q2KHR3 1735 aa24■■□□□ 1.43
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USP10-211ENST00000564566 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.96■■□□□ 1.43
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USP10-211ENST00000564566 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.96■■□□□ 1.43
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USP10-211ENST00000564566 COG3Q96JB2 828 aa23.96■■□□□ 1.43
USP10-211ENST00000564566 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.95■■□□□ 1.42
USP10-211ENST00000564566 LY75O60449 1722 aa23.94■■□□□ 1.42
USP10-211ENST00000564566 AMPHP49418 695 aa23.94■■□□□ 1.42
USP10-211ENST00000564566 GPR162Q16538 588 aa23.94■■□□□ 1.42
USP10-211ENST00000564566 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.93■■□□□ 1.42
USP10-211ENST00000564566 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.93■■□□□ 1.42
USP10-211ENST00000564566 FBLN1P23142 703 aa23.93■■□□□ 1.42
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