RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 TNIKQ9UKE5 1360 aa7.34□□□□□ -1.23
CAPN3-211ENST00000562199 AVPP01185 164 aa7.34□□□□□ -1.23
CAPN3-211ENST00000562199 JUNDP17535 347 aa7.34□□□□□ -1.23
CAPN3-211ENST00000562199 SKOR1P84550 965 aa7.34□□□□□ -1.23
CAPN3-211ENST00000562199 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CAPN3-211ENST00000562199 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.34□□□□□ -1.23
CAPN3-211ENST00000562199 SMARCA2P51531 1590 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 MOXD2PA6NHM9 499 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 BRD1O95696 1058 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 SMPD1P17405 629 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 RETREG3Q86VR2 466 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 SGSM3Q96HU1 749 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 NUDT12Q9BQG2 462 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 SMARCA4P51532 1647 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 CLGNO14967 610 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 ABCC8Q09428 1581 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 CTC1Q2NKJ3 1217 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 CRIPAKQ8N1N5 446 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 SPATA32Q96LK8 384 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 MYH16Q9H6N6 1097 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 CCDC88BA6NC98 1476 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 GOLGA3Q08378 1498 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 HPS1Q92902 700 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 BEGAINQ9BUH8 593 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 ALDH1A1P00352 501 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 MS4A1P11836 297 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 AMHR2Q16671 573 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 FAM9BQ8IZU0 186 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 KIF21BO75037 1637 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 MARCH6O60337 910 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 WNT7BP56706 349 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 IRF5Q13568 498 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 PRR7Q8TB68 274 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 IGSF5Q9NSI5 407 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPN3-211ENST00000562199 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 EHBP1Q8NDI1 1231 aa7.27□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 TRIM66O15016 1216 aa7.26□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 CCNYL3P0C7X3 344 aa7.26□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 MTMR2Q13614 643 aa7.26□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 LINC01559Q495D7 138 aa7.26□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 PARP9Q8IXQ6 854 aa7.26□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 TBC1D2Q9BYX2 928 aa7.26□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa7.26□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 TERF2IPQ9NYB0 399 aa7.26□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 PPME1Q9Y570 386 aa7.26□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 SH3BP2P78314 561 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 GORABQ5T7V8 394 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 TREML4Q6UXN2 200 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 RETREG2Q8NC44 543 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 IL27Q8NEV9 243 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 BAP1Q92560 729 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 SOGA1O94964 1423 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 CEP164Q9UPV0 1460 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 TRAK2O60296 914 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 MMP14P50281 582 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 NME8Q8N427 588 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 AK7Q96M32 723 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 UNC93B1Q9H1C4 597 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 SIAH2O43255 324 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 KCNH2Q12809 1159 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 PTPRNQ16849 979 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 WASF2Q9Y6W5 498 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 ERCC3P19447 782 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 CTHP32929 405 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 SLC52A1Q9NWF4 448 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 PEG3Q9GZU2 1588 aa7.21□□□□□ -1.25
CAPN3-211ENST00000562199 ANKRD62A6NC57 917 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPN3-211ENST00000562199 SPDYE5A6NIY4 337 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPN3-211ENST00000562199 UNCXA6NJT0 531 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPN3-211ENST00000562199 RALBP1Q15311 655 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPN3-211ENST00000562199 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CAPN3-211ENST00000562199 RINLQ6ZS11 566 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPN3-211ENST00000562199 RIC3Q7Z5B4 369 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPN3-211ENST00000562199 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CAPN3-211ENST00000562199 CABLES1Q8TDN4 633 aa7.21□□□□□ -1.26
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