RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561256.5

USP3-AS1-210, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-210ENST00000561256 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
USP3-AS1-210ENST00000561256 YY1P25490 414 aa24.83■■□□□ 1.57
USP3-AS1-210ENST00000561256 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
USP3-AS1-210ENST00000561256 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.82■■□□□ 1.56
USP3-AS1-210ENST00000561256 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.82■■□□□ 1.56
USP3-AS1-210ENST00000561256 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
USP3-AS1-210ENST00000561256 SOX12O15370 315 aa24.81■■□□□ 1.56
USP3-AS1-210ENST00000561256 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.81■■□□□ 1.56
USP3-AS1-210ENST00000561256 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.81■■□□□ 1.56
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.81■■□□□ 1.56
USP3-AS1-210ENST00000561256 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.81■■□□□ 1.56
USP3-AS1-210ENST00000561256 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.8■■□□□ 1.56
USP3-AS1-210ENST00000561256 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.8■■□□□ 1.56
USP3-AS1-210ENST00000561256 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.8■■□□□ 1.56
USP3-AS1-210ENST00000561256 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.79■■□□□ 1.56
USP3-AS1-210ENST00000561256 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
USP3-AS1-210ENST00000561256 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
USP3-AS1-210ENST00000561256 AKAP12Q02952 1782 aa24.78■■□□□ 1.56
USP3-AS1-210ENST00000561256 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.77■■□□□ 1.56
USP3-AS1-210ENST00000561256 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
USP3-AS1-210ENST00000561256 BCL9O00512 1426 aa24.77■■□□□ 1.56
USP3-AS1-210ENST00000561256 RGPD5Q99666 1765 aa24.76■■□□□ 1.55
USP3-AS1-210ENST00000561256 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.76■■□□□ 1.55
USP3-AS1-210ENST00000561256 CASZ1Q86V15 1759 aa24.73■■□□□ 1.55
USP3-AS1-210ENST00000561256 EXOC5O00471 708 aa24.73■■□□□ 1.55
USP3-AS1-210ENST00000561256 PROM2Q8N271 834 aa24.73■■□□□ 1.55
USP3-AS1-210ENST00000561256 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
USP3-AS1-210ENST00000561256 NFAT5O94916 1531 aa24.71■■□□□ 1.55
USP3-AS1-210ENST00000561256 CCDC7Q96M83 1385 aa24.71■■□□□ 1.55
USP3-AS1-210ENST00000561256 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.71■■□□□ 1.55
USP3-AS1-210ENST00000561256 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZBTB7AO95365 584 aa24.7■■□□□ 1.54
USP3-AS1-210ENST00000561256 TXNRD1Q16881 649 aa24.7■■□□□ 1.54
USP3-AS1-210ENST00000561256 NEUROD1Q13562 356 aa24.69■■□□□ 1.54
USP3-AS1-210ENST00000561256 STK32BQ9NY57 414 aa24.69■■□□□ 1.54
USP3-AS1-210ENST00000561256 ABCC6O95255 1503 aa24.68■■□□□ 1.54
USP3-AS1-210ENST00000561256 TNS2Q63HR2 1409 aa24.67■■□□□ 1.54
USP3-AS1-210ENST00000561256 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.66■■□□□ 1.54
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC15A2Q16348 729 aa24.65■■□□□ 1.54
USP3-AS1-210ENST00000561256 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.65■■□□□ 1.54
USP3-AS1-210ENST00000561256 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
USP3-AS1-210ENST00000561256 MYOM1P52179 1685 aa24.64■■□□□ 1.53
USP3-AS1-210ENST00000561256 PTGER2P43116 358 aa24.62■■□□□ 1.53
USP3-AS1-210ENST00000561256 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.62■■□□□ 1.53
USP3-AS1-210ENST00000561256 USP31Q70CQ4 1352 aa24.62■■□□□ 1.53
USP3-AS1-210ENST00000561256 NHSQ6T4R5 1651 aa24.62■■□□□ 1.53
USP3-AS1-210ENST00000561256 ERBB3P21860 1342 aa24.61■■□□□ 1.53
USP3-AS1-210ENST00000561256 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.61■■□□□ 1.53
USP3-AS1-210ENST00000561256 NME9Q86XW9 330 aa24.6■■□□□ 1.53
USP3-AS1-210ENST00000561256 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.59■■□□□ 1.53
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMC1Q8TDI8 760 aa24.59■■□□□ 1.53
USP3-AS1-210ENST00000561256 USP54Q70EL1 1684 aa24.59■■□□□ 1.53
USP3-AS1-210ENST00000561256 IL2RBP14784 551 aa24.58■■□□□ 1.53
USP3-AS1-210ENST00000561256 MTFR1LQ9H019 292 aa24.58■■□□□ 1.53
USP3-AS1-210ENST00000561256 LTN1O94822 1766 aa24.57■■□□□ 1.52
USP3-AS1-210ENST00000561256 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
USP3-AS1-210ENST00000561256 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.57■■□□□ 1.52
USP3-AS1-210ENST00000561256 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.56■■□□□ 1.52
USP3-AS1-210ENST00000561256 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.56■■□□□ 1.52
USP3-AS1-210ENST00000561256 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
USP3-AS1-210ENST00000561256 SYT17Q9BSW7 474 aa24.55■■□□□ 1.52
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.52■■□□□ 1.52
USP3-AS1-210ENST00000561256 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
USP3-AS1-210ENST00000561256 BTAF1O14981 1849 aa24.51■■□□□ 1.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 PAPPAQ13219 1627 aa24.51■■□□□ 1.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.51■■□□□ 1.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.5■■□□□ 1.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 ARXQ96QS3 562 aa24.49■■□□□ 1.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.49■■□□□ 1.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 A0A1W2PP64 1363 aa24.48■■□□□ 1.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF827Q17R98 1081 aa24.47■■□□□ 1.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 IP6K1Q92551 441 aa24.45■■□□□ 1.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.45■■□□□ 1.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.42■■□□□ 1.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 MAP3K5Q99683 1374 aa24.42■■□□□ 1.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 TONSLQ96HA7 1378 aa24.41■■□□□ 1.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 UTRNP46939 3433 aa24.41■■□□□ 1.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 AKT1S1Q96B36 256 aa24.4■■□□□ 1.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 CHD4Q14839 1912 aa24.39■■□□□ 1.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 COG3Q96JB2 828 aa24.39■■□□□ 1.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 KLHL34Q8N239 644 aa24.38■■□□□ 1.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.38■■□□□ 1.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 POLD1P28340 1107 aa24.37■■□□□ 1.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.36■■□□□ 1.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.36■■□□□ 1.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 AMPHP49418 695 aa24.36■■□□□ 1.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 GPR162Q16538 588 aa24.36■■□□□ 1.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.36■■□□□ 1.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.35■■□□□ 1.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 HOXC9P31274 260 aa24.35■■□□□ 1.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.35■■□□□ 1.49
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