RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
TMOD3-209ENST00000561136 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa8.81□□□□□ -1
TMOD3-209ENST00000561136 GPR37O15354 613 aa8.81□□□□□ -1
TMOD3-209ENST00000561136 PTPRMP28827 1452 aa8.81□□□□□ -1
TMOD3-209ENST00000561136 KDM4AO75164 1064 aa8.8□□□□□ -1
TMOD3-209ENST00000561136 KCNMA1Q12791 1236 aa8.8□□□□□ -1
TMOD3-209ENST00000561136 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
TMOD3-209ENST00000561136 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa8.8□□□□□ -1
TMOD3-209ENST00000561136 ARID3CA6NKF2 412 aa8.79□□□□□ -1
TMOD3-209ENST00000561136 SOBPA7XYQ1 873 aa8.79□□□□□ -1
TMOD3-209ENST00000561136 CD46P15529 392 aa8.79□□□□□ -1
TMOD3-209ENST00000561136 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.79□□□□□ -1
TMOD3-209ENST00000561136 JUNDP17535 347 aa8.78□□□□□ -1
TMOD3-209ENST00000561136 GSK3AP49840 483 aa8.78□□□□□ -1
TMOD3-209ENST00000561136 P3H3Q8IVL6 736 aa8.78□□□□□ -1
TMOD3-209ENST00000561136 ABCA9Q8IUA7 1624 aa8.78□□□□□ -1
TMOD3-209ENST00000561136 CD109Q6YHK3 1445 aa8.78□□□□□ -1
TMOD3-209ENST00000561136 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa8.77□□□□□ -1
TMOD3-209ENST00000561136 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
TMOD3-209ENST00000561136 RICTORQ6R327 1708 aa8.77□□□□□ -1.01
TMOD3-209ENST00000561136 VSIG8P0DPA2 414 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-209ENST00000561136 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-209ENST00000561136 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-209ENST00000561136 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-209ENST00000561136 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-209ENST00000561136 SH3BP2P78314 561 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-209ENST00000561136 PLCB2Q00722 1185 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-209ENST00000561136 GUCA2AQ02747 115 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-209ENST00000561136 FBXO41Q8TF61 875 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-209ENST00000561136 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-209ENST00000561136 SCARF1Q14162 830 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-209ENST00000561136 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-209ENST00000561136 ARAP3Q8WWN8 1544 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-209ENST00000561136 TTC37Q6PGP7 1564 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-209ENST00000561136 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-209ENST00000561136 HOXA2O43364 376 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-209ENST00000561136 GDF11O95390 407 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-209ENST00000561136 USP46P62068 366 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-209ENST00000561136 NNTQ13423 1086 aa8.72□□□□□ -1.01
TMOD3-209ENST00000561136 SAMD9Q5K651 1589 aa8.72□□□□□ -1.01
TMOD3-209ENST00000561136 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa8.72□□□□□ -1.01
TMOD3-209ENST00000561136 HSPA2P54652 639 aa8.71□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 RASSF7Q02833 373 aa8.71□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 LINC01559Q495D7 138 aa8.71□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa8.7□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 ATP10BO94823 1461 aa8.7□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 RAPGEF3O95398 923 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 TIMP2P16035 220 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 ILDR2Q71H61 639 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 MAN1A2O60476 641 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 BAP1Q92560 729 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 YEATS2Q9ULM3 1422 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 ADH1CP00326 375 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 GOLGA3Q08378 1498 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 STRCQ7RTU9 1775 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 RETREG3Q86VR2 466 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 PPFIA3O75145 1194 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 PREX1Q8TCU6 1659 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 PRXQ9BXM0 1461 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 MS4A1P11836 297 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 GPIHBP1Q8IV16 184 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-209ENST00000561136 HECW1Q76N89 1606 aa8.65□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 NEO1Q92859 1461 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 ADAMTS8Q9UP79 889 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 FHOD3Q2V2M9 1422 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 C6orf229H3BNL8 230 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF511Q8NB15 262 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 CFAP74Q9C0B2 1584 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 KRT76Q01546 638 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 MPNDQ8N594 471 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 KIF14Q15058 1648 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 DISP3Q9P2K9 1392 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 EFCAB5A4FU69 1503 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 FANCAO15360 1455 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms