RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559898.5

HDDC3-205, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,024 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-205ENST00000559898 LRRC37A3O60309 1634 aa25.07■■□□□ 1.6
HDDC3-205ENST00000559898 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.07■■□□□ 1.6
HDDC3-205ENST00000559898 USP31Q70CQ4 1352 aa25.06■■□□□ 1.6
HDDC3-205ENST00000559898 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa25.05■■□□□ 1.6
HDDC3-205ENST00000559898 USP47Q96K76 1375 aa25.05■■□□□ 1.6
HDDC3-205ENST00000559898 BAG6P46379 1132 aa25.04■■□□□ 1.6
HDDC3-205ENST00000559898 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.04■■□□□ 1.6
HDDC3-205ENST00000559898 WDR17Q8IZU2 1322 aa25.04■■□□□ 1.6
HDDC3-205ENST00000559898 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
HDDC3-205ENST00000559898 PEAK1Q9H792 1746 aa25.03■■□□□ 1.6
HDDC3-205ENST00000559898 PDE3BQ13370 1112 aa25.03■■□□□ 1.6
HDDC3-205ENST00000559898 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
HDDC3-205ENST00000559898 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
HDDC3-205ENST00000559898 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
HDDC3-205ENST00000559898 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
HDDC3-205ENST00000559898 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.02■■□□□ 1.6
HDDC3-205ENST00000559898 FBLN1P23142 703 aa25■■□□□ 1.59
HDDC3-205ENST00000559898 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
HDDC3-205ENST00000559898 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa25■■□□□ 1.59
HDDC3-205ENST00000559898 OVOS2Q6IE36 1432 aa25■■□□□ 1.59
HDDC3-205ENST00000559898 SBF2Q86WG5 1849 aa25■■□□□ 1.59
HDDC3-205ENST00000559898 DISP2A7MBM2 1401 aa24.99■■□□□ 1.59
HDDC3-205ENST00000559898 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.98■■□□□ 1.59
HDDC3-205ENST00000559898 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.98■■□□□ 1.59
HDDC3-205ENST00000559898 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.98■■□□□ 1.59
HDDC3-205ENST00000559898 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.97■■□□□ 1.59
HDDC3-205ENST00000559898 APBA3O96018 575 aa24.96■■□□□ 1.59
HDDC3-205ENST00000559898 RREB1Q92766 1687 aa24.94■■□□□ 1.58
HDDC3-205ENST00000559898 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
HDDC3-205ENST00000559898 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.94■■□□□ 1.58
HDDC3-205ENST00000559898 ABCC6O95255 1503 aa24.94■■□□□ 1.58
HDDC3-205ENST00000559898 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.93■■□□□ 1.58
HDDC3-205ENST00000559898 DDB1Q16531 1140 aa24.93■■□□□ 1.58
HDDC3-205ENST00000559898 MYOM1P52179 1685 aa24.93■■□□□ 1.58
HDDC3-205ENST00000559898 ERBB3P21860 1342 aa24.91■■□□□ 1.58
HDDC3-205ENST00000559898 TMF1P82094 1093 aa24.91■■□□□ 1.58
HDDC3-205ENST00000559898 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.91■■□□□ 1.58
HDDC3-205ENST00000559898 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.9■■□□□ 1.58
HDDC3-205ENST00000559898 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
HDDC3-205ENST00000559898 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.9■■□□□ 1.58
HDDC3-205ENST00000559898 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.9■■□□□ 1.58
HDDC3-205ENST00000559898 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.89■■□□□ 1.58
HDDC3-205ENST00000559898 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.87■■□□□ 1.57
HDDC3-205ENST00000559898 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.86■■□□□ 1.57
HDDC3-205ENST00000559898 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.86■■□□□ 1.57
HDDC3-205ENST00000559898 CCDC7Q96M83 1385 aa24.85■■□□□ 1.57
HDDC3-205ENST00000559898 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
HDDC3-205ENST00000559898 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.85■■□□□ 1.57
HDDC3-205ENST00000559898 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.84■■□□□ 1.57
HDDC3-205ENST00000559898 FYB1O15117 783 aa24.84■■□□□ 1.57
HDDC3-205ENST00000559898 COG3Q96JB2 828 aa24.84■■□□□ 1.57
HDDC3-205ENST00000559898 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.84■■□□□ 1.57
HDDC3-205ENST00000559898 LRP5O75197 1615 aa24.83■■□□□ 1.57
HDDC3-205ENST00000559898 IP6K1Q92551 441 aa24.83■■□□□ 1.57
HDDC3-205ENST00000559898 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.83■■□□□ 1.57
HDDC3-205ENST00000559898 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
HDDC3-205ENST00000559898 TNS2Q63HR2 1409 aa24.82■■□□□ 1.56
HDDC3-205ENST00000559898 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
HDDC3-205ENST00000559898 EXOC5O00471 708 aa24.8■■□□□ 1.56
HDDC3-205ENST00000559898 HOXC9P31274 260 aa24.8■■□□□ 1.56
HDDC3-205ENST00000559898 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
HDDC3-205ENST00000559898 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
HDDC3-205ENST00000559898 KCNQ2O43526 872 aa24.79■■□□□ 1.56
HDDC3-205ENST00000559898 SLC24A1O60721 1099 aa24.79■■□□□ 1.56
HDDC3-205ENST00000559898 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.79■■□□□ 1.56
HDDC3-205ENST00000559898 IL2RBP14784 551 aa24.77■■□□□ 1.56
HDDC3-205ENST00000559898 PROM2Q8N271 834 aa24.77■■□□□ 1.56
HDDC3-205ENST00000559898 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.77■■□□□ 1.56
HDDC3-205ENST00000559898 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
HDDC3-205ENST00000559898 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
HDDC3-205ENST00000559898 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.77■■□□□ 1.56
HDDC3-205ENST00000559898 BCL9O00512 1426 aa24.77■■□□□ 1.56
HDDC3-205ENST00000559898 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.76■■□□□ 1.55
HDDC3-205ENST00000559898 AMPHP49418 695 aa24.75■■□□□ 1.55
HDDC3-205ENST00000559898 NHSQ6T4R5 1651 aa24.75■■□□□ 1.55
HDDC3-205ENST00000559898 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.75■■□□□ 1.55
HDDC3-205ENST00000559898 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
HDDC3-205ENST00000559898 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
HDDC3-205ENST00000559898 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.73■■□□□ 1.55
HDDC3-205ENST00000559898 PLSCR1O15162 318 aa24.72■■□□□ 1.55
HDDC3-205ENST00000559898 CDCA8Q53HL2 280 aa24.72■■□□□ 1.55
HDDC3-205ENST00000559898 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.72■■□□□ 1.55
HDDC3-205ENST00000559898 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
HDDC3-205ENST00000559898 MEGF6O75095 1541 aa24.71■■□□□ 1.55
HDDC3-205ENST00000559898 BTAF1O14981 1849 aa24.7■■□□□ 1.54
HDDC3-205ENST00000559898 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.69■■□□□ 1.54
HDDC3-205ENST00000559898 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.69■■□□□ 1.54
HDDC3-205ENST00000559898 NBPF4Q96M43 638 aa24.69■■□□□ 1.54
HDDC3-205ENST00000559898 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
HDDC3-205ENST00000559898 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.69■■□□□ 1.54
HDDC3-205ENST00000559898 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.68■■□□□ 1.54
HDDC3-205ENST00000559898 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
HDDC3-205ENST00000559898 RTL1A6NKG5 1358 aa24.67■■□□□ 1.54
HDDC3-205ENST00000559898 NBPF14Q5TI25 921 aa24.66■■□□□ 1.54
HDDC3-205ENST00000559898 TXNRD1Q16881 649 aa24.65■■□□□ 1.54
HDDC3-205ENST00000559898 CASZ1Q86V15 1759 aa24.65■■□□□ 1.54
HDDC3-205ENST00000559898 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
HDDC3-205ENST00000559898 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.64■■□□□ 1.54
HDDC3-205ENST00000559898 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.64■■□□□ 1.53
HDDC3-205ENST00000559898 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms