RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558550.1

EFTUD1P1-202, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD1P1, Length 418 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MAP3K19Q56UN5 1328 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 UNC5CLQ8IV45 518 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IP6K1Q92551 441 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SLIT2O94813 1529 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LMO7Q8WWI1 1683 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 POLKQ9UBT6 870 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 AXIN2Q9Y2T1 843 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NRAPQ86VF7 1730 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 BCL9LQ86UU0 1499 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 HOXC9P31274 260 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PEAK1Q9H792 1746 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ABCC6O95255 1503 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RTL1A6NKG5 1358 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FLT4P35916 1363 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MTHFSP49914 203 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 VPS72Q15906 364 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ANKRD24Q8TF21 1146 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KIF24Q5T7B8 1368 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RGPD2P0DJD1 1756 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RALBP1Q15311 655 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 POTEAQ6S8J7 498 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NLRP2Q9NX02 1062 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 USP35Q9P2H5 1018 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 WDR17Q8IZU2 1322 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 INSRP06213 1382 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PARD3Q8TEW0 1356 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ATRNO75882 1429 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PPP2R1AP30153 589 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ERBB3P21860 1342 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CRB1P82279 1406 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ANP32CO43423 234 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RXRBP28702 533 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CFAP53Q96M91 514 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 A0A0G2JS52 829 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MYT1Q01538 1121 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CARD10Q9BWT7 1032 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GLI3P10071 1580 aa9.46□□□□□ -0.89
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TCP11L2Q8N4U5 519 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NBPF6Q5VWK0 638 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 USHBP1Q8N6Y0 703 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NBPF4Q96M43 638 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 EYA1Q99502 592 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NUDCQ9Y266 331 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 WNK3Q9BYP7 1800 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 BRWD3Q6RI45 1802 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IL13P35225 146 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 BARGINQ6ZT62 677 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SEPT12Q8IYM1 358 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IL2RBP14784 551 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TATP17735 454 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IGSF1Q8N6C5 1336 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SULT6B1Q6IMI4 303 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RGPD1P0DJD0 1748 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KAT6BQ8WYB5 2073 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RGS12O14924 1447 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 EXOC5O00471 708 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 HMOX1P09601 288 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PDE3BQ13370 1112 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DDB1Q16531 1140 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 AEBP1Q8IUX7 1158 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD1P1-202ENST00000558550 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms