RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553786.1

PRRX1-208, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene PRRX1, Length 529 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-208ENST00000553786 COL18A1P39060 1754 aa24.12■■□□□ 1.45
PRRX1-208ENST00000553786 YY1P25490 414 aa24.12■■□□□ 1.45
PRRX1-208ENST00000553786 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.12■■□□□ 1.45
PRRX1-208ENST00000553786 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.12■■□□□ 1.45
PRRX1-208ENST00000553786 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.12■■□□□ 1.45
PRRX1-208ENST00000553786 SOX12O15370 315 aa24.11■■□□□ 1.45
PRRX1-208ENST00000553786 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
PRRX1-208ENST00000553786 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
PRRX1-208ENST00000553786 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.11■■□□□ 1.45
PRRX1-208ENST00000553786 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.1■■□□□ 1.45
PRRX1-208ENST00000553786 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.1■■□□□ 1.45
PRRX1-208ENST00000553786 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.1■■□□□ 1.45
PRRX1-208ENST00000553786 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.1■■□□□ 1.45
PRRX1-208ENST00000553786 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PRRX1-208ENST00000553786 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.1■■□□□ 1.45
PRRX1-208ENST00000553786 SBF2Q86WG5 1849 aa24.1■■□□□ 1.45
PRRX1-208ENST00000553786 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PRRX1-208ENST00000553786 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.08■■□□□ 1.45
PRRX1-208ENST00000553786 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
PRRX1-208ENST00000553786 BCL9O00512 1426 aa24.08■■□□□ 1.44
PRRX1-208ENST00000553786 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.08■■□□□ 1.44
PRRX1-208ENST00000553786 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.07■■□□□ 1.44
PRRX1-208ENST00000553786 AKAP12Q02952 1782 aa24.06■■□□□ 1.44
PRRX1-208ENST00000553786 NFAT5O94916 1531 aa24.05■■□□□ 1.44
PRRX1-208ENST00000553786 CASZ1Q86V15 1759 aa24.04■■□□□ 1.44
PRRX1-208ENST00000553786 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PRRX1-208ENST00000553786 CCDC7Q96M83 1385 aa24.03■■□□□ 1.44
PRRX1-208ENST00000553786 PROM2Q8N271 834 aa24.02■■□□□ 1.44
PRRX1-208ENST00000553786 TNS2Q63HR2 1409 aa24.01■■□□□ 1.43
PRRX1-208ENST00000553786 ABCC6O95255 1503 aa24.01■■□□□ 1.43
PRRX1-208ENST00000553786 EXOC5O00471 708 aa24.01■■□□□ 1.43
PRRX1-208ENST00000553786 ZBTB7AO95365 584 aa24.01■■□□□ 1.43
PRRX1-208ENST00000553786 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
PRRX1-208ENST00000553786 RGPD5Q99666 1765 aa24.01■■□□□ 1.43
PRRX1-208ENST00000553786 TXNRD1Q16881 649 aa24■■□□□ 1.43
PRRX1-208ENST00000553786 SIN3AQ96ST3 1273 aa24■■□□□ 1.43
PRRX1-208ENST00000553786 STK32BQ9NY57 414 aa23.99■■□□□ 1.43
PRRX1-208ENST00000553786 NEUROD1Q13562 356 aa23.97■■□□□ 1.43
PRRX1-208ENST00000553786 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.43
PRRX1-208ENST00000553786 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.96■■□□□ 1.43
PRRX1-208ENST00000553786 MYOM1P52179 1685 aa23.95■■□□□ 1.43
PRRX1-208ENST00000553786 ERBB3P21860 1342 aa23.94■■□□□ 1.42
PRRX1-208ENST00000553786 PTGER2P43116 358 aa23.94■■□□□ 1.42
PRRX1-208ENST00000553786 SLC15A2Q16348 729 aa23.94■■□□□ 1.42
PRRX1-208ENST00000553786 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
PRRX1-208ENST00000553786 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.93■■□□□ 1.42
PRRX1-208ENST00000553786 NHSQ6T4R5 1651 aa23.92■■□□□ 1.42
PRRX1-208ENST00000553786 USP31Q70CQ4 1352 aa23.92■■□□□ 1.42
PRRX1-208ENST00000553786 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.92■■□□□ 1.42
PRRX1-208ENST00000553786 NME9Q86XW9 330 aa23.92■■□□□ 1.42
PRRX1-208ENST00000553786 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.91■■□□□ 1.42
PRRX1-208ENST00000553786 USP54Q70EL1 1684 aa23.89■■□□□ 1.42
PRRX1-208ENST00000553786 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.89■■□□□ 1.42
PRRX1-208ENST00000553786 IL2RBP14784 551 aa23.89■■□□□ 1.41
PRRX1-208ENST00000553786 MTFR1LQ9H019 292 aa23.89■■□□□ 1.41
PRRX1-208ENST00000553786 TMC1Q8TDI8 760 aa23.88■■□□□ 1.41
PRRX1-208ENST00000553786 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
PRRX1-208ENST00000553786 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
PRRX1-208ENST00000553786 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.86■■□□□ 1.41
PRRX1-208ENST00000553786 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.86■■□□□ 1.41
PRRX1-208ENST00000553786 LTN1O94822 1766 aa23.86■■□□□ 1.41
PRRX1-208ENST00000553786 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
PRRX1-208ENST00000553786 SYT17Q9BSW7 474 aa23.85■■□□□ 1.41
PRRX1-208ENST00000553786 PAPPAQ13219 1627 aa23.84■■□□□ 1.41
PRRX1-208ENST00000553786 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.83■■□□□ 1.41
PRRX1-208ENST00000553786 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.82■■□□□ 1.4
PRRX1-208ENST00000553786 A0A1W2PP64 1363 aa23.81■■□□□ 1.4
PRRX1-208ENST00000553786 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.81■■□□□ 1.4
PRRX1-208ENST00000553786 BTAF1O14981 1849 aa23.81■■□□□ 1.4
PRRX1-208ENST00000553786 ZNF827Q17R98 1081 aa23.79■■□□□ 1.4
PRRX1-208ENST00000553786 ARXQ96QS3 562 aa23.79■■□□□ 1.4
PRRX1-208ENST00000553786 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
PRRX1-208ENST00000553786 UTRNP46939 3433 aa23.77■■□□□ 1.4
PRRX1-208ENST00000553786 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.76■■□□□ 1.39
PRRX1-208ENST00000553786 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PRRX1-208ENST00000553786 IP6K1Q92551 441 aa23.75■■□□□ 1.39
PRRX1-208ENST00000553786 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
PRRX1-208ENST00000553786 MAP3K5Q99683 1374 aa23.75■■□□□ 1.39
PRRX1-208ENST00000553786 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PRRX1-208ENST00000553786 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.72■■□□□ 1.39
PRRX1-208ENST00000553786 TONSLQ96HA7 1378 aa23.72■■□□□ 1.39
PRRX1-208ENST00000553786 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
PRRX1-208ENST00000553786 AKT1S1Q96B36 256 aa23.7■■□□□ 1.38
PRRX1-208ENST00000553786 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PRRX1-208ENST00000553786 KLHL34Q8N239 644 aa23.69■■□□□ 1.38
PRRX1-208ENST00000553786 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.69■■□□□ 1.38
PRRX1-208ENST00000553786 COG3Q96JB2 828 aa23.69■■□□□ 1.38
PRRX1-208ENST00000553786 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.69■■□□□ 1.38
PRRX1-208ENST00000553786 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.68■■□□□ 1.38
PRRX1-208ENST00000553786 POLD1P28340 1107 aa23.68■■□□□ 1.38
PRRX1-208ENST00000553786 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.67■■□□□ 1.38
PRRX1-208ENST00000553786 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.67■■□□□ 1.38
PRRX1-208ENST00000553786 AMPHP49418 695 aa23.67■■□□□ 1.38
PRRX1-208ENST00000553786 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.67■■□□□ 1.38
PRRX1-208ENST00000553786 HOXC9P31274 260 aa23.66■■□□□ 1.38
PRRX1-208ENST00000553786 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
PRRX1-208ENST00000553786 GPR162Q16538 588 aa23.66■■□□□ 1.38
PRRX1-208ENST00000553786 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.65■■□□□ 1.38
PRRX1-208ENST00000553786 KCNQ4P56696 695 aa23.65■■□□□ 1.38
PRRX1-208ENST00000553786 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms