RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
CS-217ENST00000550044 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
CS-217ENST00000550044 CABLES1Q8TDN4 633 aa13.97□□□□□ -0.17
CS-217ENST00000550044 SIN3AQ96ST3 1273 aa13.97□□□□□ -0.17
CS-217ENST00000550044 PCGF6Q9BYE7 350 aa13.97□□□□□ -0.17
CS-217ENST00000550044 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
CS-217ENST00000550044 FMN2Q9NZ56 1722 aa13.97□□□□□ -0.17
CS-217ENST00000550044 NEUROD1Q13562 356 aa13.96□□□□□ -0.17
CS-217ENST00000550044 TMEM132EQ6IEE7 984 aa13.96□□□□□ -0.17
CS-217ENST00000550044 TNS3Q68CZ2 1445 aa13.96□□□□□ -0.18
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CS-217ENST00000550044 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
CS-217ENST00000550044 CFAP70Q5T0N1 1121 aa13.95□□□□□ -0.18
CS-217ENST00000550044 FAM182BQ5T319 152 aa13.95□□□□□ -0.18
CS-217ENST00000550044 KRT28Q7Z3Y7 464 aa13.95□□□□□ -0.18
CS-217ENST00000550044 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa13.95□□□□□ -0.18
CS-217ENST00000550044 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa13.95□□□□□ -0.18
CS-217ENST00000550044 STK26Q9P289 416 aa13.95□□□□□ -0.18
CS-217ENST00000550044 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP13.94□□□□□ -0.183e-6■□□□□ 8.1
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CS-217ENST00000550044 WAPLQ7Z5K2 1190 aa13.93□□□□□ -0.18
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CS-217ENST00000550044 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
CS-217ENST00000550044 DISP2A7MBM2 1401 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-217ENST00000550044 LMOD2Q6P5Q4 547 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-217ENST00000550044 IFT172Q9UG01 1749 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-217ENST00000550044 ADGRB2O60241 1585 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-217ENST00000550044 KNDC1Q76NI1 1749 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-217ENST00000550044 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
CS-217ENST00000550044 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-217ENST00000550044 PIK3C2GO75747 1445 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-217ENST00000550044 GSE1Q14687 1217 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-217ENST00000550044 TECPR2O15040 1411 aa13.9□□□□□ -0.19
CS-217ENST00000550044 POTEB3A0JP26 581 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-217ENST00000550044 FAM83GA6ND36 823 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-217ENST00000550044 POTEBQ6S5H4 581 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-217ENST00000550044 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa13.88□□□□□ -0.19
CS-217ENST00000550044 ARHGEF10O15013 1369 aa13.88□□□□□ -0.19
CS-217ENST00000550044 PSME1Q06323 249 aa13.88□□□□□ -0.19
CS-217ENST00000550044 L3MBTL2Q969R5 705 aa13.88□□□□□ -0.19
CS-217ENST00000550044 STAC3Q96MF2 364 aa13.88□□□□□ -0.19
CS-217ENST00000550044 BTG4Q9NY30 223 aa13.88□□□□□ -0.19
CS-217ENST00000550044 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
CS-217ENST00000550044 G3V3G9 751 aa13.87□□□□□ -0.19
CS-217ENST00000550044 PHF8Q9UPP1 1060 aa13.87□□□□□ -0.19
CS-217ENST00000550044 NRXN1Q9ULB1 1477 aa13.87□□□□□ -0.19
CS-217ENST00000550044 SBNO1A3KN83 1393 aa13.86□□□□□ -0.19
CS-217ENST00000550044 RREB1Q92766 1687 aa13.86□□□□□ -0.19
CS-217ENST00000550044 NUP188Q5SRE5 1749 aa13.86□□□□□ -0.19
CS-217ENST00000550044 TRIM37O94972 964 aa13.85□□□□□ -0.19
CS-217ENST00000550044 CAMKK2Q96RR4 588 aa13.85□□□□□ -0.19
CS-217ENST00000550044 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
CS-217ENST00000550044 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa13.85□□□□□ -0.19
CS-217ENST00000550044 ABCC11Q96J66 1382 aa13.84□□□□□ -0.19
CS-217ENST00000550044 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
CS-217ENST00000550044 FBXO3Q9UK99 471 aa13.84□□□□□ -0.19
CS-217ENST00000550044 TRAK1Q9UPV9 953 aa13.84□□□□□ -0.19
CS-217ENST00000550044 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP13.83□□□□□ -0.2
CS-217ENST00000550044 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-217ENST00000550044 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-217ENST00000550044 PARD3Q8TEW0 1356 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-217ENST00000550044 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
CS-217ENST00000550044 APBA3O96018 575 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-217ENST00000550044 PSEN1P49768 467 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-217ENST00000550044 NBPF1Q3BBV0 1214 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-217ENST00000550044 ZNF710Q8N1W2 664 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-217ENST00000550044 KLHL34Q8N239 644 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-217ENST00000550044 PRAM1Q96QH2 718 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-217ENST00000550044 POGKQ9P215 609 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-217ENST00000550044 ALS2Q96Q42 1657 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-217ENST00000550044 NINLQ9Y2I6 1382 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-217ENST00000550044 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa13.8□□□□□ -0.2
CS-217ENST00000550044 SIRT1Q96EB6 747 aa13.8□□□□□ -0.2
CS-217ENST00000550044 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa13.79□□□□□ -0.2
CS-217ENST00000550044 PLCB2Q00722 1185 aa13.79□□□□□ -0.2
CS-217ENST00000550044 FAM196AQ6ZSG2 479 aa13.79□□□□□ -0.2
CS-217ENST00000550044 SPON1Q9HCB6 807 aa13.79□□□□□ -0.2
CS-217ENST00000550044 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
CS-217ENST00000550044 NBPF8Q3BBV2 869 aa13.78□□□□□ -0.2
CS-217ENST00000550044 NBPF14Q5TI25 921 aa13.78□□□□□ -0.2
CS-217ENST00000550044 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-217ENST00000550044 KCNQ2O43526 872 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-217ENST00000550044 PRDM11Q9NQV5 511 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-217ENST00000550044 ADGRB1O14514 1584 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-217ENST00000550044 TONSLQ96HA7 1378 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-217ENST00000550044 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-217ENST00000550044 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
CS-217ENST00000550044 UTRNP46939 3433 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-217ENST00000550044 ERBB3P21860 1342 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-217ENST00000550044 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
CS-217ENST00000550044 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
CS-217ENST00000550044 NRKQ7Z2Y5 1582 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-217ENST00000550044 ANKARQ7Z5J8 1434 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-217ENST00000550044 GPRASP1Q5JY77 1395 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-217ENST00000550044 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
CS-217ENST00000550044 STRN4Q9NRL3 753 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-217ENST00000550044 USP35Q9P2H5 1018 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-217ENST00000550044 BOLA1Q9Y3E2 137 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-217ENST00000550044 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
CS-217ENST00000550044 DOK7Q18PE1 504 aa13.73□□□□□ -0.21
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