RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547605.5

RBFOX1-210, Transcript of RNA binding fox-1 homolog 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBFOX1, Length 1,811 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX1-210ENST00000547605 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
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RBFOX1-210ENST00000547605 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
RBFOX1-210ENST00000547605 ARHGEF25Q86VW2 580 aa29.23■■■□□ 2.27
RBFOX1-210ENST00000547605 RTL1A6NKG5 1358 aa29.23■■■□□ 2.27
RBFOX1-210ENST00000547605 IP6K1Q92551 441 aa29.21■■■□□ 2.27
RBFOX1-210ENST00000547605 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa29.2■■■□□ 2.27
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RBFOX1-210ENST00000547605 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
RBFOX1-210ENST00000547605 HMOX1P09601 288 aa29.15■■■□□ 2.26
RBFOX1-210ENST00000547605 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
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RBFOX1-210ENST00000547605 APAF1O14727 1248 aa29.12■■■□□ 2.25
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RBFOX1-210ENST00000547605 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.1■■■□□ 2.25
RBFOX1-210ENST00000547605 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.1■■■□□ 2.25
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RBFOX1-210ENST00000547605 AEBP1Q8IUX7 1158 aa29.06■■■□□ 2.24
RBFOX1-210ENST00000547605 IGSF1Q8N6C5 1336 aa29.04■■■□□ 2.24
RBFOX1-210ENST00000547605 NEUROD2Q15784 382 aa29.04■■■□□ 2.24
RBFOX1-210ENST00000547605 COL18A1P39060 1754 aa29.03■■■□□ 2.24
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RBFOX1-210ENST00000547605 PDE3BQ13370 1112 aa28.9■■■□□ 2.22
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RBFOX1-210ENST00000547605 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.87■■■□□ 2.21
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RBFOX1-210ENST00000547605 TATP17735 454 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
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RBFOX1-210ENST00000547605 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.77■■■□□ 2.2
RBFOX1-210ENST00000547605 E9PSI1 815 aa28.76■■■□□ 2.19
RBFOX1-210ENST00000547605 SLFN5Q08AF3 891 aa28.76■■■□□ 2.19
RBFOX1-210ENST00000547605 AMOTQ4VCS5 1084 aa28.76■■■□□ 2.19
RBFOX1-210ENST00000547605 C8orf37Q96NL8 207 aa28.75■■■□□ 2.19
RBFOX1-210ENST00000547605 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
RBFOX1-210ENST00000547605 USP35Q9P2H5 1018 aa28.75■■■□□ 2.19
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