RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546279.5

LMO3-233, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 590 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-233ENST00000546279 NWD2Q9ULI1 1742 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO3-233ENST00000546279 TTC21AQ8NDW8 1320 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO3-233ENST00000546279 ARHGEF10O15013 1369 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-233ENST00000546279 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LMO3-233ENST00000546279 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LMO3-233ENST00000546279 PANK3Q9H999 370 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-233ENST00000546279 DISP2A7MBM2 1401 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-233ENST00000546279 FAM83GA6ND36 823 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO3-233ENST00000546279 CABLES1Q8TDN4 633 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO3-233ENST00000546279 LTN1O94822 1766 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO3-233ENST00000546279 LMO7Q8WWI1 1683 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO3-233ENST00000546279 LMOD2Q6P5Q4 547 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO3-233ENST00000546279 NME9Q86XW9 330 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO3-233ENST00000546279 RGPD5Q99666 1765 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO3-233ENST00000546279 RGPD1P0DJD0 1748 aa14.72□□□□□ -0.05
LMO3-233ENST00000546279 PLCH1Q4KWH8 1693 aa14.72□□□□□ -0.05
LMO3-233ENST00000546279 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
LMO3-233ENST00000546279 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LMO3-233ENST00000546279 FYB1O15117 783 aa14.72□□□□□ -0.05
LMO3-233ENST00000546279 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.72□□□□□ -0.05
LMO3-233ENST00000546279 POLR3GLQ9BT43 218 aa14.72□□□□□ -0.05
LMO3-233ENST00000546279 PARD3Q8TEW0 1356 aa14.72□□□□□ -0.05
LMO3-233ENST00000546279 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LMO3-233ENST00000546279 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
LMO3-233ENST00000546279 NRAPQ86VF7 1730 aa14.71□□□□□ -0.05
LMO3-233ENST00000546279 PEAK1Q9H792 1746 aa14.71□□□□□ -0.05
LMO3-233ENST00000546279 PLEKHG5O94827 1062 aa14.7□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 BTG4Q9NY30 223 aa14.7□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa14.7□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 NBPF14Q5TI25 921 aa14.69□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 NUTM2GQ5VZR2 741 aa14.69□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 FAM196AQ6ZSG2 479 aa14.69□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 ABTB2Q8N961 1025 aa14.69□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 CAMKK2Q96RR4 588 aa14.69□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 CPDO75976 1380 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 NSD2O96028 1365 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 APBA3O96018 575 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 NLRP6P59044 892 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 FAM182BQ5T319 152 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 GGNBP2Q9H3C7 697 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 ABCC6O95255 1503 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 TRIM37O94972 964 aa14.65□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 GCP02774 474 aa14.65□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 NLRP13Q86W25 1043 aa14.65□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 RNF39Q9H2S5 420 aa14.65□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 SPON1Q9HCB6 807 aa14.65□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 CGNL1Q0VF96 1302 aa14.65□□□□□ -0.06
LMO3-233ENST00000546279 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LMO3-233ENST00000546279 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LMO3-233ENST00000546279 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-233ENST00000546279 FBLN1P23142 703 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO3-233ENST00000546279 RGPD2P0DJD1 1756 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-233ENST00000546279 KIAA0232Q92628 1395 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-233ENST00000546279 KCNQ2O43526 872 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-233ENST00000546279 ARHGEF25Q86VW2 580 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-233ENST00000546279 AATKQ6ZMQ8 1374 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO3-233ENST00000546279 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LMO3-233ENST00000546279 KNSTRNQ9Y448 316 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO3-233ENST00000546279 PDE3BQ13370 1112 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-233ENST00000546279 COG3Q96JB2 828 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-233ENST00000546279 PRDM11Q9NQV5 511 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-233ENST00000546279 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-233ENST00000546279 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-233ENST00000546279 WNK3Q9BYP7 1800 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-233ENST00000546279 KCNH5Q8NCM2 988 aa14.58□□□□□ -0.08
LMO3-233ENST00000546279 MAP3K19Q56UN5 1328 aa14.58□□□□□ -0.08
LMO3-233ENST00000546279 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LMO3-233ENST00000546279 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
LMO3-233ENST00000546279 AXIN2Q9Y2T1 843 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-233ENST00000546279 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LMO3-233ENST00000546279 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LMO3-233ENST00000546279 CHRNA2Q15822 529 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-233ENST00000546279 POLKQ9UBT6 870 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-233ENST00000546279 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
LMO3-233ENST00000546279 BARGINQ6ZT62 677 aa14.55□□□□□ -0.08
LMO3-233ENST00000546279 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa14.55□□□□□ -0.08
LMO3-233ENST00000546279 RTL1A6NKG5 1358 aa14.55□□□□□ -0.08
LMO3-233ENST00000546279 KIF24Q5T7B8 1368 aa14.55□□□□□ -0.08
LMO3-233ENST00000546279 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LMO3-233ENST00000546279 IFFO2Q5TF58 517 aa14.54□□□□□ -0.08
LMO3-233ENST00000546279 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LMO3-233ENST00000546279 RREB1Q92766 1687 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO3-233ENST00000546279 INSRP06213 1382 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO3-233ENST00000546279 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO3-233ENST00000546279 SOX12O15370 315 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO3-233ENST00000546279 EVA1CP58658 441 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO3-233ENST00000546279 MORC1Q86VD1 984 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO3-233ENST00000546279 STRN4Q9NRL3 753 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO3-233ENST00000546279 NCAPD2Q15021 1401 aa14.52□□□□□ -0.08
LMO3-233ENST00000546279 HOXC9P31274 260 aa14.52□□□□□ -0.09
LMO3-233ENST00000546279 IP6K1Q92551 441 aa14.52□□□□□ -0.09
LMO3-233ENST00000546279 FLT4P35916 1363 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms