RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546048.5

MDM2-234, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5

Gene MDM2, Length 363 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-234	ENST00000546048	FOSB	P53539	338 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	MAP3K9	P80192	1104 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	KCNK17	Q96T54	332 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	DIP2A	Q14689	1571 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	BRINP3	Q76B58	766 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	C14orf37	Q86TY3	774 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	MSH6	P52701	1360 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	DPYSL4	O14531	572 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	ORAI2	Q96SN7	254 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	PPL	O60437	1756 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	KIF1B	O60333	1816 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	PTGER2	P43116	358 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	ABCC11	Q96J66	1382 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	MST1R	Q04912	1400 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	NUTM2F	A1L443	756 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	ATF3	P18847	181 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	7.4	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	PTCH1	Q13635	1447 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MDM2-234	ENST00000546048	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	MYOM2	P54296	1465 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	NEUROD1	Q13562	356 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	IFT172	Q9UG01	1749 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	ADGRB1	O14514	1584 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	TECPR2	O15040	1411 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	PRAM1	Q96QH2	718 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	TK2	O00142	265 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	DCC	P43146	1447 aa		7.36	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	HR	O43593	1189 aa		7.36	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	PTPRE	P23469	700 aa		7.36	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	SIRT1	Q96EB6	747 aa		7.36	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	PDIA6	Q15084	440 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	POTEA	Q6S8J7	498 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	LRP6	O75581	1613 aa		7.34	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	FOXO3	O43524	673 aa		7.34	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	PHF14	O94880	888 aa		7.34	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	E2F4	Q16254	413 aa		7.34	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		7.34	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		7.34	□□□□□ -1.23
MDM2-234	ENST00000546048	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.24
MDM2-234	ENST00000546048	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
MDM2-234	ENST00000546048	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		7.33	□□□□□ -1.24
MDM2-234	ENST00000546048	DDX12P	Q92771	950 aa		7.33	□□□□□ -1.24
MDM2-234	ENST00000546048	POGK	Q9P215	609 aa		7.33	□□□□□ -1.24
MDM2-234	ENST00000546048	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
MDM2-234	ENST00000546048	JCAD	Q9P266	1359 aa		7.33	□□□□□ -1.24
MDM2-234	ENST00000546048	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MDM2-234	ENST00000546048	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MDM2-234	ENST00000546048	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MDM2-234	ENST00000546048	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MDM2-234	ENST00000546048	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MDM2-234	ENST00000546048	WDR70	Q9NW82	654 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MDM2-234	ENST00000546048	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MDM2-234	ENST00000546048	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MDM2-234	ENST00000546048	PHLPP1	O60346	1717 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MDM2-234	ENST00000546048	COL9A1	P20849	921 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MDM2-234	ENST00000546048	FBXW7	Q969H0	707 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MDM2-234	ENST00000546048	STAC3	Q96MF2	364 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MDM2-234	ENST00000546048	DLC1	Q96QB1	1528 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MDM2-234	ENST00000546048	PXDN	Q92626	1479 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MDM2-234	ENST00000546048	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MDM2-234	ENST00000546048	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MDM2-234	ENST00000546048	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
MDM2-234	ENST00000546048	CDK19	Q9BWU1	502 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MDM2-234	ENST00000546048	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MDM2-234	ENST00000546048	ADAMTS2	O95450	1211 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MDM2-234	ENST00000546048	NBR1	Q14596	966 aa		7.29	□□□□□ -1.24

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