RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542776.5

POP5-208, Transcript of POP5 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, human

TSL 2

Gene POP5, Length 821 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POP5-208	ENST00000542776	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		13.8	□□□□□ -0.2
POP5-208	ENST00000542776	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP5-208	ENST00000542776	LTN1	O94822	1766 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP5-208	ENST00000542776	FBLN1	P23142	703 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP5-208	ENST00000542776	CCDC125	Q86Z20	511 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP5-208	ENST00000542776	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
POP5-208	ENST00000542776	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
POP5-208	ENST00000542776	TRIM37	O94972	964 aa		13.78	□□□□□ -0.2
POP5-208	ENST00000542776	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
POP5-208	ENST00000542776	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		13.78	□□□□□ -0.2
POP5-208	ENST00000542776	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
POP5-208	ENST00000542776	USP31	Q70CQ4	1352 aa		13.78	□□□□□ -0.2
POP5-208	ENST00000542776	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		13.78	□□□□□ -0.2
POP5-208	ENST00000542776	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		13.78	□□□□□ -0.2
POP5-208	ENST00000542776	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
POP5-208	ENST00000542776	MYOM1	P52179	1685 aa		13.76	□□□□□ -0.21
POP5-208	ENST00000542776	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		13.76	□□□□□ -0.21
POP5-208	ENST00000542776	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		13.76	□□□□□ -0.21
POP5-208	ENST00000542776	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		13.76	□□□□□ -0.21
POP5-208	ENST00000542776	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
POP5-208	ENST00000542776	PEAK1	Q9H792	1746 aa		13.76	□□□□□ -0.21
POP5-208	ENST00000542776	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
POP5-208	ENST00000542776	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		13.75	□□□□□ -0.21
POP5-208	ENST00000542776	PDE3B	Q13370	1112 aa		13.75	□□□□□ -0.21
POP5-208	ENST00000542776	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		13.75	□□□□□ -0.21
POP5-208	ENST00000542776	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
POP5-208	ENST00000542776	DISP2	A7MBM2	1401 aa		13.73	□□□□□ -0.21
POP5-208	ENST00000542776	BAG6	P46379	1132 aa		13.73	□□□□□ -0.21
POP5-208	ENST00000542776	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
POP5-208	ENST00000542776	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
POP5-208	ENST00000542776	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		13.72	□□□□□ -0.21
POP5-208	ENST00000542776	TMF1	P82094	1093 aa		13.72	□□□□□ -0.21
POP5-208	ENST00000542776	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		13.72	□□□□□ -0.21
POP5-208	ENST00000542776	APBA3	O96018	575 aa		13.71	□□□□□ -0.21
POP5-208	ENST00000542776	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
POP5-208	ENST00000542776	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		13.71	□□□□□ -0.21
POP5-208	ENST00000542776	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
POP5-208	ENST00000542776	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		13.71	□□□□□ -0.21
POP5-208	ENST00000542776	SBF2	Q86WG5	1849 aa		13.71	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		13.71	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	ABCC6	O95255	1503 aa		13.7	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	ERBB3	P21860	1342 aa		13.7	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	SLC24A1	O60721	1099 aa		13.7	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		13.7	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		13.7	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		13.7	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		13.7	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		13.69	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		13.69	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	DDB1	Q16531	1140 aa		13.69	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		13.69	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		13.69	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	RREB1	Q92766	1687 aa		13.69	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		13.68	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	FYB1	O15117	783 aa		13.68	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		13.68	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		13.67	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	COG3	Q96JB2	828 aa		13.67	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	TNS2	Q63HR2	1409 aa		13.66	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	CCDC7	Q96M83	1385 aa		13.66	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		13.66	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	HOXC9	P31274	260 aa		13.65	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	IP6K1	Q92551	441 aa		13.65	□□□□□ -0.22
POP5-208	ENST00000542776	KCNQ2	O43526	872 aa		13.64	□□□□□ -0.23
POP5-208	ENST00000542776	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		13.64	□□□□□ -0.23
POP5-208	ENST00000542776	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		13.64	□□□□□ -0.23
POP5-208	ENST00000542776	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
POP5-208	ENST00000542776	AMPH	P49418	695 aa		13.63	□□□□□ -0.23
POP5-208	ENST00000542776	EXOC5	O00471	708 aa		13.62	□□□□□ -0.23
POP5-208	ENST00000542776	IL2RB	P14784	551 aa		13.62	□□□□□ -0.23
POP5-208	ENST00000542776	MEGF6	O75095	1541 aa		13.61	□□□□□ -0.23
POP5-208	ENST00000542776	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
POP5-208	ENST00000542776	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
POP5-208	ENST00000542776	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		13.61	□□□□□ -0.23
POP5-208	ENST00000542776	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		13.61	□□□□□ -0.23
POP5-208	ENST00000542776	LRP5	O75197	1615 aa		13.61	□□□□□ -0.23
POP5-208	ENST00000542776	CDCA8	Q53HL2	280 aa		13.6	□□□□□ -0.23
POP5-208	ENST00000542776	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		13.6	□□□□□ -0.23
POP5-208	ENST00000542776	PROM2	Q8N271	834 aa		13.6	□□□□□ -0.23
POP5-208	ENST00000542776	NHS	Q6T4R5	1651 aa		13.59	□□□□□ -0.23
POP5-208	ENST00000542776	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
POP5-208	ENST00000542776	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		13.59	□□□□□ -0.23
POP5-208	ENST00000542776	NBPF4	Q96M43	638 aa		13.59	□□□□□ -0.23
POP5-208	ENST00000542776	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
POP5-208	ENST00000542776	BCL9	O00512	1426 aa		13.58	□□□□□ -0.24
POP5-208	ENST00000542776	BTAF1	O14981	1849 aa		13.58	□□□□□ -0.24
POP5-208	ENST00000542776	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
POP5-208	ENST00000542776	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
POP5-208	ENST00000542776	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		13.58	□□□□□ -0.24
POP5-208	ENST00000542776	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
POP5-208	ENST00000542776	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		13.58	□□□□□ -0.24
POP5-208	ENST00000542776	RTL1	A6NKG5	1358 aa		13.58	□□□□□ -0.24
POP5-208	ENST00000542776	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		13.58	□□□□□ -0.24
POP5-208	ENST00000542776	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
POP5-208	ENST00000542776	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		13.56	□□□□□ -0.24
POP5-208	ENST00000542776	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24

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