RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539613.5

RHBDD1-215, Transcript of rhomboid domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene RHBDD1, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1-215ENST00000539613 SOX12O15370 315 aa29.87■■■□□ 2.37
RHBDD1-215ENST00000539613 EVC2Q86UK5 1308 aa29.87■■■□□ 2.37
RHBDD1-215ENST00000539613 KCNQ2O43526 872 aa29.85■■■□□ 2.37
RHBDD1-215ENST00000539613 YY1P25490 414 aa29.85■■■□□ 2.37
RHBDD1-215ENST00000539613 CASZ1Q86V15 1759 aa29.85■■■□□ 2.37
RHBDD1-215ENST00000539613 WDR17Q8IZU2 1322 aa29.84■■■□□ 2.37
RHBDD1-215ENST00000539613 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa29.82■■■□□ 2.36
RHBDD1-215ENST00000539613 NINLQ9Y2I6 1382 aa29.81■■■□□ 2.36
RHBDD1-215ENST00000539613 DCAF8L1A6NGE4 600 aa29.81■■■□□ 2.36
RHBDD1-215ENST00000539613 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
RHBDD1-215ENST00000539613 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.8■■■□□ 2.36
RHBDD1-215ENST00000539613 PLSCR1O15162 318 aa29.78■■■□□ 2.36
RHBDD1-215ENST00000539613 PTF1AQ7RTS3 328 aa29.78■■■□□ 2.36
RHBDD1-215ENST00000539613 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.78■■■□□ 2.36
RHBDD1-215ENST00000539613 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
RHBDD1-215ENST00000539613 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
RHBDD1-215ENST00000539613 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa29.77■■■□□ 2.36
RHBDD1-215ENST00000539613 MON2Q7Z3U7 1717 aa29.77■■■□□ 2.36
RHBDD1-215ENST00000539613 KCNH5Q8NCM2 988 aa29.77■■■□□ 2.36
RHBDD1-215ENST00000539613 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
RHBDD1-215ENST00000539613 NFAT5O94916 1531 aa29.76■■■□□ 2.36
RHBDD1-215ENST00000539613 MYOM1P52179 1685 aa29.76■■■□□ 2.36
RHBDD1-215ENST00000539613 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
RHBDD1-215ENST00000539613 ARHGEF25Q86VW2 580 aa29.74■■■□□ 2.35
RHBDD1-215ENST00000539613 TTC21AQ8NDW8 1320 aa29.73■■■□□ 2.35
RHBDD1-215ENST00000539613 LTN1O94822 1766 aa29.72■■■□□ 2.35
RHBDD1-215ENST00000539613 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
RHBDD1-215ENST00000539613 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
RHBDD1-215ENST00000539613 CARD10Q9BWT7 1032 aa29.71■■■□□ 2.35
RHBDD1-215ENST00000539613 NHSQ6T4R5 1651 aa29.71■■■□□ 2.35
RHBDD1-215ENST00000539613 ABCC6O95255 1503 aa29.71■■■□□ 2.35
RHBDD1-215ENST00000539613 TNS2Q63HR2 1409 aa29.71■■■□□ 2.35
RHBDD1-215ENST00000539613 ZBTB7AO95365 584 aa29.7■■■□□ 2.35
RHBDD1-215ENST00000539613 BCL9O00512 1426 aa29.7■■■□□ 2.34
RHBDD1-215ENST00000539613 CCDC7Q96M83 1385 aa29.69■■■□□ 2.34
RHBDD1-215ENST00000539613 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
RHBDD1-215ENST00000539613 STK32BQ9NY57 414 aa29.67■■■□□ 2.34
RHBDD1-215ENST00000539613 EXOC5O00471 708 aa29.66■■■□□ 2.34
RHBDD1-215ENST00000539613 NEUROD1Q13562 356 aa29.66■■■□□ 2.34
RHBDD1-215ENST00000539613 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.66■■■□□ 2.34
RHBDD1-215ENST00000539613 TXNRD1Q16881 649 aa29.65■■■□□ 2.34
RHBDD1-215ENST00000539613 USP54Q70EL1 1684 aa29.65■■■□□ 2.34
RHBDD1-215ENST00000539613 KAT6BQ8WYB5 2073 aa29.64■■■□□ 2.34
RHBDD1-215ENST00000539613 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.64■■■□□ 2.34
RHBDD1-215ENST00000539613 PROM2Q8N271 834 aa29.64■■■□□ 2.34
RHBDD1-215ENST00000539613 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
RHBDD1-215ENST00000539613 BTAF1O14981 1849 aa29.61■■■□□ 2.33
RHBDD1-215ENST00000539613 ACSBG1Q96GR2 724 aa29.59■■■□□ 2.33
RHBDD1-215ENST00000539613 NLRP2Q9NX02 1062 aa29.59■■■□□ 2.33
RHBDD1-215ENST00000539613 SLC15A2Q16348 729 aa29.58■■■□□ 2.33
RHBDD1-215ENST00000539613 ERBB3P21860 1342 aa29.56■■■□□ 2.32
RHBDD1-215ENST00000539613 NME9Q86XW9 330 aa29.56■■■□□ 2.32
RHBDD1-215ENST00000539613 PTGER2P43116 358 aa29.55■■■□□ 2.32
RHBDD1-215ENST00000539613 TMC1Q8TDI8 760 aa29.55■■■□□ 2.32
RHBDD1-215ENST00000539613 PAPPAQ13219 1627 aa29.55■■■□□ 2.32
RHBDD1-215ENST00000539613 USP31Q70CQ4 1352 aa29.53■■■□□ 2.32
RHBDD1-215ENST00000539613 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa29.53■■■□□ 2.32
RHBDD1-215ENST00000539613 CD163L1Q9NR16 1453 aa29.53■■■□□ 2.32
RHBDD1-215ENST00000539613 IL2RBP14784 551 aa29.52■■■□□ 2.32
RHBDD1-215ENST00000539613 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
RHBDD1-215ENST00000539613 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
RHBDD1-215ENST00000539613 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
RHBDD1-215ENST00000539613 MTFR1LQ9H019 292 aa29.51■■■□□ 2.31
RHBDD1-215ENST00000539613 CHD4Q14839 1912 aa29.5■■■□□ 2.31
RHBDD1-215ENST00000539613 ANKRD24Q8TF21 1146 aa29.5■■■□□ 2.31
RHBDD1-215ENST00000539613 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.49■■■□□ 2.31
RHBDD1-215ENST00000539613 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
RHBDD1-215ENST00000539613 SYT17Q9BSW7 474 aa29.45■■■□□ 2.31
RHBDD1-215ENST00000539613 DOT1LQ8TEK3 1739 aa29.43■■■□□ 2.3
RHBDD1-215ENST00000539613 A0A1W2PP64 1363 aa29.43■■■□□ 2.3
RHBDD1-215ENST00000539613 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa29.42■■■□□ 2.3
RHBDD1-215ENST00000539613 TERF2IPQ9NYB0 399 aa29.42■■■□□ 2.3
RHBDD1-215ENST00000539613 QSER1Q2KHR3 1735 aa29.41■■■□□ 2.3
RHBDD1-215ENST00000539613 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
RHBDD1-215ENST00000539613 ARXQ96QS3 562 aa29.41■■■□□ 2.3
RHBDD1-215ENST00000539613 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa29.41■■■□□ 2.3
RHBDD1-215ENST00000539613 UTRNP46939 3433 aa29.4■■■□□ 2.3
RHBDD1-215ENST00000539613 ZNF827Q17R98 1081 aa29.4■■■□□ 2.3
RHBDD1-215ENST00000539613 SGIP1Q9BQI5 828 aa29.39■■■□□ 2.3
RHBDD1-215ENST00000539613 RGPD2P0DJD1 1756 aa29.39■■■□□ 2.29
RHBDD1-215ENST00000539613 KLHL34Q8N239 644 aa29.38■■■□□ 2.29
RHBDD1-215ENST00000539613 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
RHBDD1-215ENST00000539613 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
RHBDD1-215ENST00000539613 TONSLQ96HA7 1378 aa29.36■■■□□ 2.29
RHBDD1-215ENST00000539613 LRRC4BQ9NT99 713 aa29.35■■■□□ 2.29
RHBDD1-215ENST00000539613 SHANK3Q9BYB0 1731 aa29.34■■■□□ 2.29
RHBDD1-215ENST00000539613 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
RHBDD1-215ENST00000539613 IP6K1Q92551 441 aa29.32■■■□□ 2.28
RHBDD1-215ENST00000539613 LY75O60449 1722 aa29.31■■■□□ 2.28
RHBDD1-215ENST00000539613 MAP3K5Q99683 1374 aa29.31■■■□□ 2.28
RHBDD1-215ENST00000539613 SLC27A3Q5K4L6 730 aa29.29■■■□□ 2.28
RHBDD1-215ENST00000539613 COG3Q96JB2 828 aa29.29■■■□□ 2.28
RHBDD1-215ENST00000539613 POLD1P28340 1107 aa29.28■■■□□ 2.28
RHBDD1-215ENST00000539613 GPR162Q16538 588 aa29.28■■■□□ 2.28
RHBDD1-215ENST00000539613 AMPHP49418 695 aa29.27■■■□□ 2.28
RHBDD1-215ENST00000539613 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
RHBDD1-215ENST00000539613 AKT1S1Q96B36 256 aa29.27■■■□□ 2.28
RHBDD1-215ENST00000539613 COL24A1Q17RW2 1714 aa29.27■■■□□ 2.28
RHBDD1-215ENST00000539613 MAP3K19Q56UN5 1328 aa29.26■■■□□ 2.27
RHBDD1-215ENST00000539613 KCNQ4P56696 695 aa29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms