RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PTPRU-210ENST00000527027 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PTPRU-210ENST00000527027 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRU-210ENST00000527027 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRU-210ENST00000527027 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRU-210ENST00000527027 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRU-210ENST00000527027 PEAK1Q9H792 1746 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRU-210ENST00000527027 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRU-210ENST00000527027 COL18A1P39060 1754 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRU-210ENST00000527027 SOX12O15370 315 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRU-210ENST00000527027 PIK3C2AO00443 1686 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRU-210ENST00000527027 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
PTPRU-210ENST00000527027 PROM2Q8N271 834 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRU-210ENST00000527027 BCL9O00512 1426 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRU-210ENST00000527027 LRRC37A3O60309 1634 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRU-210ENST00000527027 EXOC5O00471 708 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRU-210ENST00000527027 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PTPRU-210ENST00000527027 YY1P25490 414 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRU-210ENST00000527027 NEUROD1Q13562 356 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRU-210ENST00000527027 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRU-210ENST00000527027 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRU-210ENST00000527027 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PTPRU-210ENST00000527027 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRU-210ENST00000527027 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PTPRU-210ENST00000527027 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRU-210ENST00000527027 SBF2Q86WG5 1849 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRU-210ENST00000527027 CCDC7Q96M83 1385 aa23■■□□□ 1.27
PTPRU-210ENST00000527027 TXNRD1Q16881 649 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRU-210ENST00000527027 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PTPRU-210ENST00000527027 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
PTPRU-210ENST00000527027 STK32BQ9NY57 414 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRU-210ENST00000527027 ZBTB7AO95365 584 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRU-210ENST00000527027 USP31Q70CQ4 1352 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRU-210ENST00000527027 NFAT5O94916 1531 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRU-210ENST00000527027 AKAP12Q02952 1782 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRU-210ENST00000527027 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRU-210ENST00000527027 SLC15A2Q16348 729 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRU-210ENST00000527027 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRU-210ENST00000527027 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PTPRU-210ENST00000527027 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRU-210ENST00000527027 RGPD5Q99666 1765 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRU-210ENST00000527027 PTGER2P43116 358 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRU-210ENST00000527027 NME9Q86XW9 330 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRU-210ENST00000527027 ABCC6O95255 1503 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRU-210ENST00000527027 TNS2Q63HR2 1409 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRU-210ENST00000527027 ERBB3P21860 1342 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRU-210ENST00000527027 TMC1Q8TDI8 760 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRU-210ENST00000527027 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRU-210ENST00000527027 CASZ1Q86V15 1759 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRU-210ENST00000527027 IL2RBP14784 551 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRU-210ENST00000527027 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PTPRU-210ENST00000527027 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRU-210ENST00000527027 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRU-210ENST00000527027 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRU-210ENST00000527027 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRU-210ENST00000527027 MTFR1LQ9H019 292 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRU-210ENST00000527027 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRU-210ENST00000527027 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRU-210ENST00000527027 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PTPRU-210ENST00000527027 SYT17Q9BSW7 474 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRU-210ENST00000527027 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PTPRU-210ENST00000527027 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRU-210ENST00000527027 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PTPRU-210ENST00000527027 IP6K1Q92551 441 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRU-210ENST00000527027 USP54Q70EL1 1684 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRU-210ENST00000527027 NHSQ6T4R5 1651 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRU-210ENST00000527027 A0A1W2PP64 1363 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRU-210ENST00000527027 MYOM1P52179 1685 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRU-210ENST00000527027 ARXQ96QS3 562 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRU-210ENST00000527027 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRU-210ENST00000527027 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF827Q17R98 1081 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRU-210ENST00000527027 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRU-210ENST00000527027 UTRNP46939 3433 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRU-210ENST00000527027 LTN1O94822 1766 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRU-210ENST00000527027 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRU-210ENST00000527027 TONSLQ96HA7 1378 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PTPRU-210ENST00000527027 AKT1S1Q96B36 256 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRU-210ENST00000527027 COG3Q96JB2 828 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRU-210ENST00000527027 SLC24A1O60721 1099 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRU-210ENST00000527027 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRU-210ENST00000527027 TESK2Q96S53 571 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRU-210ENST00000527027 PAPPAQ13219 1627 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRU-210ENST00000527027 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRU-210ENST00000527027 MAP3K5Q99683 1374 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRU-210ENST00000527027 BTAF1O14981 1849 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRU-210ENST00000527027 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.7■■□□□ 1.23
PTPRU-210ENST00000527027 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRU-210ENST00000527027 HOXC9P31274 260 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRU-210ENST00000527027 AMPHP49418 695 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRU-210ENST00000527027 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PTPRU-210ENST00000527027 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PTPRU-210ENST00000527027 FBLN1P23142 703 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRU-210ENST00000527027 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRU-210ENST00000527027 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRU-210ENST00000527027 POLD1P28340 1107 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRU-210ENST00000527027 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRU-210ENST00000527027 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRU-210ENST00000527027 KCNQ4P56696 695 aa22.65■■□□□ 1.22
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