RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
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PTPRU-209ENST00000526080 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.15■□□□□ 0.82
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PTPRU-209ENST00000526080 WDR17Q8IZU2 1322 aa20.14■□□□□ 0.81
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PTPRU-209ENST00000526080 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
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PTPRU-209ENST00000526080 NHSQ6T4R5 1651 aa20.08■□□□□ 0.81
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PTPRU-209ENST00000526080 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
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PTPRU-209ENST00000526080 CCDC7Q96M83 1385 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-209ENST00000526080 MAP3K5Q99683 1374 aa20.02■□□□□ 0.8
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PTPRU-209ENST00000526080 EVC2Q86UK5 1308 aa19.99■□□□□ 0.79
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PTPRU-209ENST00000526080 COL24A1Q17RW2 1714 aa19.96■□□□□ 0.79
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PTPRU-209ENST00000526080 ZNF827Q17R98 1081 aa19.93■□□□□ 0.78
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PTPRU-209ENST00000526080 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa19.88■□□□□ 0.77
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PTPRU-209ENST00000526080 AKT1S1Q96B36 256 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRU-209ENST00000526080 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRU-209ENST00000526080 SHANK3Q9BYB0 1731 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRU-209ENST00000526080 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
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PTPRU-209ENST00000526080 SLC16A10Q8TF71 515 aa19.83■□□□□ 0.77
PTPRU-209ENST00000526080 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
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PTPRU-209ENST00000526080 ANKRD24Q8TF21 1146 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRU-209ENST00000526080 LY75O60449 1722 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRU-209ENST00000526080 SLC27A3Q5K4L6 730 aa19.81■□□□□ 0.76
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PTPRU-209ENST00000526080 GPR162Q16538 588 aa19.8■□□□□ 0.76
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PTPRU-209ENST00000526080 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
PTPRU-209ENST00000526080 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
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PTPRU-209ENST00000526080 IP6K1Q92551 441 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRU-209ENST00000526080 KCNQ4P56696 695 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRU-209ENST00000526080 KLHL34Q8N239 644 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRU-209ENST00000526080 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
PTPRU-209ENST00000526080 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRU-209ENST00000526080 KAT6BQ8WYB5 2073 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRU-209ENST00000526080 MEGF6O75095 1541 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRU-209ENST00000526080 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP19.71■□□□□ 0.75
PTPRU-209ENST00000526080 IFFO2Q5TF58 517 aa19.71■□□□□ 0.75
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