RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518848.5

HOXA-AS3-201, HOXA cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4

Gene HOXA-AS3, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS3-201ENST00000518848 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXA-AS3-201ENST00000518848 AKAP12Q02952 1782 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RREB1Q92766 1687 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXA-AS3-201ENST00000518848 BCL9O00512 1426 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PLSCR1O15162 318 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PEAK1Q9H792 1746 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ABCC6O95255 1503 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
HOXA-AS3-201ENST00000518848 USP31Q70CQ4 1352 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXA-AS3-201ENST00000518848 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXA-AS3-201ENST00000518848 LRRC37A3O60309 1634 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NFAT5O94916 1531 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CCDC7Q96M83 1385 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SBF2Q86WG5 1849 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
HOXA-AS3-201ENST00000518848 EXOC5O00471 708 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXA-AS3-201ENST00000518848 USP54Q70EL1 1684 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXA-AS3-201ENST00000518848 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SLC24A1O60721 1099 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXA-AS3-201ENST00000518848 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RGPD5Q99666 1765 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SOX12O15370 315 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TONSLQ96HA7 1378 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.47
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SPON1Q9HCB6 807 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXA-AS3-201ENST00000518848 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ERBB3P21860 1342 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KCNQ2O43526 872 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TMC1Q8TDI8 760 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NME9Q86XW9 330 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PROM2Q8N271 834 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TNS2Q63HR2 1409 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXA-AS3-201ENST00000518848 A0A1W2PP64 1363 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-201ENST00000518848 IL2RBP14784 551 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TXNRD1Q16881 649 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TESK2Q96S53 571 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-201ENST00000518848 LTN1O94822 1766 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-201ENST00000518848 IP6K1Q92551 441 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-201ENST00000518848 STK32BQ9NY57 414 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CASZ1Q86V15 1759 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SLC15A2Q16348 729 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NHSQ6T4R5 1651 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-201ENST00000518848 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-201ENST00000518848 COG3Q96JB2 828 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-201ENST00000518848 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-201ENST00000518848 UTRNP46939 3433 aa24■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PTGER2P43116 358 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MTFR1LQ9H019 292 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ZBTB7AO95365 584 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-201ENST00000518848 HOXC9P31274 260 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TMF1P82094 1093 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RTL1A6NKG5 1358 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-201ENST00000518848 YY1P25490 414 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-201ENST00000518848 AMPHP49418 695 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CDCA8Q53HL2 280 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-201ENST00000518848 BTAF1O14981 1849 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PAPPAQ13219 1627 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-201ENST00000518848 FYB1O15117 783 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-201ENST00000518848 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-201ENST00000518848 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-201ENST00000518848 USP47Q96K76 1375 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-201ENST00000518848 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SYT17Q9BSW7 474 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXA-AS3-201ENST00000518848 AKT1S1Q96B36 256 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MAP3K5Q99683 1374 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MYOM1P52179 1685 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXA-AS3-201ENST00000518848 FBLN1P23142 703 aa23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms