RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.66■□□□□ 0.9
TRPS1-206ENST00000517323 FLT4P35916 1363 aa20.66■□□□□ 0.9
TRPS1-206ENST00000517323 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
TRPS1-206ENST00000517323 RGPD2P0DJD1 1756 aa20.66■□□□□ 0.9
TRPS1-206ENST00000517323 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.66■□□□□ 0.9
TRPS1-206ENST00000517323 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
TRPS1-206ENST00000517323 ARHGEF10O15013 1369 aa20.66■□□□□ 0.9
TRPS1-206ENST00000517323 ABCA3Q99758 1704 aa20.65■□□□□ 0.9
TRPS1-206ENST00000517323 ARHGEF25Q86VW2 580 aa20.65■□□□□ 0.9
TRPS1-206ENST00000517323 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
TRPS1-206ENST00000517323 APAF1O14727 1248 aa20.64■□□□□ 0.89
TRPS1-206ENST00000517323 USHBP1Q8N6Y0 703 aa20.64■□□□□ 0.89
TRPS1-206ENST00000517323 INSRP06213 1382 aa20.64■□□□□ 0.89
TRPS1-206ENST00000517323 KIAA0232Q92628 1395 aa20.64■□□□□ 0.89
TRPS1-206ENST00000517323 NEUROD2Q15784 382 aa20.63■□□□□ 0.89
TRPS1-206ENST00000517323 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
TRPS1-206ENST00000517323 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
TRPS1-206ENST00000517323 NUDCQ9Y266 331 aa20.62■□□□□ 0.89
TRPS1-206ENST00000517323 IP6K1Q92551 441 aa20.61■□□□□ 0.89
TRPS1-206ENST00000517323 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.6■□□□□ 0.89
TRPS1-206ENST00000517323 PRKAR2BP31323 418 aa20.59■□□□□ 0.89
TRPS1-206ENST00000517323 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.59■□□□□ 0.89
TRPS1-206ENST00000517323 EYA1Q99502 592 aa20.59■□□□□ 0.89
TRPS1-206ENST00000517323 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.59■□□□□ 0.89
TRPS1-206ENST00000517323 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.59■□□□□ 0.89
TRPS1-206ENST00000517323 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.58■□□□□ 0.89
TRPS1-206ENST00000517323 COL18A1P39060 1754 aa20.58■□□□□ 0.88
TRPS1-206ENST00000517323 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.57■□□□□ 0.88
TRPS1-206ENST00000517323 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TRPS1-206ENST00000517323 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
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TRPS1-206ENST00000517323 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TRPS1-206ENST00000517323 NBPF4Q96M43 638 aa20.56■□□□□ 0.88
TRPS1-206ENST00000517323 PRDM11Q9NQV5 511 aa20.56■□□□□ 0.88
TRPS1-206ENST00000517323 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.56■□□□□ 0.88
TRPS1-206ENST00000517323 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.55■□□□□ 0.88
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TRPS1-206ENST00000517323 RTL1A6NKG5 1358 aa20.55■□□□□ 0.88
TRPS1-206ENST00000517323 ADAMTS2O95450 1211 aa20.55■□□□□ 0.88
TRPS1-206ENST00000517323 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.54■□□□□ 0.88
TRPS1-206ENST00000517323 FAM83GA6ND36 823 aa20.53■□□□□ 0.88
TRPS1-206ENST00000517323 HSPA1LP34931 641 aa20.53■□□□□ 0.88
TRPS1-206ENST00000517323 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.52■□□□□ 0.88
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TRPS1-206ENST00000517323 KIF24Q5T7B8 1368 aa20.51■□□□□ 0.87
TRPS1-206ENST00000517323 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
TRPS1-206ENST00000517323 ERBB3P21860 1342 aa20.5■□□□□ 0.87
TRPS1-206ENST00000517323 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.5■□□□□ 0.87
TRPS1-206ENST00000517323 CPDO75976 1380 aa20.5■□□□□ 0.87
TRPS1-206ENST00000517323 STRN4Q9NRL3 753 aa20.49■□□□□ 0.87
TRPS1-206ENST00000517323 DLG5Q8TDM6 1919 aa20.49■□□□□ 0.87
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TRPS1-206ENST00000517323 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.48■□□□□ 0.87
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TRPS1-206ENST00000517323 WWC1Q8IX03 1113 aa20.45■□□□□ 0.86
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TRPS1-206ENST00000517323 ZNF521Q96K83 1311 aa20.44■□□□□ 0.86
TRPS1-206ENST00000517323 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
TRPS1-206ENST00000517323 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
TRPS1-206ENST00000517323 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
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TRPS1-206ENST00000517323 PLCH1Q4KWH8 1693 aa20.4■□□□□ 0.86
TRPS1-206ENST00000517323 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.4■□□□□ 0.86
TRPS1-206ENST00000517323 LRP6O75581 1613 aa20.4■□□□□ 0.86
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TRPS1-206ENST00000517323 MCM10Q7L590 875 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPS1-206ENST00000517323 C8orf37Q96NL8 207 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPS1-206ENST00000517323 WDR17Q8IZU2 1322 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPS1-206ENST00000517323 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
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TRPS1-206ENST00000517323 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.32■□□□□ 0.84
TRPS1-206ENST00000517323 NRAPQ86VF7 1730 aa20.31■□□□□ 0.84
TRPS1-206ENST00000517323 NGLY1Q96IV0 654 aa20.31■□□□□ 0.84
TRPS1-206ENST00000517323 CCDC27Q2M243 656 aa20.31■□□□□ 0.84
TRPS1-206ENST00000517323 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.31■□□□□ 0.84
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
TRPS1-206ENST00000517323 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.3■□□□□ 0.84
TRPS1-206ENST00000517323 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
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