RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516078.2

RNU6-760P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 760, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-760P, Length 97 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-760P-201ENST00000516078 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 AGERQ15109 404 aa10.08□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 MAP7D1Q3KQU3 841 aa10.08□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 FAM196BA6NMK8 535 aa10.07□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 TMEM164Q5U3C3 297 aa10.07□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 STK32AQ8WU08 396 aa10.07□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 USP17L15C9J2P7 530 aa10.06□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 USP17L10C9JJH3 530 aa10.06□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 USP17L13C9JLJ4 530 aa10.06□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 USP17L12C9JPN9 530 aa10.06□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 USP17L11C9JVI0 530 aa10.06□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 USP17L21D6R901 530 aa10.06□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 USP17L18D6R9N7 530 aa10.06□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 USP17L22D6RA61 530 aa10.06□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 USP17L17D6RBQ6 530 aa10.06□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 USP17L19D6RCP7 530 aa10.06□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 USP17L20D6RJB6 530 aa10.06□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa10.06□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 SH3BP2P78314 561 aa10.06□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 KCNC4Q03721 635 aa10.06□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 KCNA1Q09470 495 aa10.06□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 USP17L24Q0WX57 530 aa10.06□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa10.06□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 RASA1P20936 1047 aa10.05□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 PTK7Q13308 1070 aa10.05□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 EML3Q32P44 896 aa10.05□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 RNF223E7ERA6 249 aa10.04□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 SLC10A4Q96EP9 437 aa10.04□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 PLA2G2CQ5R387 149 aa10.03□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 HCSTQ9UBK5 93 aa10.03□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 DOLKQ9UPQ8 538 aa10.03□□□□□ -0.8
RNU6-760P-201ENST00000516078 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 ESPNB1AK53 854 aa10.01□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 OGFOD1Q8N543 542 aa10.01□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 ANKLE1Q8NAG6 615 aa10.01□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 NOD1Q9Y239 953 aa10.01□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 CLDN10P78369 228 aa10□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 TRIM32Q13049 653 aa10□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 NBPF20Q3BBV1 942 aa10□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 OXLD1Q5BKU9 147 aa10□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 RNF20Q5VTR2 975 aa10□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 ANKMY2Q8IV38 441 aa10□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 SKOR1P84550 965 aa9.99□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 FAM69CQ0P6D2 419 aa9.99□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 TRIM50Q86XT4 487 aa9.99□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.99□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 DPYDQ12882 1025 aa9.98□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.98□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 SLAIN2Q9P270 581 aa9.98□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 PCDH10Q9P2E7 1040 aa9.98□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 GGCXP38435 758 aa9.97□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 ATP1A2P50993 1020 aa9.97□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 SEPT12Q8IYM1 358 aa9.97□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 KIAA1024Q9UPX6 916 aa9.97□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa9.97□□□□□ -0.81
RNU6-760P-201ENST00000516078 DKK1O94907 266 aa9.96□□□□□ -0.82
RNU6-760P-201ENST00000516078 VARSP26640 1264 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
RNU6-760P-201ENST00000516078 WNT7BP56706 349 aa9.96□□□□□ -0.82
RNU6-760P-201ENST00000516078 GTF2IP78347 998 aa9.96□□□□□ -0.82
RNU6-760P-201ENST00000516078 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa9.96□□□□□ -0.82
RNU6-760P-201ENST00000516078 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa9.96□□□□□ -0.82
RNU6-760P-201ENST00000516078 PPP1R18Q6NYC8 613 aa9.96□□□□□ -0.82
RNU6-760P-201ENST00000516078 LARGE2Q8N3Y3 721 aa9.96□□□□□ -0.82
RNU6-760P-201ENST00000516078 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa9.96□□□□□ -0.82
RNU6-760P-201ENST00000516078 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
RNU6-760P-201ENST00000516078 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
RNU6-760P-201ENST00000516078 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
RNU6-760P-201ENST00000516078 SSFA2P28290 1259 aa9.94□□□□□ -0.82
RNU6-760P-201ENST00000516078 RPIAP49247 311 aa9.94□□□□□ -0.82
RNU6-760P-201ENST00000516078 CCDC125Q86Z20 511 aa9.94□□□□□ -0.82
RNU6-760P-201ENST00000516078 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.94□□□□□ -0.82
RNU6-760P-201ENST00000516078 SIX5Q8N196 739 aa9.94□□□□□ -0.82
RNU6-760P-201ENST00000516078 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa9.94□□□□□ -0.82
RNU6-760P-201ENST00000516078 RAB15P59190 212 aa9.93□□□□□ -0.82
RNU6-760P-201ENST00000516078 USP4Q13107 963 aa9.93□□□□□ -0.82
RNU6-760P-201ENST00000516078 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RNU6-760P-201ENST00000516078 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa9.93□□□□□ -0.82
RNU6-760P-201ENST00000516078 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
RNU6-760P-201ENST00000516078 SWI5Q1ZZU3 235 aa9.92□□□□□ -0.82
RNU6-760P-201ENST00000516078 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
RNU6-760P-201ENST00000516078 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RNU6-760P-201ENST00000516078 SIRT1Q96EB6 747 aa9.92□□□□□ -0.82
RNU6-760P-201ENST00000516078 CCDC102BQ68D86 513 aa9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms