RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
SMIM20-202ENST00000514384 PLSCR2Q9NRY7 297 aa10.23□□□□□ -0.77
SMIM20-202ENST00000514384 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
SMIM20-202ENST00000514384 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa10.23□□□□□ -0.77
SMIM20-202ENST00000514384 POTEMA6NI47 508 aa10.22□□□□□ -0.77
SMIM20-202ENST00000514384 HTRA3P83110 453 aa10.22□□□□□ -0.77
SMIM20-202ENST00000514384 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
SMIM20-202ENST00000514384 PCDHB8Q9UN66 801 aa10.22□□□□□ -0.77
SMIM20-202ENST00000514384 KIF15Q9NS87 1388 aa10.22□□□□□ -0.77
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SMIM20-202ENST00000514384 ARXQ96QS3 562 aa10.21□□□□□ -0.77
SMIM20-202ENST00000514384 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
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SMIM20-202ENST00000514384 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa10.21□□□□□ -0.78
SMIM20-202ENST00000514384 LMTK2Q8IWU2 1503 aa10.21□□□□□ -0.78
SMIM20-202ENST00000514384 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
SMIM20-202ENST00000514384 NWD2Q9ULI1 1742 aa10.21□□□□□ -0.78
SMIM20-202ENST00000514384 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa10.2□□□□□ -0.78
SMIM20-202ENST00000514384 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa10.19□□□□□ -0.78
SMIM20-202ENST00000514384 LMOD2Q6P5Q4 547 aa10.19□□□□□ -0.78
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SMIM20-202ENST00000514384 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
SMIM20-202ENST00000514384 OCEL1Q9H607 264 aa10.19□□□□□ -0.78
SMIM20-202ENST00000514384 ERBINQ96RT1 1412 aa10.18□□□□□ -0.78
SMIM20-202ENST00000514384 ROBO2Q9HCK4 1378 aa10.18□□□□□ -0.78
SMIM20-202ENST00000514384 POTEJP0CG39 1038 aa10.18□□□□□ -0.78
SMIM20-202ENST00000514384 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
SMIM20-202ENST00000514384 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
SMIM20-202ENST00000514384 NRAPQ86VF7 1730 aa10.18□□□□□ -0.78
SMIM20-202ENST00000514384 POTEFA5A3E0 1075 aa10.17□□□□□ -0.78
SMIM20-202ENST00000514384 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP10.17□□□□□ -0.782e-7■□□□□ 10.5
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SMIM20-202ENST00000514384 KRT28Q7Z3Y7 464 aa10.17□□□□□ -0.78
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SMIM20-202ENST00000514384 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa10.16□□□□□ -0.78
SMIM20-202ENST00000514384 KIF3CO14782 793 aa10.16□□□□□ -0.78
SMIM20-202ENST00000514384 PDE3BQ13370 1112 aa10.16□□□□□ -0.78
SMIM20-202ENST00000514384 SLAIN1Q8ND83 568 aa10.16□□□□□ -0.78
SMIM20-202ENST00000514384 NLGN2Q8NFZ4 835 aa10.16□□□□□ -0.78
SMIM20-202ENST00000514384 KLRG1Q96E93 195 aa10.16□□□□□ -0.78
SMIM20-202ENST00000514384 TNS2Q63HR2 1409 aa10.16□□□□□ -0.78
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SMIM20-202ENST00000514384 MAP3K5Q99683 1374 aa10.14□□□□□ -0.79
SMIM20-202ENST00000514384 PTF1AQ7RTS3 328 aa10.14□□□□□ -0.79
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SMIM20-202ENST00000514384 STK32BQ9NY57 414 aa10.12□□□□□ -0.79
SMIM20-202ENST00000514384 ABCC5O15440 1437 aa10.12□□□□□ -0.79
SMIM20-202ENST00000514384 TNS3Q68CZ2 1445 aa10.12□□□□□ -0.79
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SMIM20-202ENST00000514384 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa10.11□□□□□ -0.79
SMIM20-202ENST00000514384 TECPR2O15040 1411 aa10.1□□□□□ -0.79
SMIM20-202ENST00000514384 GRIN3BO60391 1043 aa10.1□□□□□ -0.79
SMIM20-202ENST00000514384 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
SMIM20-202ENST00000514384 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
SMIM20-202ENST00000514384 C3orf67Q6ZVT6 689 aa10.1□□□□□ -0.79
SMIM20-202ENST00000514384 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
SMIM20-202ENST00000514384 ADCY9O60503 1353 aa10.1□□□□□ -0.79
SMIM20-202ENST00000514384 CCDC144AA2RUR9 1427 aa10.09□□□□□ -0.79
SMIM20-202ENST00000514384 ABCA3Q99758 1704 aa10.09□□□□□ -0.79
SMIM20-202ENST00000514384 PCNTO95613 3336 aa10.09□□□□□ -0.79
SMIM20-202ENST00000514384 PLSCR1O15162 318 aa10.08□□□□□ -0.8
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
SMIM20-202ENST00000514384 CHIC2Q9UKJ5 165 aa10.08□□□□□ -0.8
SMIM20-202ENST00000514384 AATKQ6ZMQ8 1374 aa10.08□□□□□ -0.8
SMIM20-202ENST00000514384 CROCC2H7BZ55 1655 aa10.08□□□□□ -0.8
SMIM20-202ENST00000514384 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP10.07□□□□□ -0.8
SMIM20-202ENST00000514384 WDR90Q96KV7 1748 aa10.07□□□□□ -0.8
SMIM20-202ENST00000514384 TOMM70O94826 608 aa10.05□□□□□ -0.8
SMIM20-202ENST00000514384 PSME1Q06323 249 aa10.05□□□□□ -0.8
SMIM20-202ENST00000514384 CHRNA2Q15822 529 aa10.05□□□□□ -0.8
SMIM20-202ENST00000514384 TXNRD1Q16881 649 aa10.05□□□□□ -0.8
SMIM20-202ENST00000514384 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa10.05□□□□□ -0.8
SMIM20-202ENST00000514384 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
SMIM20-202ENST00000514384 NAIPQ13075 1403 aa10.05□□□□□ -0.8
SMIM20-202ENST00000514384 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa10.05□□□□□ -0.8
SMIM20-202ENST00000514384 PRDM11Q9NQV5 511 aa10.04□□□□□ -0.8
SMIM20-202ENST00000514384 ARHGEF10O15013 1369 aa10.03□□□□□ -0.8
SMIM20-202ENST00000514384 HFM1A2PYH4 1435 aa10.03□□□□□ -0.8
SMIM20-202ENST00000514384 MYOM3Q5VTT5 1437 aa10.03□□□□□ -0.8
SMIM20-202ENST00000514384 WAPLQ7Z5K2 1190 aa10.02□□□□□ -0.81
SMIM20-202ENST00000514384 PHF8Q9UPP1 1060 aa10.02□□□□□ -0.81
SMIM20-202ENST00000514384 SBNO1A3KN83 1393 aa10.01□□□□□ -0.81
SMIM20-202ENST00000514384 BARGINQ6ZT62 677 aa10.01□□□□□ -0.81
SMIM20-202ENST00000514384 CABP2Q9NPB3 220 aa10.01□□□□□ -0.81
SMIM20-202ENST00000514384 POLD1P28340 1107 aa10□□□□□ -0.81
SMIM20-202ENST00000514384 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SMIM20-202ENST00000514384 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa9.99□□□□□ -0.81
SMIM20-202ENST00000514384 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF827Q17R98 1081 aa9.99□□□□□ -0.81
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