RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513758.2

APOBEC3B-AS1-201, APOBEC3B antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene APOBEC3B-AS1, Length 691 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa13.07□□□□□ -0.32
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 USP47Q96K76 1375 aa13.07□□□□□ -0.32
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 CRB1P82279 1406 aa13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 FBLN1P23142 703 aa13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 PDE3BQ13370 1112 aa13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 KCNH5Q8NCM2 988 aa13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 USP54Q70EL1 1684 aa13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 WNK3Q9BYP7 1800 aa13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 TERF2IPQ9NYB0 399 aa13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 USP31Q70CQ4 1352 aa13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 SBF2Q86WG5 1849 aa13.04□□□□□ -0.32
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 BAG6P46379 1132 aa13.04□□□□□ -0.32
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 FAM196AQ6ZSG2 479 aa13.04□□□□□ -0.32
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 WDR17Q8IZU2 1322 aa13.04□□□□□ -0.32
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 KAT6BQ8WYB5 2073 aa13.03□□□□□ -0.32
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa13.03□□□□□ -0.32
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 TMF1P82094 1093 aa13.02□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 LRRC37A3O60309 1634 aa13.02□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 APBA3O96018 575 aa13.01□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 PTF1AQ7RTS3 328 aa13.01□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 PEAK1Q9H792 1746 aa13.01□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 RGPD2P0DJD1 1756 aa13.01□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa13□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 OVOS2Q6IE36 1432 aa13□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 DDB1Q16531 1140 aa13□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 CAMKK2Q96RR4 588 aa13□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 CARD10Q9BWT7 1032 aa13□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa13□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 NLRP2Q9NX02 1062 aa12.99□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 MYOM1P52179 1685 aa12.99□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa12.98□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 FYB1O15117 783 aa12.98□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 SLC24A1O60721 1099 aa12.98□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 ANKRD24Q8TF21 1146 aa12.98□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 GGNBP2Q9H3C7 697 aa12.98□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 NINLQ9Y2I6 1382 aa12.97□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 ERBB3P21860 1342 aa12.97□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 COG3Q96JB2 828 aa12.97□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 CARD14Q9BXL6 1004 aa12.97□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa12.97□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 KIF20BQ96Q89 1820 aa12.97□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 DISP2A7MBM2 1401 aa12.96□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 MAP3K19Q56UN5 1328 aa12.96□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 IP6K1Q92551 441 aa12.96□□□□□ -0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 ABCC6O95255 1503 aa12.95□□□□□ -0.34
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 EXOC5O00471 708 aa12.95□□□□□ -0.34
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 POLR3GLQ9BT43 218 aa12.95□□□□□ -0.34
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 NUP188Q5SRE5 1749 aa12.95□□□□□ -0.34
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 RREB1Q92766 1687 aa12.95□□□□□ -0.34
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa12.95□□□□□ -0.34
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 CCDC7Q96M83 1385 aa12.94□□□□□ -0.34
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 HOXC9P31274 260 aa12.93□□□□□ -0.34
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 AMPHP49418 695 aa12.93□□□□□ -0.34
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 CDCA8Q53HL2 280 aa12.93□□□□□ -0.34
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 KCNQ2O43526 872 aa12.92□□□□□ -0.34
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 IL2RBP14784 551 aa12.91□□□□□ -0.34
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 ACSBG1Q96GR2 724 aa12.91□□□□□ -0.34
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 NSD3Q9BZ95 1437 aa12.9□□□□□ -0.34
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP12.9□□□□□ -0.34
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 PROM2Q8N271 834 aa12.9□□□□□ -0.34
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 TNS2Q63HR2 1409 aa12.89□□□□□ -0.35
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 USHBP1Q8N6Y0 703 aa12.89□□□□□ -0.35
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 PLSCR1O15162 318 aa12.88□□□□□ -0.35
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa12.88□□□□□ -0.35
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 NBPF6Q5VWK0 638 aa12.88□□□□□ -0.35
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 NBPF4Q96M43 638 aa12.88□□□□□ -0.35
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa12.88□□□□□ -0.35
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 SHANK3Q9BYB0 1731 aa12.88□□□□□ -0.35
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 PARD3Q8TEW0 1356 aa12.87□□□□□ -0.35
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 BTAF1O14981 1849 aa12.87□□□□□ -0.35
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 LRP5O75197 1615 aa12.87□□□□□ -0.35
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 BCL9O00512 1426 aa12.87□□□□□ -0.35
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 NHSQ6T4R5 1651 aa12.86□□□□□ -0.35
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa12.86□□□□□ -0.35
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 NBPF14Q5TI25 921 aa12.85□□□□□ -0.35
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 PANK3Q9H999 370 aa12.85□□□□□ -0.35
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 MEGF6O75095 1541 aa12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms