RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 DDB1Q16531 1140 aa24.04■■□□□ 1.44
HERC3-211ENST00000513325 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.44
HERC3-211ENST00000513325 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
HERC3-211ENST00000513325 TMC1Q8TDI8 760 aa24.02■■□□□ 1.44
HERC3-211ENST00000513325 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.01■■□□□ 1.43
HERC3-211ENST00000513325 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.01■■□□□ 1.43
HERC3-211ENST00000513325 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.01■■□□□ 1.43
HERC3-211ENST00000513325 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.01■■□□□ 1.43
HERC3-211ENST00000513325 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.01■■□□□ 1.43
HERC3-211ENST00000513325 NFAT5O94916 1531 aa24■■□□□ 1.43
HERC3-211ENST00000513325 LRRC37A3O60309 1634 aa24■■□□□ 1.43
HERC3-211ENST00000513325 CD163L1Q9NR16 1453 aa24■■□□□ 1.43
HERC3-211ENST00000513325 RGPD5Q99666 1765 aa23.99■■□□□ 1.43
HERC3-211ENST00000513325 NME9Q86XW9 330 aa23.99■■□□□ 1.43
HERC3-211ENST00000513325 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.99■■□□□ 1.43
HERC3-211ENST00000513325 RREB1Q92766 1687 aa23.99■■□□□ 1.43
HERC3-211ENST00000513325 PEAK1Q9H792 1746 aa23.98■■□□□ 1.43
HERC3-211ENST00000513325 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
HERC3-211ENST00000513325 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.98■■□□□ 1.43
HERC3-211ENST00000513325 USP31Q70CQ4 1352 aa23.98■■□□□ 1.43
HERC3-211ENST00000513325 NBPF14Q5TI25 921 aa23.96■■□□□ 1.43
HERC3-211ENST00000513325 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
HERC3-211ENST00000513325 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
HERC3-211ENST00000513325 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.96■■□□□ 1.43
HERC3-211ENST00000513325 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.95■■□□□ 1.42
HERC3-211ENST00000513325 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.93■■□□□ 1.42
HERC3-211ENST00000513325 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.93■■□□□ 1.42
HERC3-211ENST00000513325 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
HERC3-211ENST00000513325 ABCC6O95255 1503 aa23.92■■□□□ 1.42
HERC3-211ENST00000513325 A0A1W2PP64 1363 aa23.91■■□□□ 1.42
HERC3-211ENST00000513325 CCDC7Q96M83 1385 aa23.91■■□□□ 1.42
HERC3-211ENST00000513325 SBF2Q86WG5 1849 aa23.91■■□□□ 1.42
HERC3-211ENST00000513325 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
HERC3-211ENST00000513325 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
HERC3-211ENST00000513325 USP54Q70EL1 1684 aa23.9■■□□□ 1.42
HERC3-211ENST00000513325 EXOC5O00471 708 aa23.9■■□□□ 1.42
HERC3-211ENST00000513325 PLSCR1O15162 318 aa23.9■■□□□ 1.42
HERC3-211ENST00000513325 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.89■■□□□ 1.41
HERC3-211ENST00000513325 TESK2Q96S53 571 aa23.89■■□□□ 1.41
HERC3-211ENST00000513325 ERBB3P21860 1342 aa23.88■■□□□ 1.41
HERC3-211ENST00000513325 BCL9O00512 1426 aa23.88■■□□□ 1.41
HERC3-211ENST00000513325 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
HERC3-211ENST00000513325 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.88■■□□□ 1.41
HERC3-211ENST00000513325 LTN1O94822 1766 aa23.86■■□□□ 1.41
HERC3-211ENST00000513325 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
HERC3-211ENST00000513325 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.84■■□□□ 1.41
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.84■■□□□ 1.41
HERC3-211ENST00000513325 TNS2Q63HR2 1409 aa23.84■■□□□ 1.41
HERC3-211ENST00000513325 PROM2Q8N271 834 aa23.83■■□□□ 1.41
HERC3-211ENST00000513325 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
HERC3-211ENST00000513325 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.81■■□□□ 1.4
HERC3-211ENST00000513325 IL2RBP14784 551 aa23.81■■□□□ 1.4
HERC3-211ENST00000513325 KCNQ2O43526 872 aa23.8■■□□□ 1.4
HERC3-211ENST00000513325 SLC24A1O60721 1099 aa23.8■■□□□ 1.4
HERC3-211ENST00000513325 IP6K1Q92551 441 aa23.79■■□□□ 1.4
HERC3-211ENST00000513325 SPON1Q9HCB6 807 aa23.79■■□□□ 1.4
HERC3-211ENST00000513325 TXNRD1Q16881 649 aa23.78■■□□□ 1.4
HERC3-211ENST00000513325 COG3Q96JB2 828 aa23.78■■□□□ 1.4
HERC3-211ENST00000513325 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
HERC3-211ENST00000513325 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.77■■□□□ 1.4
HERC3-211ENST00000513325 FBLN1P23142 703 aa23.75■■□□□ 1.39
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
HERC3-211ENST00000513325 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.74■■□□□ 1.39
HERC3-211ENST00000513325 USP47Q96K76 1375 aa23.74■■□□□ 1.39
HERC3-211ENST00000513325 TMF1P82094 1093 aa23.73■■□□□ 1.39
HERC3-211ENST00000513325 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.73■■□□□ 1.39
HERC3-211ENST00000513325 NHSQ6T4R5 1651 aa23.73■■□□□ 1.39
HERC3-211ENST00000513325 HOXC9P31274 260 aa23.71■■□□□ 1.39
HERC3-211ENST00000513325 AMPHP49418 695 aa23.71■■□□□ 1.39
HERC3-211ENST00000513325 STK32BQ9NY57 414 aa23.71■■□□□ 1.39
HERC3-211ENST00000513325 CASZ1Q86V15 1759 aa23.7■■□□□ 1.38
HERC3-211ENST00000513325 SLC15A2Q16348 729 aa23.69■■□□□ 1.38
HERC3-211ENST00000513325 FYB1O15117 783 aa23.68■■□□□ 1.38
HERC3-211ENST00000513325 ZBTB7AO95365 584 aa23.68■■□□□ 1.38
HERC3-211ENST00000513325 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
HERC3-211ENST00000513325 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.68■■□□□ 1.38
HERC3-211ENST00000513325 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
HERC3-211ENST00000513325 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
HERC3-211ENST00000513325 BTAF1O14981 1849 aa23.64■■□□□ 1.38
HERC3-211ENST00000513325 CDCA8Q53HL2 280 aa23.64■■□□□ 1.37
HERC3-211ENST00000513325 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
HERC3-211ENST00000513325 PTGER2P43116 358 aa23.62■■□□□ 1.37
HERC3-211ENST00000513325 RTL1A6NKG5 1358 aa23.62■■□□□ 1.37
HERC3-211ENST00000513325 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.61■■□□□ 1.37
HERC3-211ENST00000513325 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.61■■□□□ 1.37
HERC3-211ENST00000513325 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.6■■□□□ 1.37
HERC3-211ENST00000513325 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
HERC3-211ENST00000513325 NBPF4Q96M43 638 aa23.6■■□□□ 1.37
HERC3-211ENST00000513325 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.6■■□□□ 1.37
HERC3-211ENST00000513325 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
HERC3-211ENST00000513325 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.59■■□□□ 1.37
HERC3-211ENST00000513325 MEGF6O75095 1541 aa23.59■■□□□ 1.37
HERC3-211ENST00000513325 MTFR1LQ9H019 292 aa23.58■■□□□ 1.37
HERC3-211ENST00000513325 PAPPAQ13219 1627 aa23.58■■□□□ 1.36
HERC3-211ENST00000513325 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.57■■□□□ 1.36
HERC3-211ENST00000513325 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
HERC3-211ENST00000513325 ZNF827Q17R98 1081 aa23.57■■□□□ 1.36
HERC3-211ENST00000513325 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.57■■□□□ 1.36
HERC3-211ENST00000513325 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.57■■□□□ 1.36
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