RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510021.5

UBE2B-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 415 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-207ENST00000510021 CRB1P82279 1406 aa23.31■■□□□ 1.32
UBE2B-207ENST00000510021 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
UBE2B-207ENST00000510021 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
UBE2B-207ENST00000510021 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
UBE2B-207ENST00000510021 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.28■■□□□ 1.32
UBE2B-207ENST00000510021 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.27■■□□□ 1.32
UBE2B-207ENST00000510021 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.27■■□□□ 1.32
UBE2B-207ENST00000510021 POLD1P28340 1107 aa23.26■■□□□ 1.31
UBE2B-207ENST00000510021 ITGAEP38570 1179 aa23.26■■□□□ 1.31
UBE2B-207ENST00000510021 KIF3CO14782 793 aa23.25■■□□□ 1.31
UBE2B-207ENST00000510021 ZNF827Q17R98 1081 aa23.25■■□□□ 1.31
UBE2B-207ENST00000510021 RGL3Q3MIN7 710 aa23.24■■□□□ 1.31
UBE2B-207ENST00000510021 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.23■■□□□ 1.31
UBE2B-207ENST00000510021 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
UBE2B-207ENST00000510021 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
UBE2B-207ENST00000510021 POGKQ9P215 609 aa23.23■■□□□ 1.31
UBE2B-207ENST00000510021 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.22■■□□□ 1.31
UBE2B-207ENST00000510021 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.2■■□□□ 1.3
UBE2B-207ENST00000510021 ITSN1Q15811 1721 aa23.19■■□□□ 1.3
UBE2B-207ENST00000510021 WDR90Q96KV7 1748 aa23.19■■□□□ 1.3
UBE2B-207ENST00000510021 USP19O94966 1318 aa23.19■■□□□ 1.3
UBE2B-207ENST00000510021 JMYQ8N9B5 988 aa23.19■■□□□ 1.3
UBE2B-207ENST00000510021 PCDH10Q9P2E7 1040 aa23.19■■□□□ 1.3
UBE2B-207ENST00000510021 NHSQ6T4R5 1651 aa23.19■■□□□ 1.3
UBE2B-207ENST00000510021 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
UBE2B-207ENST00000510021 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
UBE2B-207ENST00000510021 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.16■■□□□ 1.3
UBE2B-207ENST00000510021 PCNTO95613 3336 aa23.15■■□□□ 1.3
UBE2B-207ENST00000510021 KLRG1Q96E93 195 aa23.14■■□□□ 1.29
UBE2B-207ENST00000510021 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
UBE2B-207ENST00000510021 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.12■■□□□ 1.29
UBE2B-207ENST00000510021 AKT1S1Q96B36 256 aa23.12■■□□□ 1.29
UBE2B-207ENST00000510021 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.12■■□□□ 1.29
UBE2B-207ENST00000510021 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.11■■□□□ 1.29
UBE2B-207ENST00000510021 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
UBE2B-207ENST00000510021 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.11■■□□□ 1.29
UBE2B-207ENST00000510021 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
UBE2B-207ENST00000510021 GCP02774 474 aa23.1■■□□□ 1.29
UBE2B-207ENST00000510021 ABTB2Q8N961 1025 aa23.09■■□□□ 1.29
UBE2B-207ENST00000510021 BTAF1O14981 1849 aa23.09■■□□□ 1.29
UBE2B-207ENST00000510021 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
UBE2B-207ENST00000510021 TOMM70O94826 608 aa23.08■■□□□ 1.29
UBE2B-207ENST00000510021 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.07■■□□□ 1.28
UBE2B-207ENST00000510021 ADGRB1O14514 1584 aa23.06■■□□□ 1.28
UBE2B-207ENST00000510021 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
UBE2B-207ENST00000510021 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
UBE2B-207ENST00000510021 COL18A1P39060 1754 aa23.05■■□□□ 1.28
UBE2B-207ENST00000510021 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.05■■□□□ 1.28
UBE2B-207ENST00000510021 HTRA3P83110 453 aa23.04■■□□□ 1.28
UBE2B-207ENST00000510021 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.04■■□□□ 1.28
UBE2B-207ENST00000510021 TNS2Q63HR2 1409 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2B-207ENST00000510021 ACEP12821 1306 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2B-207ENST00000510021 USP6P35125 1406 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2B-207ENST00000510021 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2B-207ENST00000510021 EXOC5O00471 708 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2B-207ENST00000510021 NLRP13Q86W25 1043 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2B-207ENST00000510021 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2B-207ENST00000510021 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2B-207ENST00000510021 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2B-207ENST00000510021 ABCC6O95255 1503 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2B-207ENST00000510021 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2B-207ENST00000510021 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2B-207ENST00000510021 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2B-207ENST00000510021 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2B-207ENST00000510021 SLIT3O75094 1523 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2B-207ENST00000510021 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2B-207ENST00000510021 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2B-207ENST00000510021 RGPD5Q99666 1765 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2B-207ENST00000510021 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
UBE2B-207ENST00000510021 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
UBE2B-207ENST00000510021 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
UBE2B-207ENST00000510021 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
UBE2B-207ENST00000510021 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.9■■□□□ 1.26
UBE2B-207ENST00000510021 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.9■■□□□ 1.26
UBE2B-207ENST00000510021 CCDC7Q96M83 1385 aa22.89■■□□□ 1.26
UBE2B-207ENST00000510021 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.89■■□□□ 1.25
UBE2B-207ENST00000510021 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
UBE2B-207ENST00000510021 MSL1Q68DK7 614 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2B-207ENST00000510021 KCNQ4P56696 695 aa22.87■■□□□ 1.25
UBE2B-207ENST00000510021 CDK19Q9BWU1 502 aa22.87■■□□□ 1.25
UBE2B-207ENST00000510021 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2B-207ENST00000510021 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2B-207ENST00000510021 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
UBE2B-207ENST00000510021 PIK3C2AO00443 1686 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2B-207ENST00000510021 FSTL1Q12841 308 aa22.85■■□□□ 1.25
UBE2B-207ENST00000510021 MSH5O43196 834 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2B-207ENST00000510021 LY75O60449 1722 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2B-207ENST00000510021 NLRP6P59044 892 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2B-207ENST00000510021 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.8■■□□□ 1.24
UBE2B-207ENST00000510021 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
UBE2B-207ENST00000510021 FAM161AQ3B820 660 aa22.73■■□□□ 1.23
UBE2B-207ENST00000510021 IL2RBP14784 551 aa22.72■■□□□ 1.23
UBE2B-207ENST00000510021 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.71■■□□□ 1.23
UBE2B-207ENST00000510021 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
UBE2B-207ENST00000510021 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.71■■□□□ 1.23
UBE2B-207ENST00000510021 USP54Q70EL1 1684 aa22.7■■□□□ 1.22
UBE2B-207ENST00000510021 NSD2O96028 1365 aa22.69■■□□□ 1.22
UBE2B-207ENST00000510021 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2B-207ENST00000510021 NFAT5O94916 1531 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2B-207ENST00000510021 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.67■■□□□ 1.22
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