RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USP31Q70CQ4 1352 aa32.77■■■□□ 2.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP32.77■■■□□ 2.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A1W2PP64 1363 aa32.76■■■□□ 2.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRIM37O94972 964 aa32.76■■■□□ 2.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa32.76■■■□□ 2.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WDR17Q8IZU2 1322 aa32.76■■■□□ 2.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RGPD5Q99666 1765 aa32.75■■■□□ 2.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USP47Q96K76 1375 aa32.75■■■□□ 2.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP32.75■■■□□ 2.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa32.75■■■□□ 2.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NFAT5O94916 1531 aa32.75■■■□□ 2.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLSPNQ9HAW4 1339 aa32.74■■■□□ 2.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NINLQ9Y2I6 1382 aa32.72■■■□□ 2.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMF1P82094 1093 aa32.72■■■□□ 2.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP32.71■■■□□ 2.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USP54Q70EL1 1684 aa32.69■■■□□ 2.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP32.68■■■□□ 2.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 APBA3O96018 575 aa32.67■■■□□ 2.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DDB1Q16531 1140 aa32.67■■■□□ 2.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CARD10Q9BWT7 1032 aa32.67■■■□□ 2.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DISP2A7MBM2 1401 aa32.64■■■□□ 2.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP32.64■■■□□ 2.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABCC6O95255 1503 aa32.63■■■□□ 2.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP32.63■■■□□ 2.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LTN1O94822 1766 aa32.63■■■□□ 2.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP32.62■■■□□ 2.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CDCA8Q53HL2 280 aa32.61■■■□□ 2.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa32.6■■■□□ 2.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OVOS2Q6IE36 1432 aa32.6■■■□□ 2.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LRRC37A3O60309 1634 aa32.6■■■□□ 2.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP32.6■■■□□ 2.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COG3Q96JB2 828 aa32.6■■■□□ 2.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WNK3Q9BYP7 1800 aa32.6■■■□□ 2.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa32.59■■■□□ 2.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP32.59■■■□□ 2.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CAMKK2Q96RR4 588 aa32.59■■■□□ 2.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC7Q96M83 1385 aa32.58■■■□□ 2.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NLRP2Q9NX02 1062 aa32.58■■■□□ 2.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa32.58■■■□□ 2.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERBB3P21860 1342 aa32.56■■■□□ 2.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EXOC5O00471 708 aa32.55■■■□□ 2.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANKRD24Q8TF21 1146 aa32.55■■■□□ 2.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa32.54■■■□□ 2.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PARD3Q8TEW0 1356 aa32.53■■■□□ 2.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PEAK1Q9H792 1746 aa32.52■■■□□ 2.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IP6K1Q92551 441 aa32.51■■■□□ 2.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP32.5■■■□□ 2.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP32.48■■■□□ 2.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SBF2Q86WG5 1849 aa32.48■■■□□ 2.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FYB1O15117 783 aa32.47■■■□□ 2.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FBLN1P23142 703 aa32.47■■■□□ 2.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AMPHP49418 695 aa32.47■■■□□ 2.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GGNBP2Q9H3C7 697 aa32.47■■■□□ 2.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAP3K19Q56UN5 1328 aa32.46■■■□□ 2.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IL2RBP14784 551 aa32.45■■■□□ 2.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP32.44■■■□□ 2.78
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NBPF14Q5TI25 921 aa32.42■■■□□ 2.78
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RREB1Q92766 1687 aa32.42■■■□□ 2.78
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TNS2Q63HR2 1409 aa32.42■■■□□ 2.78
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HOXC9P31274 260 aa32.41■■■□□ 2.78
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PTF1AQ7RTS3 328 aa32.41■■■□□ 2.78
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BCL9O00512 1426 aa32.4■■■□□ 2.78
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POLR3GLQ9BT43 218 aa32.39■■■□□ 2.78
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NUP188Q5SRE5 1749 aa32.38■■■□□ 2.77
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLSCR1O15162 318 aa32.38■■■□□ 2.77
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYOM1P52179 1685 aa32.37■■■□□ 2.77
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP32.37■■■□□ 2.77
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CARD14Q9BXL6 1004 aa32.37■■■□□ 2.77
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIF20BQ96Q89 1820 aa32.37■■■□□ 2.77
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LRP5O75197 1615 aa32.34■■■□□ 2.77
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NSD3Q9BZ95 1437 aa32.34■■■□□ 2.77
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RTL1A6NKG5 1358 aa32.32■■■□□ 2.77
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ACSBG1Q96GR2 724 aa32.31■■■□□ 2.76
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP32.31■■■□□ 2.76
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa32.31■■■□□ 2.76
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCNQ2O43526 872 aa32.3■■■□□ 2.76
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KAT6BQ8WYB5 2073 aa32.28■■■□□ 2.76
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RGPD2P0DJD1 1756 aa32.28■■■□□ 2.76
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa32.24■■■□□ 2.75
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PROM2Q8N271 834 aa32.24■■■□□ 2.75
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NHSQ6T4R5 1651 aa32.24■■■□□ 2.75
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CGNL1Q0VF96 1302 aa32.24■■■□□ 2.75
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NBPF6Q5VWK0 638 aa32.23■■■□□ 2.75
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NBPF4Q96M43 638 aa32.23■■■□□ 2.75
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TXNRD1Q16881 649 aa32.22■■■□□ 2.75
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FLT4P35916 1363 aa32.21■■■□□ 2.75
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USHBP1Q8N6Y0 703 aa32.21■■■□□ 2.75
HOXC-AS1-201ENST00000505700 INSRP06213 1382 aa32.2■■■□□ 2.75
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIF24Q5T7B8 1368 aa32.19■■■□□ 2.74
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa32.19■■■□□ 2.74
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa32.17■■■□□ 2.74
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