RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503219.5

SH3BP2-206, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP2, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-206ENST00000503219 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-206ENST00000503219 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-206ENST00000503219 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-206ENST00000503219 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-206ENST00000503219 LRRC37A3O60309 1634 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-206ENST00000503219 TRIM37O94972 964 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-206ENST00000503219 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-206ENST00000503219 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-206ENST00000503219 FBLN1P23142 703 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-206ENST00000503219 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-206ENST00000503219 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-206ENST00000503219 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-206ENST00000503219 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-206ENST00000503219 PDE3BQ13370 1112 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-206ENST00000503219 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-206ENST00000503219 PEAK1Q9H792 1746 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-206ENST00000503219 BAG6P46379 1132 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-206ENST00000503219 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-206ENST00000503219 MYOM1P52179 1685 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-206ENST00000503219 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-206ENST00000503219 TMF1P82094 1093 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-206ENST00000503219 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-206ENST00000503219 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-206ENST00000503219 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-206ENST00000503219 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-206ENST00000503219 SBF2Q86WG5 1849 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-206ENST00000503219 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-206ENST00000503219 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-206ENST00000503219 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-206ENST00000503219 DISP2A7MBM2 1401 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-206ENST00000503219 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-206ENST00000503219 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-206ENST00000503219 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-206ENST00000503219 ABCC6O95255 1503 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-206ENST00000503219 APBA3O96018 575 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-206ENST00000503219 DDB1Q16531 1140 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-206ENST00000503219 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-206ENST00000503219 ERBB3P21860 1342 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-206ENST00000503219 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-206ENST00000503219 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-206ENST00000503219 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-206ENST00000503219 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-206ENST00000503219 FYB1O15117 783 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-206ENST00000503219 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-206ENST00000503219 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-206ENST00000503219 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-206ENST00000503219 COG3Q96JB2 828 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-206ENST00000503219 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-206ENST00000503219 RREB1Q92766 1687 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-206ENST00000503219 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-206ENST00000503219 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-206ENST00000503219 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-206ENST00000503219 SLC24A1O60721 1099 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-206ENST00000503219 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-206ENST00000503219 CCDC7Q96M83 1385 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-206ENST00000503219 IP6K1Q92551 441 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-206ENST00000503219 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-206ENST00000503219 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-206ENST00000503219 HOXC9P31274 260 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-206ENST00000503219 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-206ENST00000503219 TNS2Q63HR2 1409 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-206ENST00000503219 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-206ENST00000503219 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-206ENST00000503219 EXOC5O00471 708 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-206ENST00000503219 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-206ENST00000503219 CDCA8Q53HL2 280 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-206ENST00000503219 AMPHP49418 695 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-206ENST00000503219 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-206ENST00000503219 KCNQ2O43526 872 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-206ENST00000503219 IL2RBP14784 551 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-206ENST00000503219 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-206ENST00000503219 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-206ENST00000503219 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-206ENST00000503219 BCL9O00512 1426 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-206ENST00000503219 PROM2Q8N271 834 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-206ENST00000503219 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-206ENST00000503219 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-206ENST00000503219 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-206ENST00000503219 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-206ENST00000503219 NHSQ6T4R5 1651 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-206ENST00000503219 LRP5O75197 1615 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-206ENST00000503219 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-206ENST00000503219 NBPF4Q96M43 638 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-206ENST00000503219 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-206ENST00000503219 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-206ENST00000503219 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-206ENST00000503219 MEGF6O75095 1541 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-206ENST00000503219 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-206ENST00000503219 RTL1A6NKG5 1358 aa22.39■■□□□ 1.18
SH3BP2-206ENST00000503219 PLSCR1O15162 318 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-206ENST00000503219 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-206ENST00000503219 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-206ENST00000503219 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-206ENST00000503219 BTAF1O14981 1849 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-206ENST00000503219 PANK3Q9H999 370 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-206ENST00000503219 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-206ENST00000503219 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-206ENST00000503219 INSRP06213 1382 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-206ENST00000503219 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-206ENST00000503219 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
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