RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PTPRN-217ENST00000489650 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRN-217ENST00000489650 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
PTPRN-217ENST00000489650 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
PTPRN-217ENST00000489650 AKAP12Q02952 1782 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRN-217ENST00000489650 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
PTPRN-217ENST00000489650 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
PTPRN-217ENST00000489650 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.46■■□□□ 1.83
PTPRN-217ENST00000489650 PLSCR1O15162 318 aa26.45■■□□□ 1.82
PTPRN-217ENST00000489650 KCNQ2O43526 872 aa26.45■■□□□ 1.82
PTPRN-217ENST00000489650 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.45■■□□□ 1.82
PTPRN-217ENST00000489650 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.45■■□□□ 1.82
PTPRN-217ENST00000489650 SPON1Q9HCB6 807 aa26.45■■□□□ 1.82
PTPRN-217ENST00000489650 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
PTPRN-217ENST00000489650 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
PTPRN-217ENST00000489650 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.41■■□□□ 1.82
PTPRN-217ENST00000489650 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
PTPRN-217ENST00000489650 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRN-217ENST00000489650 PROM2Q8N271 834 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRN-217ENST00000489650 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
PTPRN-217ENST00000489650 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
PTPRN-217ENST00000489650 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
PTPRN-217ENST00000489650 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRN-217ENST00000489650 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.38■■□□□ 1.81
PTPRN-217ENST00000489650 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
PTPRN-217ENST00000489650 EXOC5O00471 708 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRN-217ENST00000489650 NFAT5O94916 1531 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRN-217ENST00000489650 YY1P25490 414 aa26.34■■□□□ 1.81
PTPRN-217ENST00000489650 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.33■■□□□ 1.81
PTPRN-217ENST00000489650 CASZ1Q86V15 1759 aa26.33■■□□□ 1.8
PTPRN-217ENST00000489650 BCL9O00512 1426 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRN-217ENST00000489650 ZBTB7AO95365 584 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRN-217ENST00000489650 TXNRD1Q16881 649 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRN-217ENST00000489650 NME9Q86XW9 330 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRN-217ENST00000489650 TMC1Q8TDI8 760 aa26.31■■□□□ 1.8
PTPRN-217ENST00000489650 CCDC7Q96M83 1385 aa26.31■■□□□ 1.8
PTPRN-217ENST00000489650 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.29■■□□□ 1.8
PTPRN-217ENST00000489650 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
PTPRN-217ENST00000489650 DCAF8L1A6NGE4 600 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRN-217ENST00000489650 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRN-217ENST00000489650 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRN-217ENST00000489650 STK32BQ9NY57 414 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRN-217ENST00000489650 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRN-217ENST00000489650 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRN-217ENST00000489650 USP31Q70CQ4 1352 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRN-217ENST00000489650 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRN-217ENST00000489650 LTN1O94822 1766 aa26.26■■□□□ 1.79
PTPRN-217ENST00000489650 TNS2Q63HR2 1409 aa26.26■■□□□ 1.79
PTPRN-217ENST00000489650 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRN-217ENST00000489650 SLC15A2Q16348 729 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRN-217ENST00000489650 ABCC6O95255 1503 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRN-217ENST00000489650 ERBB3P21860 1342 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRN-217ENST00000489650 PTGER2P43116 358 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRN-217ENST00000489650 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
PTPRN-217ENST00000489650 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRN-217ENST00000489650 IL2RBP14784 551 aa26.22■■□□□ 1.79
PTPRN-217ENST00000489650 MYOM1P52179 1685 aa26.22■■□□□ 1.79
PTPRN-217ENST00000489650 USP54Q70EL1 1684 aa26.22■■□□□ 1.79
PTPRN-217ENST00000489650 NHSQ6T4R5 1651 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRN-217ENST00000489650 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRN-217ENST00000489650 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
PTPRN-217ENST00000489650 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
PTPRN-217ENST00000489650 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPRN-217ENST00000489650 A0A1W2PP64 1363 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPRN-217ENST00000489650 BTAF1O14981 1849 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRN-217ENST00000489650 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
PTPRN-217ENST00000489650 MTFR1LQ9H019 292 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRN-217ENST00000489650 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PTPRN-217ENST00000489650 SYT17Q9BSW7 474 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRN-217ENST00000489650 TONSLQ96HA7 1378 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRN-217ENST00000489650 IP6K1Q92551 441 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRN-217ENST00000489650 UTRNP46939 3433 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRN-217ENST00000489650 FBLN1P23142 703 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF827Q17R98 1081 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRN-217ENST00000489650 SGIP1Q9BQI5 828 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRN-217ENST00000489650 LRRC4BQ9NT99 713 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRN-217ENST00000489650 PAPPAQ13219 1627 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRN-217ENST00000489650 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PTPRN-217ENST00000489650 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRN-217ENST00000489650 COG3Q96JB2 828 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRN-217ENST00000489650 ARXQ96QS3 562 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRN-217ENST00000489650 TESK2Q96S53 571 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRN-217ENST00000489650 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRN-217ENST00000489650 KCNQ4P56696 695 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRN-217ENST00000489650 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
PTPRN-217ENST00000489650 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRN-217ENST00000489650 HOXC9P31274 260 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRN-217ENST00000489650 AMPHP49418 695 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRN-217ENST00000489650 AKT1S1Q96B36 256 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRN-217ENST00000489650 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
PTPRN-217ENST00000489650 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PTPRN-217ENST00000489650 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRN-217ENST00000489650 KLHL34Q8N239 644 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRN-217ENST00000489650 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PTPRN-217ENST00000489650 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
PTPRN-217ENST00000489650 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRN-217ENST00000489650 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.95■■□□□ 1.75
PTPRN-217ENST00000489650 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.95■■□□□ 1.74
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