RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
SH3BP4-210ENST00000489601 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP4-210ENST00000489601 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP4-210ENST00000489601 SBF2Q86WG5 1849 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP4-210ENST00000489601 LRRC37A3O60309 1634 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP4-210ENST00000489601 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP4-210ENST00000489601 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP4-210ENST00000489601 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP4-210ENST00000489601 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP4-210ENST00000489601 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP4-210ENST00000489601 DDB1Q16531 1140 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP4-210ENST00000489601 NFAT5O94916 1531 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP4-210ENST00000489601 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SH3BP4-210ENST00000489601 NBPF14Q5TI25 921 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP4-210ENST00000489601 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP4-210ENST00000489601 ABCC6O95255 1503 aa23.58■■□□□ 1.36
SH3BP4-210ENST00000489601 USP54Q70EL1 1684 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP4-210ENST00000489601 SOX12O15370 315 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP4-210ENST00000489601 USP31Q70CQ4 1352 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP4-210ENST00000489601 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SH3BP4-210ENST00000489601 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP4-210ENST00000489601 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP4-210ENST00000489601 TONSLQ96HA7 1378 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP4-210ENST00000489601 BCL9O00512 1426 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP4-210ENST00000489601 PLSCR1O15162 318 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP4-210ENST00000489601 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP4-210ENST00000489601 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
SH3BP4-210ENST00000489601 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SH3BP4-210ENST00000489601 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SH3BP4-210ENST00000489601 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SH3BP4-210ENST00000489601 CCDC7Q96M83 1385 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP4-210ENST00000489601 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SH3BP4-210ENST00000489601 TMC1Q8TDI8 760 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP4-210ENST00000489601 NME9Q86XW9 330 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP4-210ENST00000489601 LTN1O94822 1766 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP4-210ENST00000489601 EXOC5O00471 708 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP4-210ENST00000489601 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP4-210ENST00000489601 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP4-210ENST00000489601 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP4-210ENST00000489601 ERBB3P21860 1342 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP4-210ENST00000489601 A0A1W2PP64 1363 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP4-210ENST00000489601 TNS2Q63HR2 1409 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4-210ENST00000489601 TESK2Q96S53 571 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC24A1O60721 1099 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP4-210ENST00000489601 PROM2Q8N271 834 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP4-210ENST00000489601 SPON1Q9HCB6 807 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP4-210ENST00000489601 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP4-210ENST00000489601 KCNQ2O43526 872 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP4-210ENST00000489601 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP4-210ENST00000489601 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4-210ENST00000489601 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4-210ENST00000489601 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4-210ENST00000489601 IL2RBP14784 551 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP4-210ENST00000489601 NHSQ6T4R5 1651 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP4-210ENST00000489601 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4-210ENST00000489601 CASZ1Q86V15 1759 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4-210ENST00000489601 TXNRD1Q16881 649 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4-210ENST00000489601 IP6K1Q92551 441 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-210ENST00000489601 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4-210ENST00000489601 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SH3BP4-210ENST00000489601 COG3Q96JB2 828 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4-210ENST00000489601 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-210ENST00000489601 STK32BQ9NY57 414 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-210ENST00000489601 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC15A2Q16348 729 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-210ENST00000489601 BTAF1O14981 1849 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-210ENST00000489601 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-210ENST00000489601 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4-210ENST00000489601 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SH3BP4-210ENST00000489601 HOXC9P31274 260 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP4-210ENST00000489601 TMF1P82094 1093 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP4-210ENST00000489601 USP47Q96K76 1375 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP4-210ENST00000489601 ZBTB7AO95365 584 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-210ENST00000489601 AMPHP49418 695 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-210ENST00000489601 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4-210ENST00000489601 FBLN1P23142 703 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4-210ENST00000489601 PAPPAQ13219 1627 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP4-210ENST00000489601 FYB1O15117 783 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP4-210ENST00000489601 PTGER2P43116 358 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP4-210ENST00000489601 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4-210ENST00000489601 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4-210ENST00000489601 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4-210ENST00000489601 RTL1A6NKG5 1358 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4-210ENST00000489601 MYOM1P52179 1685 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP4-210ENST00000489601 CDCA8Q53HL2 280 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP4-210ENST00000489601 MTFR1LQ9H019 292 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP4-210ENST00000489601 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-210ENST00000489601 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-210ENST00000489601 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SH3BP4-210ENST00000489601 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SH3BP4-210ENST00000489601 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP4-210ENST00000489601 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-210ENST00000489601 YY1P25490 414 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-210ENST00000489601 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4-210ENST00000489601 MEGF6O75095 1541 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP4-210ENST00000489601 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP4-210ENST00000489601 NBPF4Q96M43 638 aa23.15■■□□□ 1.3
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