RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489581.1

TOP3B-217, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 789 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-217ENST00000489581 PLSCR1O15162 318 aa24.39■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 KCNQ2O43526 872 aa24.39■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.39■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.38■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.38■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 AKAP12Q02952 1782 aa24.37■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.37■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.37■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.37■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.35■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.35■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 YY1P25490 414 aa24.34■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 NEUROD1Q13562 356 aa24.32■■□□□ 1.48
TOP3B-217ENST00000489581 PROM2Q8N271 834 aa24.32■■□□□ 1.48
TOP3B-217ENST00000489581 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.32■■□□□ 1.48
TOP3B-217ENST00000489581 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.32■■□□□ 1.48
TOP3B-217ENST00000489581 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
TOP3B-217ENST00000489581 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.3■■□□□ 1.48
TOP3B-217ENST00000489581 EXOC5O00471 708 aa24.29■■□□□ 1.48
TOP3B-217ENST00000489581 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TOP3B-217ENST00000489581 CASZ1Q86V15 1759 aa24.28■■□□□ 1.48
TOP3B-217ENST00000489581 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.28■■□□□ 1.48
TOP3B-217ENST00000489581 BCL9O00512 1426 aa24.27■■□□□ 1.48
TOP3B-217ENST00000489581 NFAT5O94916 1531 aa24.27■■□□□ 1.48
TOP3B-217ENST00000489581 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.27■■□□□ 1.48
TOP3B-217ENST00000489581 ZBTB7AO95365 584 aa24.25■■□□□ 1.47
TOP3B-217ENST00000489581 TXNRD1Q16881 649 aa24.25■■□□□ 1.47
TOP3B-217ENST00000489581 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.25■■□□□ 1.47
TOP3B-217ENST00000489581 CCDC7Q96M83 1385 aa24.24■■□□□ 1.47
TOP3B-217ENST00000489581 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.24■■□□□ 1.47
TOP3B-217ENST00000489581 STK32BQ9NY57 414 aa24.22■■□□□ 1.47
TOP3B-217ENST00000489581 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
TOP3B-217ENST00000489581 NME9Q86XW9 330 aa24.2■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.2■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.2■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 TNS2Q63HR2 1409 aa24.19■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 SLC15A2Q16348 729 aa24.19■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 ABCC6O95255 1503 aa24.19■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 LTN1O94822 1766 aa24.19■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 PTGER2P43116 358 aa24.18■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 MYOM1P52179 1685 aa24.18■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 USP31Q70CQ4 1352 aa24.17■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 TMC1Q8TDI8 760 aa24.17■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 ERBB3P21860 1342 aa24.16■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 NHSQ6T4R5 1651 aa24.15■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 USP54Q70EL1 1684 aa24.15■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.15■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.15■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.15■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 IL2RBP14784 551 aa24.14■■□□□ 1.45
TOP3B-217ENST00000489581 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.14■■□□□ 1.45
TOP3B-217ENST00000489581 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
TOP3B-217ENST00000489581 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.13■■□□□ 1.45
TOP3B-217ENST00000489581 MTFR1LQ9H019 292 aa24.11■■□□□ 1.45
TOP3B-217ENST00000489581 BTAF1O14981 1849 aa24.11■■□□□ 1.45
TOP3B-217ENST00000489581 SYT17Q9BSW7 474 aa24.1■■□□□ 1.45
TOP3B-217ENST00000489581 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
TOP3B-217ENST00000489581 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
TOP3B-217ENST00000489581 UTRNP46939 3433 aa24.07■■□□□ 1.44
TOP3B-217ENST00000489581 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.07■■□□□ 1.44
TOP3B-217ENST00000489581 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.06■■□□□ 1.44
TOP3B-217ENST00000489581 A0A1W2PP64 1363 aa24.05■■□□□ 1.44
TOP3B-217ENST00000489581 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
TOP3B-217ENST00000489581 PAPPAQ13219 1627 aa24.05■■□□□ 1.44
TOP3B-217ENST00000489581 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.04■■□□□ 1.44
TOP3B-217ENST00000489581 CHD4Q14839 1912 aa24.04■■□□□ 1.44
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF827Q17R98 1081 aa24.03■■□□□ 1.44
TOP3B-217ENST00000489581 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
TOP3B-217ENST00000489581 IP6K1Q92551 441 aa24.03■■□□□ 1.44
TOP3B-217ENST00000489581 ARXQ96QS3 562 aa24.02■■□□□ 1.44
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
TOP3B-217ENST00000489581 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
TOP3B-217ENST00000489581 TONSLQ96HA7 1378 aa23.98■■□□□ 1.43
TOP3B-217ENST00000489581 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
TOP3B-217ENST00000489581 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.97■■□□□ 1.43
TOP3B-217ENST00000489581 FBLN1P23142 703 aa23.97■■□□□ 1.43
TOP3B-217ENST00000489581 AKT1S1Q96B36 256 aa23.96■■□□□ 1.43
TOP3B-217ENST00000489581 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
TOP3B-217ENST00000489581 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.95■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 KCNQ4P56696 695 aa23.95■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 COG3Q96JB2 828 aa23.95■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 AMPHP49418 695 aa23.94■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.94■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 TESK2Q96S53 571 aa23.94■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.93■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 HOXC9P31274 260 aa23.93■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.93■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.92■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 KLHL34Q8N239 644 aa23.92■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.92■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 MAP3K5Q99683 1374 aa23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms