RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489581.1

TOP3B-217, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 789 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-217ENST00000489581 PLSCR1O15162 318 aa24.39■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 KCNQ2O43526 872 aa24.39■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.39■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.38■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.38■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 AKAP12Q02952 1782 aa24.37■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.37■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.37■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.37■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.35■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.35■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 YY1P25490 414 aa24.34■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
TOP3B-217ENST00000489581 NEUROD1Q13562 356 aa24.32■■□□□ 1.48
TOP3B-217ENST00000489581 PROM2Q8N271 834 aa24.32■■□□□ 1.48
TOP3B-217ENST00000489581 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.32■■□□□ 1.48
TOP3B-217ENST00000489581 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.32■■□□□ 1.48
TOP3B-217ENST00000489581 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
TOP3B-217ENST00000489581 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.3■■□□□ 1.48
TOP3B-217ENST00000489581 EXOC5O00471 708 aa24.29■■□□□ 1.48
TOP3B-217ENST00000489581 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TOP3B-217ENST00000489581 CASZ1Q86V15 1759 aa24.28■■□□□ 1.48
TOP3B-217ENST00000489581 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.28■■□□□ 1.48
TOP3B-217ENST00000489581 BCL9O00512 1426 aa24.27■■□□□ 1.48
TOP3B-217ENST00000489581 NFAT5O94916 1531 aa24.27■■□□□ 1.48
TOP3B-217ENST00000489581 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.27■■□□□ 1.48
TOP3B-217ENST00000489581 ZBTB7AO95365 584 aa24.25■■□□□ 1.47
TOP3B-217ENST00000489581 TXNRD1Q16881 649 aa24.25■■□□□ 1.47
TOP3B-217ENST00000489581 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.25■■□□□ 1.47
TOP3B-217ENST00000489581 CCDC7Q96M83 1385 aa24.24■■□□□ 1.47
TOP3B-217ENST00000489581 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.24■■□□□ 1.47
TOP3B-217ENST00000489581 STK32BQ9NY57 414 aa24.22■■□□□ 1.47
TOP3B-217ENST00000489581 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
TOP3B-217ENST00000489581 NME9Q86XW9 330 aa24.2■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.2■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.2■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 TNS2Q63HR2 1409 aa24.19■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 SLC15A2Q16348 729 aa24.19■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 ABCC6O95255 1503 aa24.19■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 LTN1O94822 1766 aa24.19■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 PTGER2P43116 358 aa24.18■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 MYOM1P52179 1685 aa24.18■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 USP31Q70CQ4 1352 aa24.17■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 TMC1Q8TDI8 760 aa24.17■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 ERBB3P21860 1342 aa24.16■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 NHSQ6T4R5 1651 aa24.15■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 USP54Q70EL1 1684 aa24.15■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.15■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.15■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.15■■□□□ 1.46
TOP3B-217ENST00000489581 IL2RBP14784 551 aa24.14■■□□□ 1.45
TOP3B-217ENST00000489581 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.14■■□□□ 1.45
TOP3B-217ENST00000489581 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
TOP3B-217ENST00000489581 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.13■■□□□ 1.45
TOP3B-217ENST00000489581 MTFR1LQ9H019 292 aa24.11■■□□□ 1.45
TOP3B-217ENST00000489581 BTAF1O14981 1849 aa24.11■■□□□ 1.45
TOP3B-217ENST00000489581 SYT17Q9BSW7 474 aa24.1■■□□□ 1.45
TOP3B-217ENST00000489581 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
TOP3B-217ENST00000489581 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
TOP3B-217ENST00000489581 UTRNP46939 3433 aa24.07■■□□□ 1.44
TOP3B-217ENST00000489581 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.07■■□□□ 1.44
TOP3B-217ENST00000489581 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.06■■□□□ 1.44
TOP3B-217ENST00000489581 A0A1W2PP64 1363 aa24.05■■□□□ 1.44
TOP3B-217ENST00000489581 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
TOP3B-217ENST00000489581 PAPPAQ13219 1627 aa24.05■■□□□ 1.44
TOP3B-217ENST00000489581 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.04■■□□□ 1.44
TOP3B-217ENST00000489581 CHD4Q14839 1912 aa24.04■■□□□ 1.44
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF827Q17R98 1081 aa24.03■■□□□ 1.44
TOP3B-217ENST00000489581 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
TOP3B-217ENST00000489581 IP6K1Q92551 441 aa24.03■■□□□ 1.44
TOP3B-217ENST00000489581 ARXQ96QS3 562 aa24.02■■□□□ 1.44
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
TOP3B-217ENST00000489581 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
TOP3B-217ENST00000489581 TONSLQ96HA7 1378 aa23.98■■□□□ 1.43
TOP3B-217ENST00000489581 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
TOP3B-217ENST00000489581 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.97■■□□□ 1.43
TOP3B-217ENST00000489581 FBLN1P23142 703 aa23.97■■□□□ 1.43
TOP3B-217ENST00000489581 AKT1S1Q96B36 256 aa23.96■■□□□ 1.43
TOP3B-217ENST00000489581 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
TOP3B-217ENST00000489581 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.95■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 KCNQ4P56696 695 aa23.95■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 COG3Q96JB2 828 aa23.95■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 AMPHP49418 695 aa23.94■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.94■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 TESK2Q96S53 571 aa23.94■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.93■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 HOXC9P31274 260 aa23.93■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.93■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.92■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 KLHL34Q8N239 644 aa23.92■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.92■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 MAP3K5Q99683 1374 aa23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms