RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484986.1

PTPRN-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-215ENST00000484986 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa31.47■■■□□ 2.63
PTPRN-215ENST00000484986 OVOS2Q6IE36 1432 aa31.47■■■□□ 2.63
PTPRN-215ENST00000484986 NBPF14Q5TI25 921 aa31.46■■■□□ 2.63
PTPRN-215ENST00000484986 SOX12O15370 315 aa31.43■■■□□ 2.62
PTPRN-215ENST00000484986 COL18A1P39060 1754 aa31.42■■■□□ 2.62
PTPRN-215ENST00000484986 AKAP12Q02952 1782 aa31.42■■■□□ 2.62
PTPRN-215ENST00000484986 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa31.41■■■□□ 2.62
PTPRN-215ENST00000484986 CARD10Q9BWT7 1032 aa31.41■■■□□ 2.62
PTPRN-215ENST00000484986 TONSLQ96HA7 1378 aa31.4■■■□□ 2.62
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PTPRN-215ENST00000484986 LRRC37A3O60309 1634 aa31.36■■■□□ 2.61
PTPRN-215ENST00000484986 USP31Q70CQ4 1352 aa31.36■■■□□ 2.61
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PTPRN-215ENST00000484986 NFAT5O94916 1531 aa31.35■■■□□ 2.61
PTPRN-215ENST00000484986 ABCC6O95255 1503 aa31.35■■■□□ 2.61
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PTPRN-215ENST00000484986 MON2Q7Z3U7 1717 aa31.32■■■□□ 2.6
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PTPRN-215ENST00000484986 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
PTPRN-215ENST00000484986 NUP188Q5SRE5 1749 aa31.31■■■□□ 2.6
PTPRN-215ENST00000484986 CD163L1Q9NR16 1453 aa31.29■■■□□ 2.6
PTPRN-215ENST00000484986 NME9Q86XW9 330 aa31.29■■■□□ 2.6
PTPRN-215ENST00000484986 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa31.29■■■□□ 2.6
PTPRN-215ENST00000484986 SLC24A1O60721 1099 aa31.28■■■□□ 2.6
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PTPRN-215ENST00000484986 RGPD5Q99666 1765 aa31.22■■■□□ 2.59
PTPRN-215ENST00000484986 USP54Q70EL1 1684 aa31.22■■■□□ 2.59
PTPRN-215ENST00000484986 NINLQ9Y2I6 1382 aa31.22■■■□□ 2.59
PTPRN-215ENST00000484986 NLRP2Q9NX02 1062 aa31.22■■■□□ 2.59
PTPRN-215ENST00000484986 A0A1W2PP64 1363 aa31.21■■■□□ 2.59
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PTPRN-215ENST00000484986 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
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PTPRN-215ENST00000484986 LTN1O94822 1766 aa31.1■■■□□ 2.57
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PTPRN-215ENST00000484986 SLC15A2Q16348 729 aa31.04■■■□□ 2.56
PTPRN-215ENST00000484986 TMF1P82094 1093 aa31.03■■■□□ 2.56
PTPRN-215ENST00000484986 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa31.03■■■□□ 2.56
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PTPRN-215ENST00000484986 AMPHP49418 695 aa31.01■■■□□ 2.55
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PTPRN-215ENST00000484986 ZBTB7AO95365 584 aa30.99■■■□□ 2.55
PTPRN-215ENST00000484986 CASZ1Q86V15 1759 aa30.99■■■□□ 2.55
PTPRN-215ENST00000484986 HOXC9P31274 260 aa30.98■■■□□ 2.55
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PTPRN-215ENST00000484986 RTL1A6NKG5 1358 aa30.93■■■□□ 2.54
PTPRN-215ENST00000484986 MTFR1LQ9H019 292 aa30.93■■■□□ 2.54
PTPRN-215ENST00000484986 PTGER2P43116 358 aa30.92■■■□□ 2.54
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PTPRN-215ENST00000484986 SLC27A3Q5K4L6 730 aa30.89■■■□□ 2.54
PTPRN-215ENST00000484986 GGNBP2Q9H3C7 697 aa30.88■■■□□ 2.53
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PTPRN-215ENST00000484986 CGNL1Q0VF96 1302 aa30.85■■■□□ 2.53
PTPRN-215ENST00000484986 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
PTPRN-215ENST00000484986 LRRC4BQ9NT99 713 aa30.84■■■□□ 2.53
PTPRN-215ENST00000484986 PAPPAQ13219 1627 aa30.83■■■□□ 2.53
PTPRN-215ENST00000484986 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF827Q17R98 1081 aa30.81■■■□□ 2.52
PTPRN-215ENST00000484986 NBPF6Q5VWK0 638 aa30.81■■■□□ 2.52
PTPRN-215ENST00000484986 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa30.81■■■□□ 2.52
PTPRN-215ENST00000484986 NBPF4Q96M43 638 aa30.81■■■□□ 2.52
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