RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 SLC24A1O60721 1099 aa26.41■■□□□ 1.82
UPP1-211ENST00000482015 FAM196AQ6ZSG2 479 aa26.41■■□□□ 1.82
UPP1-211ENST00000482015 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.4■■□□□ 1.82
UPP1-211ENST00000482015 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
UPP1-211ENST00000482015 NFAT5O94916 1531 aa26.4■■□□□ 1.82
UPP1-211ENST00000482015 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.4■■□□□ 1.82
UPP1-211ENST00000482015 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.39■■□□□ 1.82
UPP1-211ENST00000482015 TRIM37O94972 964 aa26.38■■□□□ 1.81
UPP1-211ENST00000482015 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
UPP1-211ENST00000482015 TMF1P82094 1093 aa26.37■■□□□ 1.81
UPP1-211ENST00000482015 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.36■■□□□ 1.81
UPP1-211ENST00000482015 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.35■■□□□ 1.81
UPP1-211ENST00000482015 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.32■■□□□ 1.8
UPP1-211ENST00000482015 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.31■■□□□ 1.8
UPP1-211ENST00000482015 USP54Q70EL1 1684 aa26.31■■□□□ 1.8
UPP1-211ENST00000482015 DDB1Q16531 1140 aa26.3■■□□□ 1.8
UPP1-211ENST00000482015 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
UPP1-211ENST00000482015 RGPD5Q99666 1765 aa26.3■■□□□ 1.8
UPP1-211ENST00000482015 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.3■■□□□ 1.8
UPP1-211ENST00000482015 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.3■■□□□ 1.8
UPP1-211ENST00000482015 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
UPP1-211ENST00000482015 APBA3O96018 575 aa26.29■■□□□ 1.8
UPP1-211ENST00000482015 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
UPP1-211ENST00000482015 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.29■■□□□ 1.8
UPP1-211ENST00000482015 DISP2A7MBM2 1401 aa26.29■■□□□ 1.8
UPP1-211ENST00000482015 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
UPP1-211ENST00000482015 ABCC6O95255 1503 aa26.26■■□□□ 1.79
UPP1-211ENST00000482015 COG3Q96JB2 828 aa26.26■■□□□ 1.79
UPP1-211ENST00000482015 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.26■■□□□ 1.79
UPP1-211ENST00000482015 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
UPP1-211ENST00000482015 ERBB3P21860 1342 aa26.25■■□□□ 1.79
UPP1-211ENST00000482015 CDCA8Q53HL2 280 aa26.25■■□□□ 1.79
UPP1-211ENST00000482015 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
UPP1-211ENST00000482015 FBLN1P23142 703 aa26.24■■□□□ 1.79
UPP1-211ENST00000482015 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.24■■□□□ 1.79
UPP1-211ENST00000482015 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.24■■□□□ 1.79
UPP1-211ENST00000482015 LRRC37A3O60309 1634 aa26.24■■□□□ 1.79
UPP1-211ENST00000482015 CCDC7Q96M83 1385 aa26.23■■□□□ 1.79
UPP1-211ENST00000482015 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.23■■□□□ 1.79
UPP1-211ENST00000482015 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.22■■□□□ 1.79
UPP1-211ENST00000482015 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
UPP1-211ENST00000482015 LTN1O94822 1766 aa26.21■■□□□ 1.79
UPP1-211ENST00000482015 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
UPP1-211ENST00000482015 FYB1O15117 783 aa26.2■■□□□ 1.78
UPP1-211ENST00000482015 IP6K1Q92551 441 aa26.2■■□□□ 1.78
UPP1-211ENST00000482015 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.2■■□□□ 1.78
UPP1-211ENST00000482015 EXOC5O00471 708 aa26.19■■□□□ 1.78
UPP1-211ENST00000482015 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
UPP1-211ENST00000482015 PEAK1Q9H792 1746 aa26.18■■□□□ 1.78
UPP1-211ENST00000482015 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.18■■□□□ 1.78
UPP1-211ENST00000482015 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.17■■□□□ 1.78
UPP1-211ENST00000482015 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
UPP1-211ENST00000482015 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.16■■□□□ 1.78
UPP1-211ENST00000482015 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.16■■□□□ 1.78
UPP1-211ENST00000482015 AMPHP49418 695 aa26.15■■□□□ 1.78
UPP1-211ENST00000482015 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.15■■□□□ 1.78
UPP1-211ENST00000482015 IL2RBP14784 551 aa26.14■■□□□ 1.78
UPP1-211ENST00000482015 HOXC9P31274 260 aa26.14■■□□□ 1.78
UPP1-211ENST00000482015 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
UPP1-211ENST00000482015 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
UPP1-211ENST00000482015 TNS2Q63HR2 1409 aa26.12■■□□□ 1.77
UPP1-211ENST00000482015 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.11■■□□□ 1.77
UPP1-211ENST00000482015 BCL9O00512 1426 aa26.11■■□□□ 1.77
UPP1-211ENST00000482015 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
UPP1-211ENST00000482015 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.1■■□□□ 1.77
UPP1-211ENST00000482015 MYOM1P52179 1685 aa26.09■■□□□ 1.77
UPP1-211ENST00000482015 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.08■■□□□ 1.77
UPP1-211ENST00000482015 PLSCR1O15162 318 aa26.07■■□□□ 1.76
UPP1-211ENST00000482015 SBF2Q86WG5 1849 aa26.07■■□□□ 1.76
UPP1-211ENST00000482015 RREB1Q92766 1687 aa26.06■■□□□ 1.76
UPP1-211ENST00000482015 KCNQ2O43526 872 aa26.05■■□□□ 1.76
UPP1-211ENST00000482015 NBPF14Q5TI25 921 aa26.05■■□□□ 1.76
UPP1-211ENST00000482015 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.04■■□□□ 1.76
UPP1-211ENST00000482015 RTL1A6NKG5 1358 aa26.04■■□□□ 1.76
UPP1-211ENST00000482015 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.02■■□□□ 1.76
UPP1-211ENST00000482015 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.01■■□□□ 1.75
UPP1-211ENST00000482015 PROM2Q8N271 834 aa26.01■■□□□ 1.75
UPP1-211ENST00000482015 KIF20BQ96Q89 1820 aa26.01■■□□□ 1.75
UPP1-211ENST00000482015 NBPF6Q5VWK0 638 aa26■■□□□ 1.75
UPP1-211ENST00000482015 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
UPP1-211ENST00000482015 NBPF4Q96M43 638 aa26■■□□□ 1.75
UPP1-211ENST00000482015 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
UPP1-211ENST00000482015 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.98■■□□□ 1.75
UPP1-211ENST00000482015 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.98■■□□□ 1.75
UPP1-211ENST00000482015 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.98■■□□□ 1.75
UPP1-211ENST00000482015 LRP5O75197 1615 aa25.98■■□□□ 1.75
UPP1-211ENST00000482015 FLT4P35916 1363 aa25.96■■□□□ 1.75
UPP1-211ENST00000482015 TXNRD1Q16881 649 aa25.96■■□□□ 1.75
UPP1-211ENST00000482015 INSRP06213 1382 aa25.95■■□□□ 1.75
UPP1-211ENST00000482015 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
UPP1-211ENST00000482015 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
UPP1-211ENST00000482015 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
UPP1-211ENST00000482015 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.95■■□□□ 1.74
UPP1-211ENST00000482015 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.95■■□□□ 1.74
UPP1-211ENST00000482015 MEGF6O75095 1541 aa25.94■■□□□ 1.74
UPP1-211ENST00000482015 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
UPP1-211ENST00000482015 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
UPP1-211ENST00000482015 PANK3Q9H999 370 aa25.93■■□□□ 1.74
UPP1-211ENST00000482015 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.93■■□□□ 1.74
UPP1-211ENST00000482015 NHSQ6T4R5 1651 aa25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms