RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 TERF2IPQ9NYB0 399 aa11.35□□□□□ -0.59
CTPS1-209ENST00000480420 MON2Q7Z3U7 1717 aa11.35□□□□□ -0.59
CTPS1-209ENST00000480420 CRB1P82279 1406 aa11.35□□□□□ -0.59
CTPS1-209ENST00000480420 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
CTPS1-209ENST00000480420 DDB1Q16531 1140 aa11.34□□□□□ -0.59
CTPS1-209ENST00000480420 POLR3GLQ9BT43 218 aa11.34□□□□□ -0.59
CTPS1-209ENST00000480420 AXIN2Q9Y2T1 843 aa11.34□□□□□ -0.59
CTPS1-209ENST00000480420 SLIT3O75094 1523 aa11.34□□□□□ -0.59
CTPS1-209ENST00000480420 LTN1O94822 1766 aa11.33□□□□□ -0.59
CTPS1-209ENST00000480420 AATKQ6ZMQ8 1374 aa11.33□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 NLRP2Q9NX02 1062 aa11.33□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 ARHGEF25Q86VW2 580 aa11.32□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 WDR17Q8IZU2 1322 aa11.32□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 COL18A1P39060 1754 aa11.31□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 DISP2A7MBM2 1401 aa11.3□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1W2PP64 1363 aa11.29□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa11.29□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 EXOC5O00471 708 aa11.29□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 TMF1P82094 1093 aa11.29□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 WNK3Q9BYP7 1800 aa11.29□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 USP47Q96K76 1375 aa11.28□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 LRRC37A3O60309 1634 aa11.28□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 NBPF14Q5TI25 921 aa11.28□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 COG3Q96JB2 828 aa11.28□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 CAMKK2Q96RR4 588 aa11.28□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 CARD10Q9BWT7 1032 aa11.28□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 NFAT5O94916 1531 aa11.28□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa11.27□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa11.27□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 OVOS2Q6IE36 1432 aa11.27□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 RREB1Q92766 1687 aa11.27□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 CD163L1Q9NR16 1453 aa11.27□□□□□ -0.6
CTPS1-209ENST00000480420 FBLN1P23142 703 aa11.27□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 AMPHP49418 695 aa11.27□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 ANKRD24Q8TF21 1146 aa11.27□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 TESK2Q96S53 571 aa11.27□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 SBF2Q86WG5 1849 aa11.27□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 NUP188Q5SRE5 1749 aa11.26□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 YY1P25490 414 aa11.26□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 ACSBG1Q96GR2 724 aa11.26□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 SLC24A1O60721 1099 aa11.25□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 PTF1AQ7RTS3 328 aa11.25□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 GGNBP2Q9H3C7 697 aa11.25□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 USP31Q70CQ4 1352 aa11.25□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC7Q96M83 1385 aa11.24□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 RGPD2P0DJD1 1756 aa11.23□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 IL2RBP14784 551 aa11.23□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 CDCA8Q53HL2 280 aa11.23□□□□□ -0.61
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CTPS1-209ENST00000480420 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 ERBB3P21860 1342 aa11.23□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 KCNQ2O43526 872 aa11.22□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 PARD3Q8TEW0 1356 aa11.22□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 PEAK1Q9H792 1746 aa11.22□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 NINLQ9Y2I6 1382 aa11.22□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 KIF20BQ96Q89 1820 aa11.21□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 USP54Q70EL1 1684 aa11.21□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa11.21□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 MAP3K19Q56UN5 1328 aa11.21□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 IP6K1Q92551 441 aa11.21□□□□□ -0.61
CTPS1-209ENST00000480420 USHBP1Q8N6Y0 703 aa11.2□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 FYB1O15117 783 aa11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 HOXC9P31274 260 aa11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 ABCC6O95255 1503 aa11.19□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 TNS2Q63HR2 1409 aa11.18□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 TXNRD1Q16881 649 aa11.18□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 STK32BQ9NY57 414 aa11.18□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 PLSCR1O15162 318 aa11.17□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 SPON1Q9HCB6 807 aa11.17□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa11.17□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 NSD3Q9BZ95 1437 aa11.17□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 BTAF1O14981 1849 aa11.16□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 ZBTB7AO95365 584 aa11.16□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 MYOM1P52179 1685 aa11.16□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 UTRNP46939 3433 aa11.16□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 CLSPNQ9HAW4 1339 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 NHSQ6T4R5 1651 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
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