RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478988.2

PDZRN3-AS1-201, PDZRN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDZRN3-AS1, Length 961 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SEPT12Q8IYM1 358 aa7.68□□□□□ -1.18
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 BTG4Q9NY30 223 aa7.68□□□□□ -1.18
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ACEP12821 1306 aa7.68□□□□□ -1.18
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa7.68□□□□□ -1.18
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa7.68□□□□□ -1.18
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KIAA0232Q92628 1395 aa7.68□□□□□ -1.18
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa7.68□□□□□ -1.18
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NBPF8Q3BBV2 869 aa7.67□□□□□ -1.18
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KRT27Q7Z3Y8 459 aa7.67□□□□□ -1.18
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CLSPNQ9HAW4 1339 aa7.67□□□□□ -1.18
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NFAT5O94916 1531 aa7.67□□□□□ -1.18
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KIF20BQ96Q89 1820 aa7.66□□□□□ -1.18
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.66□□□□□ -1.18
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa7.66□□□□□ -1.18
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PRDM11Q9NQV5 511 aa7.65□□□□□ -1.18
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZRANB1Q9UGI0 708 aa7.65□□□□□ -1.18
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RGPD2P0DJD1 1756 aa7.64□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NHSQ6T4R5 1651 aa7.64□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CASZ1Q86V15 1759 aa7.64□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SHANK3Q9BYB0 1731 aa7.64□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MYOM1P52179 1685 aa7.63□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CD163L1Q9NR16 1453 aa7.63□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CRB1P82279 1406 aa7.63□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KAT6BQ8WYB5 2073 aa7.63□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 EVC2Q86UK5 1308 aa7.63□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PLEKHG5O94827 1062 aa7.63□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 BARGINQ6ZT62 677 aa7.63□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ABTB2Q8N961 1025 aa7.63□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 QSER1Q2KHR3 1735 aa7.63□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 AATKQ6ZMQ8 1374 aa7.62□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PARD3Q8TEW0 1356 aa7.62□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 BTAF1O14981 1849 aa7.62□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SPDYE4A6NLX3 237 aa7.62□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 EVX2Q03828 476 aa7.62□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NLRP13Q86W25 1043 aa7.62□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SIN3AQ96ST3 1273 aa7.62□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CABP2Q9NPB3 220 aa7.62□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa7.61□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GCP02774 474 aa7.61□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PRR29P0C7W0 189 aa7.61□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CHRNA2Q15822 529 aa7.61□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DEFB132Q7Z7B7 95 aa7.61□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FBXO3Q9UK99 471 aa7.61□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TTC21AQ8NDW8 1320 aa7.6□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 BAG6P46379 1132 aa7.6□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7.6□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CHADLQ6NUI6 762 aa7.6□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CABP1Q9NZU7 370 aa7.6□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 COL24A1Q17RW2 1714 aa7.6□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa7.6□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa7.6□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 BCL9O00512 1426 aa7.6□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 OVOS2Q6IE36 1432 aa7.6□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 USP31Q70CQ4 1352 aa7.59□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa7.59□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LY75O60449 1722 aa7.59□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 A0A0G2JS52 829 aa7.59□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MYT1Q01538 1121 aa7.59□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FAM196AQ6ZSG2 479 aa7.59□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TCP11L2Q8N4U5 519 aa7.59□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 STRN4Q9NRL3 753 aa7.59□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PAPPAQ13219 1627 aa7.59□□□□□ -1.19
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DOT1LQ8TEK3 1739 aa7.58□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa7.58□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TONSLQ96HA7 1378 aa7.58□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 WDR17Q8IZU2 1322 aa7.57□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NLRP6P59044 892 aa7.57□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FAM182BQ5T319 152 aa7.57□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KCNH5Q8NCM2 988 aa7.57□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TNS2Q63HR2 1409 aa7.57□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NINLQ9Y2I6 1382 aa7.57□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ITGB4P16144 1822 aa7.57□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TAF1LQ8IZX4 1826 aa7.57□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CHD4Q14839 1912 aa7.56□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 EVA1CP58658 441 aa7.56□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NEUROD1Q13562 356 aa7.56□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ARHGEF25Q86VW2 580 aa7.56□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CAMKK2Q96RR4 588 aa7.56□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 USP35Q9P2H5 1018 aa7.56□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms