RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477447.6

TARDBP-208, Transcript of TAR DNA binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene TARDBP, Length 409 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBP-208ENST00000477447 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TARDBP-208ENST00000477447 ALDH1A1P00352 501 aa6.55□□□□□ -1.36
TARDBP-208ENST00000477447 RNF135Q8IUD6 432 aa6.55□□□□□ -1.36
TARDBP-208ENST00000477447 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TARDBP-208ENST00000477447 CEP126Q9P2H0 1117 aa6.55□□□□□ -1.36
TARDBP-208ENST00000477447 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
TARDBP-208ENST00000477447 ADH1CP00326 375 aa6.54□□□□□ -1.36
TARDBP-208ENST00000477447 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
TARDBP-208ENST00000477447 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.54□□□□□ -1.36
TARDBP-208ENST00000477447 CYP4X1Q8N118 509 aa6.54□□□□□ -1.36
TARDBP-208ENST00000477447 CDK15Q96Q40 435 aa6.54□□□□□ -1.36
TARDBP-208ENST00000477447 SERPINA10Q9UK55 444 aa6.54□□□□□ -1.36
TARDBP-208ENST00000477447 ESPNB1AK53 854 aa6.53□□□□□ -1.36
TARDBP-208ENST00000477447 SKIP12755 728 aa6.53□□□□□ -1.36
TARDBP-208ENST00000477447 MPNDQ8N594 471 aa6.53□□□□□ -1.36
TARDBP-208ENST00000477447 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TARDBP-208ENST00000477447 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.53□□□□□ -1.36
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TARDBP-208ENST00000477447 PRR20CP86479 221 aa6.52□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 PRR20DP86480 221 aa6.52□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 PRR20BP86481 221 aa6.52□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 PRR20AP86496 221 aa6.52□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 RNF20Q5VTR2 975 aa6.52□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.52□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.52□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa6.52□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 J3QL48 77 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 ATP9BO43861 1147 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 GRM5P41594 1212 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 NR5A1Q13285 461 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 USP17L5A8MUK1 530 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 NR3C2P08235 984 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 NNTQ13423 1086 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 CCDC116Q8IYX3 515 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 DEPDC4Q8N2C3 294 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 USP17L3A6NCW0 530 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 USP17L4A6NCW7 530 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 RFX1P22670 979 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 TSGA10IPQ3SY00 556 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 CFAP70Q5T0N1 1121 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 USP17L2Q6R6M4 530 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 USP17L1Q7RTZ2 530 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 SMPD1P17405 629 aa6.48□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 NCOA4Q13772 614 aa6.48□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.48□□□□□ -1.37
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TARDBP-208ENST00000477447 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.48□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 FAM187AA6NFU0 413 aa6.47□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 EML3Q32P44 896 aa6.47□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 TRAF7Q6Q0C0 670 aa6.47□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 CCDC125Q86Z20 511 aa6.47□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 CYLDQ9NQC7 956 aa6.47□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.47□□□□□ -1.37
TARDBP-208ENST00000477447 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa6.46□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 HPS1Q92902 700 aa6.46□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.46□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa6.46□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 GFRA3O60609 400 aa6.45□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 MYCP01106 439 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 SCTRP47872 440 aa6.45□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 ERVK-9P63128 1117 aa6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 MYT1Q01538 1121 aa6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 CDCA8Q53HL2 280 aa6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 ITPKCQ96DU7 683 aa6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 NOD1Q9Y239 953 aa6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 TIMP2P16035 220 aa6.43□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 PKDCCQ504Y2 493 aa6.43□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 TRIM52Q96A61 297 aa6.43□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 PBXIP1Q96AQ6 731 aa6.43□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 SIRT1Q96EB6 747 aa6.43□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa6.42□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 LILRA1O75019 489 aa6.42□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 GTF2IP78347 998 aa6.42□□□□□ -1.38
TARDBP-208ENST00000477447 PSME1Q06323 249 aa6.42□□□□□ -1.38
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