RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465957.1

HPS1-207, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene HPS1, Length 922 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-207ENST00000465957 TRIM37O94972 964 aa22.98■■□□□ 1.27
HPS1-207ENST00000465957 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.98■■□□□ 1.27
HPS1-207ENST00000465957 NME9Q86XW9 330 aa22.98■■□□□ 1.27
HPS1-207ENST00000465957 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.97■■□□□ 1.27
HPS1-207ENST00000465957 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.96■■□□□ 1.27
HPS1-207ENST00000465957 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
HPS1-207ENST00000465957 NFAT5O94916 1531 aa22.94■■□□□ 1.26
HPS1-207ENST00000465957 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.94■■□□□ 1.26
HPS1-207ENST00000465957 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
HPS1-207ENST00000465957 USP31Q70CQ4 1352 aa22.93■■□□□ 1.26
HPS1-207ENST00000465957 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
HPS1-207ENST00000465957 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.93■■□□□ 1.26
HPS1-207ENST00000465957 A0A1W2PP64 1363 aa22.92■■□□□ 1.26
HPS1-207ENST00000465957 RGPD5Q99666 1765 aa22.92■■□□□ 1.26
HPS1-207ENST00000465957 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
HPS1-207ENST00000465957 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
HPS1-207ENST00000465957 APBA3O96018 575 aa22.9■■□□□ 1.26
HPS1-207ENST00000465957 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.9■■□□□ 1.26
HPS1-207ENST00000465957 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
HPS1-207ENST00000465957 DISP2A7MBM2 1401 aa22.9■■□□□ 1.26
HPS1-207ENST00000465957 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
HPS1-207ENST00000465957 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.89■■□□□ 1.25
HPS1-207ENST00000465957 DDB1Q16531 1140 aa22.88■■□□□ 1.25
HPS1-207ENST00000465957 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.87■■□□□ 1.25
HPS1-207ENST00000465957 USP47Q96K76 1375 aa22.87■■□□□ 1.25
HPS1-207ENST00000465957 USP54Q70EL1 1684 aa22.86■■□□□ 1.25
HPS1-207ENST00000465957 LRRC37A3O60309 1634 aa22.85■■□□□ 1.25
HPS1-207ENST00000465957 SLC24A1O60721 1099 aa22.84■■□□□ 1.25
HPS1-207ENST00000465957 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
HPS1-207ENST00000465957 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.82■■□□□ 1.24
HPS1-207ENST00000465957 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.82■■□□□ 1.24
HPS1-207ENST00000465957 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.82■■□□□ 1.24
HPS1-207ENST00000465957 TMF1P82094 1093 aa22.82■■□□□ 1.24
HPS1-207ENST00000465957 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
HPS1-207ENST00000465957 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
HPS1-207ENST00000465957 PEAK1Q9H792 1746 aa22.82■■□□□ 1.24
HPS1-207ENST00000465957 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.82■■□□□ 1.24
HPS1-207ENST00000465957 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.81■■□□□ 1.24
HPS1-207ENST00000465957 ABCC6O95255 1503 aa22.81■■□□□ 1.24
HPS1-207ENST00000465957 LTN1O94822 1766 aa22.81■■□□□ 1.24
HPS1-207ENST00000465957 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.8■■□□□ 1.24
HPS1-207ENST00000465957 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.8■■□□□ 1.24
HPS1-207ENST00000465957 ERBB3P21860 1342 aa22.8■■□□□ 1.24
HPS1-207ENST00000465957 CCDC7Q96M83 1385 aa22.79■■□□□ 1.24
HPS1-207ENST00000465957 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.79■■□□□ 1.24
HPS1-207ENST00000465957 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.78■■□□□ 1.24
HPS1-207ENST00000465957 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
HPS1-207ENST00000465957 FBLN1P23142 703 aa22.78■■□□□ 1.24
HPS1-207ENST00000465957 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.77■■□□□ 1.24
HPS1-207ENST00000465957 EXOC5O00471 708 aa22.77■■□□□ 1.24
HPS1-207ENST00000465957 COG3Q96JB2 828 aa22.77■■□□□ 1.24
HPS1-207ENST00000465957 SBF2Q86WG5 1849 aa22.75■■□□□ 1.23
HPS1-207ENST00000465957 IP6K1Q92551 441 aa22.74■■□□□ 1.23
HPS1-207ENST00000465957 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
HPS1-207ENST00000465957 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
HPS1-207ENST00000465957 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.73■■□□□ 1.23
HPS1-207ENST00000465957 RREB1Q92766 1687 aa22.73■■□□□ 1.23
HPS1-207ENST00000465957 FYB1O15117 783 aa22.72■■□□□ 1.23
HPS1-207ENST00000465957 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.72■■□□□ 1.23
HPS1-207ENST00000465957 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.71■■□□□ 1.23
HPS1-207ENST00000465957 IL2RBP14784 551 aa22.71■■□□□ 1.23
HPS1-207ENST00000465957 CDCA8Q53HL2 280 aa22.71■■□□□ 1.23
HPS1-207ENST00000465957 PLSCR1O15162 318 aa22.7■■□□□ 1.22
HPS1-207ENST00000465957 BCL9O00512 1426 aa22.7■■□□□ 1.22
HPS1-207ENST00000465957 TNS2Q63HR2 1409 aa22.7■■□□□ 1.22
HPS1-207ENST00000465957 LRP5O75197 1615 aa22.7■■□□□ 1.22
HPS1-207ENST00000465957 HOXC9P31274 260 aa22.69■■□□□ 1.22
HPS1-207ENST00000465957 NBPF14Q5TI25 921 aa22.69■■□□□ 1.22
HPS1-207ENST00000465957 KCNQ2O43526 872 aa22.68■■□□□ 1.22
HPS1-207ENST00000465957 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
HPS1-207ENST00000465957 AMPHP49418 695 aa22.68■■□□□ 1.22
HPS1-207ENST00000465957 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
HPS1-207ENST00000465957 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.67■■□□□ 1.22
HPS1-207ENST00000465957 PROM2Q8N271 834 aa22.66■■□□□ 1.22
HPS1-207ENST00000465957 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.66■■□□□ 1.22
HPS1-207ENST00000465957 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
HPS1-207ENST00000465957 MYOM1P52179 1685 aa22.62■■□□□ 1.21
HPS1-207ENST00000465957 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
HPS1-207ENST00000465957 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
HPS1-207ENST00000465957 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.61■■□□□ 1.21
HPS1-207ENST00000465957 POTEDQ86YR6 584 aa22.61■■□□□ 1.21
HPS1-207ENST00000465957 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.61■■□□□ 1.21
HPS1-207ENST00000465957 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.6■■□□□ 1.21
HPS1-207ENST00000465957 TXNRD1Q16881 649 aa22.6■■□□□ 1.21
HPS1-207ENST00000465957 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
HPS1-207ENST00000465957 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HPS1-207ENST00000465957 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.59■■□□□ 1.21
HPS1-207ENST00000465957 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.59■■□□□ 1.21
HPS1-207ENST00000465957 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.58■■□□□ 1.21
HPS1-207ENST00000465957 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.58■■□□□ 1.21
HPS1-207ENST00000465957 NBPF4Q96M43 638 aa22.58■■□□□ 1.21
HPS1-207ENST00000465957 RTL1A6NKG5 1358 aa22.58■■□□□ 1.21
HPS1-207ENST00000465957 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.57■■□□□ 1.2
HPS1-207ENST00000465957 NHSQ6T4R5 1651 aa22.57■■□□□ 1.2
HPS1-207ENST00000465957 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.55■■□□□ 1.2
HPS1-207ENST00000465957 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
HPS1-207ENST00000465957 MEGF6O75095 1541 aa22.54■■□□□ 1.2
HPS1-207ENST00000465957 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
HPS1-207ENST00000465957 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.53■■□□□ 1.2
HPS1-207ENST00000465957 INSRP06213 1382 aa22.52■■□□□ 1.2
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