RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 ARHGEF25Q86VW2 580 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP1-204ENST00000459646 COL18A1P39060 1754 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP1-204ENST00000459646 SBF2Q86WG5 1849 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP1-204ENST00000459646 WDR17Q8IZU2 1322 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP1-204ENST00000459646 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 EXOC5O00471 708 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 NME9Q86XW9 330 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 TERF2IPQ9NYB0 399 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 MON2Q7Z3U7 1717 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 LTN1O94822 1766 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 NLRP2Q9NX02 1062 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 WNK3Q9BYP7 1800 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 DISP2A7MBM2 1401 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 OVOS2Q6IE36 1432 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 CARD10Q9BWT7 1032 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 LRP5O75197 1615 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 PARD3Q8TEW0 1356 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 LRRC37A3O60309 1634 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 NUP188Q5SRE5 1749 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 RREB1Q92766 1687 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 PTF1AQ7RTS3 328 aa12.03□□□□□ -0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 ACSBG1Q96GR2 724 aa12.03□□□□□ -0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 ANKRD24Q8TF21 1146 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 PEAK1Q9H792 1746 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC7Q96M83 1385 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 NFAT5O94916 1531 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 PLSCR1O15162 318 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 COG3Q96JB2 828 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 SPON1Q9HCB6 807 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 DCAF8L1A6NGE4 600 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 IL2RBP14784 551 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 PCGF6Q9BYE7 350 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A1W2PP64 1363 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 USP31Q70CQ4 1352 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 KCNQ2O43526 872 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC24A1O60721 1099 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 FBLN1P23142 703 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 AMPHP49418 695 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 CD163L1Q9NR16 1453 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 ERBB3P21860 1342 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 TMF1P82094 1093 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 STK32BQ9NY57 414 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 TXNRD1Q16881 649 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 IP6K1Q92551 441 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 TESK2Q96S53 571 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 POLR3GLQ9BT43 218 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 RGPD2P0DJD1 1756 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 ZBTB7AO95365 584 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 PROM2Q8N271 834 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 USP54Q70EL1 1684 aa11.96□□□□□ -0.5
SH3BP1-204ENST00000459646 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-204ENST00000459646 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-204ENST00000459646 GGNBP2Q9H3C7 697 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-204ENST00000459646 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-204ENST00000459646 ABCC6O95255 1503 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-204ENST00000459646 TNS2Q63HR2 1409 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-204ENST00000459646 USP47Q96K76 1375 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-204ENST00000459646 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-204ENST00000459646 BTAF1O14981 1849 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-204ENST00000459646 NINLQ9Y2I6 1382 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-204ENST00000459646 MAP3K19Q56UN5 1328 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-204ENST00000459646 HOXC9P31274 260 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-204ENST00000459646 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC15A2Q16348 729 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-204ENST00000459646 CDCA8Q53HL2 280 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-204ENST00000459646 NHSQ6T4R5 1651 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-204ENST00000459646 KIF20BQ96Q89 1820 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-204ENST00000459646 FYB1O15117 783 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-204ENST00000459646 USHBP1Q8N6Y0 703 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-204ENST00000459646 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-204ENST00000459646 BCL9O00512 1426 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-204ENST00000459646 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-204ENST00000459646 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
SH3BP1-204ENST00000459646 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
SH3BP1-204ENST00000459646 CASZ1Q86V15 1759 aa11.9□□□□□ -0.51
SH3BP1-204ENST00000459646 YY1P25490 414 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-204ENST00000459646 KLHL34Q8N239 644 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-204ENST00000459646 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-204ENST00000459646 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-204ENST00000459646 TATP17735 454 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-204ENST00000459646 KCNQ4P56696 695 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-204ENST00000459646 NBPF6Q5VWK0 638 aa11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms