RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454278.5

ZNF638-208, Transcript of zinc finger protein 638, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF638, Length 595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF638-208ENST00000454278 PAPPAQ13219 1627 aa16.25■□□□□ 0.19
ZNF638-208ENST00000454278 USP6P35125 1406 aa16.25■□□□□ 0.19
ZNF638-208ENST00000454278 RGPD5Q99666 1765 aa16.25■□□□□ 0.19
ZNF638-208ENST00000454278 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa16.24■□□□□ 0.19
ZNF638-208ENST00000454278 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
ZNF638-208ENST00000454278 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
ZNF638-208ENST00000454278 PTGER2P43116 358 aa16.23■□□□□ 0.19
ZNF638-208ENST00000454278 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
ZNF638-208ENST00000454278 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
ZNF638-208ENST00000454278 ABCC6O95255 1503 aa16.22■□□□□ 0.19
ZNF638-208ENST00000454278 WDR17Q8IZU2 1322 aa16.21■□□□□ 0.19
ZNF638-208ENST00000454278 PTF1AQ7RTS3 328 aa16.21■□□□□ 0.19
ZNF638-208ENST00000454278 ZBTB7AO95365 584 aa16.2■□□□□ 0.18
ZNF638-208ENST00000454278 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa16.2■□□□□ 0.18
ZNF638-208ENST00000454278 PROM2Q8N271 834 aa16.2■□□□□ 0.18
ZNF638-208ENST00000454278 TNS2Q63HR2 1409 aa16.19■□□□□ 0.18
ZNF638-208ENST00000454278 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
ZNF638-208ENST00000454278 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
ZNF638-208ENST00000454278 QSER1Q2KHR3 1735 aa16.19■□□□□ 0.18
ZNF638-208ENST00000454278 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
ZNF638-208ENST00000454278 NFAT5O94916 1531 aa16.18■□□□□ 0.18
ZNF638-208ENST00000454278 COL24A1Q17RW2 1714 aa16.17■□□□□ 0.18
ZNF638-208ENST00000454278 MAP3K5Q99683 1374 aa16.17■□□□□ 0.18
ZNF638-208ENST00000454278 SLC15A2Q16348 729 aa16.17■□□□□ 0.18
ZNF638-208ENST00000454278 SGIP1Q9BQI5 828 aa16.17■□□□□ 0.18
ZNF638-208ENST00000454278 SYT17Q9BSW7 474 aa16.17■□□□□ 0.18
ZNF638-208ENST00000454278 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
ZNF638-208ENST00000454278 MTFR1LQ9H019 292 aa16.17■□□□□ 0.18
ZNF638-208ENST00000454278 STK32BQ9NY57 414 aa16.17■□□□□ 0.18
ZNF638-208ENST00000454278 USP54Q70EL1 1684 aa16.17■□□□□ 0.18
ZNF638-208ENST00000454278 BTAF1O14981 1849 aa16.17■□□□□ 0.18
ZNF638-208ENST00000454278 ZBTB7CA1YPR0 619 aa16.16■□□□□ 0.18
ZNF638-208ENST00000454278 NLRP6P59044 892 aa16.16■□□□□ 0.18
ZNF638-208ENST00000454278 TXNRD1Q16881 649 aa16.16■□□□□ 0.18
ZNF638-208ENST00000454278 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
ZNF638-208ENST00000454278 MON2Q7Z3U7 1717 aa16.14■□□□□ 0.17
ZNF638-208ENST00000454278 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa16.14■□□□□ 0.17
ZNF638-208ENST00000454278 CABP2Q9NPB3 220 aa16.14■□□□□ 0.17
ZNF638-208ENST00000454278 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
ZNF638-208ENST00000454278 AXIN2Q9Y2T1 843 aa16.14■□□□□ 0.17
ZNF638-208ENST00000454278 CCDC7Q96M83 1385 aa16.13■□□□□ 0.17
ZNF638-208ENST00000454278 CARD10Q9BWT7 1032 aa16.13■□□□□ 0.17
ZNF638-208ENST00000454278 C1QTNF8P60827 252 aa16.12■□□□□ 0.17
ZNF638-208ENST00000454278 ARHGEF25Q86VW2 580 aa16.12■□□□□ 0.17
ZNF638-208ENST00000454278 LTN1O94822 1766 aa16.12■□□□□ 0.17
ZNF638-208ENST00000454278 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa16.11■□□□□ 0.17
ZNF638-208ENST00000454278 NBPF1Q3BBV0 1214 aa16.11■□□□□ 0.17
ZNF638-208ENST00000454278 KCNH5Q8NCM2 988 aa16.1■□□□□ 0.17
ZNF638-208ENST00000454278 CABP1Q9NZU7 370 aa16.1■□□□□ 0.17
ZNF638-208ENST00000454278 SHANK3Q9BYB0 1731 aa16.1■□□□□ 0.17
ZNF638-208ENST00000454278 ARXQ96QS3 562 aa16.09■□□□□ 0.17
ZNF638-208ENST00000454278 EXOC5O00471 708 aa16.08■□□□□ 0.16
ZNF638-208ENST00000454278 TTC21AQ8NDW8 1320 aa16.08■□□□□ 0.16
ZNF638-208ENST00000454278 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa16.07■□□□□ 0.16
ZNF638-208ENST00000454278 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa16.07■□□□□ 0.16
ZNF638-208ENST00000454278 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ZNF638-208ENST00000454278 ERBB3P21860 1342 aa16.05■□□□□ 0.16
ZNF638-208ENST00000454278 EVC2Q86UK5 1308 aa16.05■□□□□ 0.16
ZNF638-208ENST00000454278 LY75O60449 1722 aa16.05■□□□□ 0.16
ZNF638-208ENST00000454278 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ZNF638-208ENST00000454278 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ZNF638-208ENST00000454278 DOT1LQ8TEK3 1739 aa16.03■□□□□ 0.16
ZNF638-208ENST00000454278 ZNF827Q17R98 1081 aa16.03■□□□□ 0.16
ZNF638-208ENST00000454278 SOX12O15370 315 aa16.02■□□□□ 0.16
ZNF638-208ENST00000454278 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
ZNF638-208ENST00000454278 ACSBG1Q96GR2 724 aa16.02■□□□□ 0.16
ZNF638-208ENST00000454278 IFFO2Q5TF58 517 aa16.01■□□□□ 0.15
ZNF638-208ENST00000454278 USP31Q70CQ4 1352 aa16■□□□□ 0.15
ZNF638-208ENST00000454278 GPR162Q16538 588 aa16■□□□□ 0.15
ZNF638-208ENST00000454278 SLC16A10Q8TF71 515 aa16■□□□□ 0.15
ZNF638-208ENST00000454278 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ZNF638-208ENST00000454278 IL2RBP14784 551 aa15.99■□□□□ 0.15
ZNF638-208ENST00000454278 AKT1S1Q96B36 256 aa15.99■□□□□ 0.15
ZNF638-208ENST00000454278 LRRC4BQ9NT99 713 aa15.99■□□□□ 0.15
ZNF638-208ENST00000454278 CD163L1Q9NR16 1453 aa15.97■□□□□ 0.15
ZNF638-208ENST00000454278 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa15.97■□□□□ 0.15
ZNF638-208ENST00000454278 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.97■□□□□ 0.15
ZNF638-208ENST00000454278 KAT6BQ8WYB5 2073 aa15.97■□□□□ 0.15
ZNF638-208ENST00000454278 POLD1P28340 1107 aa15.96■□□□□ 0.15
ZNF638-208ENST00000454278 NLRP2Q9NX02 1062 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF638-208ENST00000454278 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF638-208ENST00000454278 KLHL34Q8N239 644 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF638-208ENST00000454278 C5P01031 1676 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF638-208ENST00000454278 CEP350Q5VT06 3117 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF638-208ENST00000454278 NLGN2Q8NFZ4 835 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF638-208ENST00000454278 ANKRD24Q8TF21 1146 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF638-208ENST00000454278 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
ZNF638-208ENST00000454278 NSD2O96028 1365 aa15.92■□□□□ 0.14
ZNF638-208ENST00000454278 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa15.92■□□□□ 0.14
ZNF638-208ENST00000454278 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
ZNF638-208ENST00000454278 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
ZNF638-208ENST00000454278 RGPD2P0DJD1 1756 aa15.9■□□□□ 0.14
ZNF638-208ENST00000454278 ATP10DQ9P241 1426 aa15.89■□□□□ 0.13
ZNF638-208ENST00000454278 GRIN3BO60391 1043 aa15.89■□□□□ 0.13
ZNF638-208ENST00000454278 NME9Q86XW9 330 aa15.89■□□□□ 0.13
ZNF638-208ENST00000454278 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP15.89■□□□□ 0.139e-16■□□□□ 8.4
ZNF638-208ENST00000454278 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa15.89■□□□□ 0.13
ZNF638-208ENST00000454278 TAF1LQ8IZX4 1826 aa15.89■□□□□ 0.13
ZNF638-208ENST00000454278 ADCY9O60503 1353 aa15.88■□□□□ 0.13
ZNF638-208ENST00000454278 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.9 ms