RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439830.5

ANKRD28-203, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 5

Gene ANKRD28, Length 592 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-203ENST00000439830 TMC1Q8TDI8 760 aa35.69■■■■□ 3.3
ANKRD28-203ENST00000439830 LRP5O75197 1615 aa35.68■■■■□ 3.3
ANKRD28-203ENST00000439830 WDR17Q8IZU2 1322 aa35.68■■■■□ 3.3
ANKRD28-203ENST00000439830 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa35.68■■■■□ 3.3
ANKRD28-203ENST00000439830 SBF2Q86WG5 1849 aa35.67■■■■□ 3.3
ANKRD28-203ENST00000439830 PEAK1Q9H792 1746 aa35.67■■■■□ 3.3
ANKRD28-203ENST00000439830 RREB1Q92766 1687 aa35.67■■■■□ 3.3
ANKRD28-203ENST00000439830 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
ANKRD28-203ENST00000439830 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP35.66■■■■□ 3.33e-6■■□□□ 13.2
ANKRD28-203ENST00000439830 AXIN2Q9Y2T1 843 aa35.66■■■■□ 3.3
ANKRD28-203ENST00000439830 USP31Q70CQ4 1352 aa35.65■■■■□ 3.3
ANKRD28-203ENST00000439830 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
ANKRD28-203ENST00000439830 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
ANKRD28-203ENST00000439830 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa35.63■■■■□ 3.29
ANKRD28-203ENST00000439830 PARD3Q8TEW0 1356 aa35.63■■■■□ 3.29
ANKRD28-203ENST00000439830 A0A1W2PP64 1363 aa35.62■■■■□ 3.29
ANKRD28-203ENST00000439830 NUP188Q5SRE5 1749 aa35.61■■■■□ 3.29
ANKRD28-203ENST00000439830 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa35.61■■■■□ 3.29
ANKRD28-203ENST00000439830 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa35.61■■■■□ 3.29
ANKRD28-203ENST00000439830 OVOS2Q6IE36 1432 aa35.61■■■■□ 3.29
ANKRD28-203ENST00000439830 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
ANKRD28-203ENST00000439830 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
ANKRD28-203ENST00000439830 TERF2IPQ9NYB0 399 aa35.61■■■■□ 3.29
ANKRD28-203ENST00000439830 APBA3O96018 575 aa35.6■■■■□ 3.29
ANKRD28-203ENST00000439830 NME9Q86XW9 330 aa35.6■■■■□ 3.29
ANKRD28-203ENST00000439830 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
ANKRD28-203ENST00000439830 TESK2Q96S53 571 aa35.59■■■■□ 3.29
ANKRD28-203ENST00000439830 NINLQ9Y2I6 1382 aa35.59■■■■□ 3.29
ANKRD28-203ENST00000439830 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa35.58■■■■□ 3.29
ANKRD28-203ENST00000439830 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa35.58■■■■□ 3.29
ANKRD28-203ENST00000439830 CAMKK2Q96RR4 588 aa35.58■■■■□ 3.29
ANKRD28-203ENST00000439830 DDB1Q16531 1140 aa35.57■■■■□ 3.28
ANKRD28-203ENST00000439830 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
ANKRD28-203ENST00000439830 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa35.56■■■■□ 3.28
ANKRD28-203ENST00000439830 SLC24A1O60721 1099 aa35.55■■■■□ 3.28
ANKRD28-203ENST00000439830 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
ANKRD28-203ENST00000439830 CARD10Q9BWT7 1032 aa35.54■■■■□ 3.28
ANKRD28-203ENST00000439830 CCDC7Q96M83 1385 aa35.51■■■■□ 3.28
ANKRD28-203ENST00000439830 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP35.49■■■■□ 3.27
ANKRD28-203ENST00000439830 USP47Q96K76 1375 aa35.49■■■■□ 3.27
ANKRD28-203ENST00000439830 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
ANKRD28-203ENST00000439830 ERBB3P21860 1342 aa35.46■■■■□ 3.27
ANKRD28-203ENST00000439830 BCL9O00512 1426 aa35.43■■■■□ 3.26
ANKRD28-203ENST00000439830 TNS2Q63HR2 1409 aa35.43■■■■□ 3.26
ANKRD28-203ENST00000439830 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa35.41■■■■□ 3.26
ANKRD28-203ENST00000439830 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
ANKRD28-203ENST00000439830 TMF1P82094 1093 aa35.39■■■■□ 3.26
ANKRD28-203ENST00000439830 NLRP2Q9NX02 1062 aa35.38■■■■□ 3.25
ANKRD28-203ENST00000439830 KIF20BQ96Q89 1820 aa35.38■■■■□ 3.25
ANKRD28-203ENST00000439830 EXOC5O00471 708 aa35.37■■■■□ 3.25
ANKRD28-203ENST00000439830 NBPF14Q5TI25 921 aa35.36■■■■□ 3.25
ANKRD28-203ENST00000439830 ANKRD24Q8TF21 1146 aa35.36■■■■□ 3.25
ANKRD28-203ENST00000439830 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
ANKRD28-203ENST00000439830 KAT6BQ8WYB5 2073 aa35.36■■■■□ 3.25
ANKRD28-203ENST00000439830 NHSQ6T4R5 1651 aa35.35■■■■□ 3.25
ANKRD28-203ENST00000439830 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.34■■■■□ 3.25
ANKRD28-203ENST00000439830 COG3Q96JB2 828 aa35.34■■■■□ 3.25
ANKRD28-203ENST00000439830 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa35.34■■■■□ 3.25
ANKRD28-203ENST00000439830 MYOM1P52179 1685 aa35.33■■■■□ 3.25
ANKRD28-203ENST00000439830 PLSCR1O15162 318 aa35.32■■■■□ 3.24
ANKRD28-203ENST00000439830 RGPD2P0DJD1 1756 aa35.3■■■■□ 3.24
ANKRD28-203ENST00000439830 IL2RBP14784 551 aa35.3■■■■□ 3.24
ANKRD28-203ENST00000439830 IP6K1Q92551 441 aa35.3■■■■□ 3.24
ANKRD28-203ENST00000439830 CDCA8Q53HL2 280 aa35.29■■■■□ 3.24
ANKRD28-203ENST00000439830 PTF1AQ7RTS3 328 aa35.29■■■■□ 3.24
ANKRD28-203ENST00000439830 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.29■■■■□ 3.24
ANKRD28-203ENST00000439830 MAP3K19Q56UN5 1328 aa35.25■■■■□ 3.23
ANKRD28-203ENST00000439830 BTAF1O14981 1849 aa35.24■■■■□ 3.23
ANKRD28-203ENST00000439830 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
ANKRD28-203ENST00000439830 AMPHP49418 695 aa35.21■■■■□ 3.23
ANKRD28-203ENST00000439830 RTL1A6NKG5 1358 aa35.21■■■■□ 3.23
ANKRD28-203ENST00000439830 HOXC9P31274 260 aa35.2■■■■□ 3.23
ANKRD28-203ENST00000439830 CASZ1Q86V15 1759 aa35.19■■■■□ 3.22
ANKRD28-203ENST00000439830 FYB1O15117 783 aa35.18■■■■□ 3.22
ANKRD28-203ENST00000439830 GGNBP2Q9H3C7 697 aa35.18■■■■□ 3.22
ANKRD28-203ENST00000439830 FBLN1P23142 703 aa35.17■■■■□ 3.22
ANKRD28-203ENST00000439830 SHANK3Q9BYB0 1731 aa35.17■■■■□ 3.22
ANKRD28-203ENST00000439830 KCNQ2O43526 872 aa35.15■■■■□ 3.22
ANKRD28-203ENST00000439830 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
ANKRD28-203ENST00000439830 PROM2Q8N271 834 aa35.14■■■■□ 3.22
ANKRD28-203ENST00000439830 ACSBG1Q96GR2 724 aa35.14■■■■□ 3.22
ANKRD28-203ENST00000439830 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
ANKRD28-203ENST00000439830 TXNRD1Q16881 649 aa35.12■■■■□ 3.21
ANKRD28-203ENST00000439830 DOT1LQ8TEK3 1739 aa35.12■■■■□ 3.21
ANKRD28-203ENST00000439830 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
ANKRD28-203ENST00000439830 NSD3Q9BZ95 1437 aa35.1■■■■□ 3.21
ANKRD28-203ENST00000439830 SPON1Q9HCB6 807 aa35.08■■■■□ 3.21
ANKRD28-203ENST00000439830 MEGF6O75095 1541 aa35.06■■■■□ 3.2
ANKRD28-203ENST00000439830 PAPPAQ13219 1627 aa35.06■■■■□ 3.2
ANKRD28-203ENST00000439830 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa35.06■■■■□ 3.2
ANKRD28-203ENST00000439830 KIF24Q5T7B8 1368 aa35.04■■■■□ 3.2
ANKRD28-203ENST00000439830 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
ANKRD28-203ENST00000439830 CARD14Q9BXL6 1004 aa35.04■■■■□ 3.2
ANKRD28-203ENST00000439830 STK32BQ9NY57 414 aa35.04■■■■□ 3.2
ANKRD28-203ENST00000439830 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
ANKRD28-203ENST00000439830 FLT4P35916 1363 aa35.03■■■■□ 3.2
ANKRD28-203ENST00000439830 INSRP06213 1382 aa35.01■■■■□ 3.2
ANKRD28-203ENST00000439830 NBPF6Q5VWK0 638 aa34.99■■■■□ 3.19
ANKRD28-203ENST00000439830 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP34.99■■■■□ 3.19
ANKRD28-203ENST00000439830 NBPF4Q96M43 638 aa34.99■■■■□ 3.19
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