RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439128.6

NEK1-201, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 5,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1-201ENST00000439128 PRXQ9BXM0 1461 aa14.62□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 GNAI2P04899 355 aa14.61□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 GRM1Q13255 1194 aa14.61□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 NBPF8Q3BBV2 869 aa14.61□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 NBPF14Q5TI25 921 aa14.61□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 PANK1Q8TE04 598 aa14.61□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa14.61□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 ACSBG1Q96GR2 724 aa14.61□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 NACAP1Q9BZK3 213 aa14.6□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.6□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 AMOTQ4VCS5 1084 aa14.6□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.6□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 CUL7Q14999 1698 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 LRP2BPQ9P2M1 347 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.59□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 POLD1P28340 1107 aa14.58□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 WWC3Q9ULE0 1092 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 NPHP3Q7Z494 1330 aa14.58□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.57□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 ABCF2Q9UG63 623 aa14.57□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 TPM1P09493 284 aa14.57□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 C6orf229H3BNL8 230 aa14.57□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.56□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 NSD3Q9BZ95 1437 aa14.56□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 METTL24Q5JXM2 366 aa14.56□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 BECN2A8MW95 431 aa14.56□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 CAVIN4Q5BKX8 364 aa14.56□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 WDR78Q5VTH9 848 aa14.56□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 CHMP4BP1P59074 171 aa14.56□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 ATP2B1P20020 1258 aa14.56□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa14.56□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 MCM10Q7L590 875 aa14.56□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.56□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.56□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 BICD2Q8TD16 824 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 ANKRD24Q8TF21 1146 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 PSMA5P28066 241 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 ST5P78524 1137 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 MYD88Q99836 296 aa14.55□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 GPTP24298 496 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 HIP1O00291 1037 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 TDO2P48775 406 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 DDB1Q16531 1140 aa14.54□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.53□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 FCHSD2O94868 740 aa14.53□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 IFNL2Q8IZJ0 200 aa14.53□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 PAF1Q8N7H5 531 aa14.53□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 IDH1O75874 414 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 AACSQ86V21 672 aa14.52□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 CABLES1Q8TDN4 633 aa14.52□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 KRT18P05783 430 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 USP5P45974 858 aa14.52□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 NUP133Q8WUM0 1156 aa14.52□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa14.52□□□□□ -0.08
NEK1-201ENST00000439128 TIAM1Q13009 1591 aa14.52□□□□□ -0.09
NEK1-201ENST00000439128 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
NEK1-201ENST00000439128 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
NEK1-201ENST00000439128 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.52□□□□□ -0.09
NEK1-201ENST00000439128 NOS1P29475 1434 aa14.52□□□□□ -0.09
NEK1-201ENST00000439128 EPS15P42566 896 aa14.51□□□□□ -0.09
NEK1-201ENST00000439128 SOGA3Q5TF21 947 aa14.51□□□□□ -0.09
NEK1-201ENST00000439128 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa14.51□□□□□ -0.09
NEK1-201ENST00000439128 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NEK1-201ENST00000439128 SRGAP3O43295 1099 aa14.51□□□□□ -0.09
NEK1-201ENST00000439128 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa14.51□□□□□ -0.09
NEK1-201ENST00000439128 ACEP12821 1306 aa14.51□□□□□ -0.09
NEK1-201ENST00000439128 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NEK1-201ENST00000439128 NFE2L2Q16236 605 aa14.51□□□□□ -0.09
NEK1-201ENST00000439128 A0A087WZG4 1122 aa14.51□□□□□ -0.09
NEK1-201ENST00000439128 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NEK1-201ENST00000439128 ATP6V1AP38606 617 aa14.51□□□□□ -0.09
NEK1-201ENST00000439128 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NEK1-201ENST00000439128 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NEK1-201ENST00000439128 DCTN1Q14203 1278 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK1-201ENST00000439128 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 52.4
NEK1-201ENST00000439128 CCDC69A6NI79 296 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK1-201ENST00000439128 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NEK1-201ENST00000439128 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NEK1-201ENST00000439128 ZBTB3Q9H5J0 574 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK1-201ENST00000439128 CDC45O75419 566 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 279.2 ms