RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432588.5

ACTB-205, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-205ENST00000432588 DDB1Q16531 1140 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTB-205ENST00000432588 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTB-205ENST00000432588 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTB-205ENST00000432588 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTB-205ENST00000432588 COL18A1P39060 1754 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTB-205ENST00000432588 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
ACTB-205ENST00000432588 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTB-205ENST00000432588 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
ACTB-205ENST00000432588 TMC1Q8TDI8 760 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTB-205ENST00000432588 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-205ENST00000432588 NBPF14Q5TI25 921 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-205ENST00000432588 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
ACTB-205ENST00000432588 NFAT5O94916 1531 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-205ENST00000432588 LRRC37A3O60309 1634 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-205ENST00000432588 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-205ENST00000432588 ABCC6O95255 1503 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-205ENST00000432588 RREB1Q92766 1687 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-205ENST00000432588 USP31Q70CQ4 1352 aa22.89■■□□□ 1.26
ACTB-205ENST00000432588 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-205ENST00000432588 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
ACTB-205ENST00000432588 PEAK1Q9H792 1746 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-205ENST00000432588 CCDC7Q96M83 1385 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-205ENST00000432588 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-205ENST00000432588 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-205ENST00000432588 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-205ENST00000432588 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
ACTB-205ENST00000432588 NME9Q86XW9 330 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-205ENST00000432588 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-205ENST00000432588 PLSCR1O15162 318 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-205ENST00000432588 SLC24A1O60721 1099 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-205ENST00000432588 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
ACTB-205ENST00000432588 RGPD5Q99666 1765 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-205ENST00000432588 USP54Q70EL1 1684 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTB-205ENST00000432588 EXOC5O00471 708 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTB-205ENST00000432588 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
ACTB-205ENST00000432588 BCL9O00512 1426 aa22.83■■□□□ 1.25
ACTB-205ENST00000432588 A0A1W2PP64 1363 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-205ENST00000432588 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-205ENST00000432588 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
ACTB-205ENST00000432588 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
ACTB-205ENST00000432588 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-205ENST00000432588 ERBB3P21860 1342 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-205ENST00000432588 SBF2Q86WG5 1849 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-205ENST00000432588 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-205ENST00000432588 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.79■■□□□ 1.24
ACTB-205ENST00000432588 TESK2Q96S53 571 aa22.79■■□□□ 1.24
ACTB-205ENST00000432588 TNS2Q63HR2 1409 aa22.79■■□□□ 1.24
ACTB-205ENST00000432588 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.77■■□□□ 1.24
ACTB-205ENST00000432588 LTN1O94822 1766 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-205ENST00000432588 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-205ENST00000432588 IL2RBP14784 551 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-205ENST00000432588 SPON1Q9HCB6 807 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-205ENST00000432588 COG3Q96JB2 828 aa22.73■■□□□ 1.23
ACTB-205ENST00000432588 KCNQ2O43526 872 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-205ENST00000432588 IP6K1Q92551 441 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-205ENST00000432588 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
ACTB-205ENST00000432588 TMF1P82094 1093 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-205ENST00000432588 PROM2Q8N271 834 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-205ENST00000432588 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
ACTB-205ENST00000432588 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-205ENST00000432588 TXNRD1Q16881 649 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-205ENST00000432588 USP47Q96K76 1375 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-205ENST00000432588 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-205ENST00000432588 STK32BQ9NY57 414 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-205ENST00000432588 NHSQ6T4R5 1651 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTB-205ENST00000432588 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
ACTB-205ENST00000432588 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
ACTB-205ENST00000432588 AMPHP49418 695 aa22.65■■□□□ 1.22
ACTB-205ENST00000432588 CDCA8Q53HL2 280 aa22.65■■□□□ 1.22
ACTB-205ENST00000432588 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.64■■□□□ 1.22
ACTB-205ENST00000432588 HOXC9P31274 260 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-205ENST00000432588 SLC15A2Q16348 729 aa22.62■■□□□ 1.21
ACTB-205ENST00000432588 CASZ1Q86V15 1759 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-205ENST00000432588 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-205ENST00000432588 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
ACTB-205ENST00000432588 RTL1A6NKG5 1358 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-205ENST00000432588 FYB1O15117 783 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTB-205ENST00000432588 ZBTB7AO95365 584 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTB-205ENST00000432588 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
ACTB-205ENST00000432588 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTB-205ENST00000432588 FBLN1P23142 703 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-205ENST00000432588 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-205ENST00000432588 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
ACTB-205ENST00000432588 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
ACTB-205ENST00000432588 BTAF1O14981 1849 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-205ENST00000432588 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
ACTB-205ENST00000432588 MTFR1LQ9H019 292 aa22.54■■□□□ 1.2
ACTB-205ENST00000432588 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
ACTB-205ENST00000432588 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.54■■□□□ 1.2
ACTB-205ENST00000432588 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.53■■□□□ 1.2
ACTB-205ENST00000432588 PTGER2P43116 358 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-205ENST00000432588 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-205ENST00000432588 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
ACTB-205ENST00000432588 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-205ENST00000432588 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-205ENST00000432588 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTB-205ENST00000432588 PAPPAQ13219 1627 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTB-205ENST00000432588 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ACTB-205ENST00000432588 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTB-205ENST00000432588 NBPF4Q96M43 638 aa22.5■■□□□ 1.19
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