RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AKAP12Q02952 1782 aa13.7□□□□□ -0.22
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SMC1BQ8NDV3 1235 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AKT1S1Q96B36 256 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MSH5O43196 834 aa13.67□□□□□ -0.22
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KDM2BQ8NHM5 1336 aa13.57□□□□□ -0.24
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa13.55□□□□□ -0.24
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COL18A1P39060 1754 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ACSBG1Q96GR2 724 aa13.45□□□□□ -0.26
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MCOLN1Q9GZU1 580 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ABCC6O95255 1503 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BCS1LQ9Y276 419 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIF13BQ9NQT8 1826 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 VPS8Q8N3P4 1428 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM132EQ6IEE7 984 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRR36Q9H6K5 1346 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP54Q70EL1 1684 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCNQ4P56696 695 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SBF1O95248 1867 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WDR17Q8IZU2 1322 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
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