RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429755.8

HOXB-AS3-201, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 435 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-201ENST00000429755 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
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HOXB-AS3-201ENST00000429755 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ABCC6O95255 1503 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LRP5O75197 1615 aa21.83■■□□□ 1.08
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HOXB-AS3-201ENST00000429755 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NBPF14Q5TI25 921 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TMC1Q8TDI8 760 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CCDC7Q96M83 1385 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PLSCR1O15162 318 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.8■■□□□ 1.08
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HOXB-AS3-201ENST00000429755 NFAT5O94916 1531 aa21.78■■□□□ 1.08
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HOXB-AS3-201ENST00000429755 TESK2Q96S53 571 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SOX12O15370 315 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NME9Q86XW9 330 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PEAK1Q9H792 1746 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ERBB3P21860 1342 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-201ENST00000429755 A0A1W2PP64 1363 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LRRC37A3O60309 1634 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RREB1Q92766 1687 aa21.7■■□□□ 1.06
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HOXB-AS3-201ENST00000429755 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RGPD5Q99666 1765 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SBF2Q86WG5 1849 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-201ENST00000429755 IL2RBP14784 551 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TMF1P82094 1093 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CDCA8Q53HL2 280 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-201ENST00000429755 IP6K1Q92551 441 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-201ENST00000429755 WNK3Q9BYP7 1800 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-201ENST00000429755 COG3Q96JB2 828 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.65■■□□□ 1.06
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HOXB-AS3-201ENST00000429755 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TNS2Q63HR2 1409 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SPON1Q9HCB6 807 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PROM2Q8N271 834 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LTN1O94822 1766 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KCNQ2O43526 872 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXB-AS3-201ENST00000429755 USP47Q96K76 1375 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TXNRD1Q16881 649 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FYB1O15117 783 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXB-AS3-201ENST00000429755 AMPHP49418 695 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXB-AS3-201ENST00000429755 HOXC9P31274 260 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RTL1A6NKG5 1358 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXB-AS3-201ENST00000429755 STK32BQ9NY57 414 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SLC15A2Q16348 729 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
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HOXB-AS3-201ENST00000429755 NHSQ6T4R5 1651 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ACSBG1Q96GR2 724 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB-AS3-201ENST00000429755 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HOXB-AS3-201ENST00000429755 INSRP06213 1382 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FBLN1P23142 703 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CASZ1Q86V15 1759 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MTFR1LQ9H019 292 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KAT6BQ8WYB5 2073 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NBPF6Q5VWK0 638 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NBPF4Q96M43 638 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FLT4P35916 1363 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PTGER2P43116 358 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZBTB7AO95365 584 aa21.4■■□□□ 1.02
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